在航海途中，也曾經遇到過海蛇襲擊，其中一些曾撲到一艘有三層槳的戰船上，把船弄翻。許多古代和中世紀的航海著作中，都描述過船隻與大海蛇遭遇的情況。
近現代以來，隨著動物學的發展，人們已不再相信神話和傳說中的怪物。然而，有關大海蛇的報道仍時有發生。
1817年8月14日，許多人在美國馬薩諸塞州格洛斯特港一帶見到一條非常巨大的海蛇出現。新英格蘭林奈學會組織了特別委員會調查此事，錄取了看到大海蛇人的宣誓證詞。據證詞稱，大海蛇"頭像一個四加侖的桶那麼大，身體有琵琶桶那麼粗，身長至少四十英尺。"
在1845年，亞伯特·寇區（Albert Koch）得知在阿拉巴馬州發現的巨大骨頭，後來被拼成了一具完整的骨骼的故事。他後來拼湊出一具長114英呎的「大海蛇」骨骼，並且讓它在紐約與歐洲來公開展覽。這具所謂的「大海蛇」骨骼最後被發現其實是5具不同個體的骨骼所組成的，其中包括龍王鯨，這些骨骼最後毀於1871年的芝加哥大火。
這些有關大海蛇的報道，儘管可能有誇大不實的成份，但無論如何不可一概視為謊言。然而現代科學又告訴我們，海蛇類一般身長1—1.5米，最大 的也不過2米長。那麼航海者們遇到的"大海蛇"是一種什麼動物呢？
對此，生物學家們有三種不同的解釋：第一種觀點認為可能是巨型鰻魚。鰻魚是一種體形細長，看上去很像蛇 的魚類。一般鰻魚的幼魚長約5釐米，而長成後可長達2米。但有人捕到過長達半米的幼鰻，以此推測，估計這樣的幼鰻長成後，可能會是長達20米左 右的巨型鰻魚。 蛇頸龍(3)但人們至今尚未捕獲過一條這樣的巨型鰻魚。因此巨型鰻魚究竟是否存在，也仍然是個謎。
第二種觀點認為是巨型海藻。有些海藻可能長得很大，如巨型褐藻最長可達百米以上，是世界上最長的生物體之一。它在海里隨波浪起伏，使人看 上去認為是遇上了大海蛇。這種看法有一定的道理，但植物與動物，海藻與海蛇畢竟有著根本的區別。
如果說，令許多目擊者感到極端恐怖的大海蛇都 是海藻，恐怕還有待進一步證實。 第三種觀點認為是至今仍在海洋中生活的蛇頸龍。對好奇的人們來說，這種觀點最有吸引力，蛇頸龍的前半身看上去也確實很像蛇。但活的蛇頸龍是否存在，本身仍是個未知數。因此這種解釋也不能完全令人信服。
由於這些解釋都不能得出使人滿意的結論，因此大海蛇是否存在，如果 不存在，航海者們看到的又是什麼動物，這個問題的解答至今仍有待於人們的進一步探索。
同時許多學者現在也認為大家看到的大海蛇其實是皇帶魚，這種魚體型龐大，多生活在深海，一般體長3-5米，個別突出者能夠達到15米-18米（5-6層樓的高度）有水桶粗。皇帶魚在歷史上被人類發現了多次，也有具體的圖片為證。
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