独步寻春
这个不一定是按照注册资本计算的，自新公司法实施以后，除法律另有规定以外的公司注册资本采取认缴制度，而不是实缴。故而提问的题目当中也明确公司注册资本虽然是5000万元，但是实缴资本为零的情况下，股权的计算价值如果单纯的按照注册资本来计算显然不具有合理性。
实践当中关于股权转让价值计算有如下几种方法：
1.双方协商为准；
2.以公司注册资本为计算基数乘以转让的股权比例；
3.以第三方审计机构评估的公司价值乘以股权比例；
4.以公司净资产作为基数乘以转让股权比例；
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麋鹿说法
实缴资本为0的公司，进行股权转让，其转让对价的计算自然不是按照注册资本计算。
1、公司注册资本虽然5000万，但实缴资本为0。
举个栗子：
假设现在某股东甲转让10%的股权，其实缴为0，股权受让方为隔壁老王。
如果按照注册资本作为依据计算转让对价，5000*10%=500万，意味着受让方隔壁老王要支付500万的转让对价，同时，由于原股东甲并未实缴，因此，隔壁老王拿到这10%的股权后，还有履行出资10%即500万的义务，如此一来，老王实际上是花了1000万才得到了这10%的股份，对于他来说是绝对不公平的。
2、未完全实缴出资的公司的股权转让对价如何确定？
实务中有几种方法：
（1）按照公司的净资产计算确定
上述提问中，注册资本为0，但不一定公司的资产就完全为0。
实务中，也存在一些公司，虽然股东未出资，但不表示没有出钱，股东的投入以借款或其他方式流入了公司。同时公司如果有正常经营的话，也可能会产生一定的回报，这也会构成公司的资产。
因此，假设此时公司净资产（资产-负债）为1000万元，如果转让10%的股权，可以按照净资产标准设定转让价格为1000*10%=100万元。
（2）按照公司的评估价值确定
公司的净资产反映的往往是公司的过去，而没有考虑到公司的未来。
实务中，可以根据公司未来现金流量的情况设定一个折现率，计算评估出公司当前的价值，然后按照这个价值来确定股权转让的价格。
（3）协商确定定价
股权转让双方协商定价，应该是实务比较常见的一种方式，一般来说，股权转让双方意思表示一致即可达成协议，但前提是要符合一定的公平公正原则（防止利益输送）。
股权转让价格过低或者过高，都有可能被税务机关追责并进行纳税调整。
西天蜗牛
股权转让价格并不是以注册资本来计算的。
对于股权转让，主要涉及到三个方面的问题，股权转让价格的确定，相关的涉税问题和转让后所涉及到的债权债务。以下分别来进行探讨。
1. 股权转让价格的确定：
目前，股权转让价格的确定一般有几个常用的方法。
（1） 根据工商登记材料中所记载的股东持股状况出资数额。
受让的股东在转让方出资未到位的情况下，要看公司章程所约定的出资期限，如果出资期限已过，但老股东还是没有出资，这种情况应该要求老股东将出资实缴到位后再转让；如果约定的出资期限还没到，那么要与老股东协商确认该部分出资义务由谁来完成，并明确约定在股权转让协议中。
所以，没有实缴出资，要进行协商，而不是按照注册资本来确定转让价格。即使是已经实缴了资本，也可能出资额与公司当前的实际价值存在很大的差异，还要进行评估或者协商。
（2） 根据公司的净资产。
这个在实际的小股东转让股权时有用得挺多。公司的净资产一般包括初始投入的成本和后期经营中的留存收益。由于公司后期的经营中会产生盈亏，所以，与最初的投入资本也会有差异。
（3） 根据评估价值。
这是以审计、评估的价值来作为依据。需要对公司的会计账目、资产、负债进行清理，体现出较为准确的资产状况。再根据现在的资产状况，未来的盈利预测，通过价值评估模型，来判断企业的价值。但一般聘请外部机构需要一定的费用，小股东的股权转让可能不会用这个方法。
（4） 协商定价。
在协商的情况下，有可能出现双方信息不对称的情况。所以，在协商之前，要充分了解拟转让企业的情况。当然，协商的时候也不能故意做低价格，对于价格偏低，又没有合理理由的，最后税务要进行核定价格来纳税。
2. 转让中的税务问题。
转让中涉及到的税费主要是个人所得税和印花税。
个人所得税，按照转让所得的20%征收，转让所得=转让收入-股权原值和合理税费。
非上市公司股权转让的印花税为协议所载金额的万分之五。
3. 股权转让后所承担的债权债务。
在股权转让之前，要充分了解所承接的债务问题。也不能在转让协议中约定这些债务归原股东，因为你们之间的约定，对债权人无效，债权人来找新股东追债，新股东也只能先偿还，再去找老股东追索。
所以，搞清楚股权转让的问题，才能合理确定价格，合规纳税和避免陷阱。
以上财会小童观点，欢迎评论补充。
财会小童
是的，股权转让是按照营业执照上写的注册资本转让的！
1.假如你公司新加入股东，是以公司注册资本5000万转让2500万给新股权，双方应按照2500万*万分之五的印花税进行交纳！
2.假如你是将公司全部股权转让给受让方，此时也是以公司注册资本5000万来全部转上的，那么双方交印花税应该是5000万*万分之五来交纳！
所以说，公司股权变更或转让都是按照营业执照上的注册资本进行的！
南昌慧盈财务
你决定转让多少股份与你实缴出资与否没关系。你转让多少股份那是你们双方的协商，只是你如果未实缴出资，受让方肯定给的价格低，甚至你的公司刚成立，没有任何营收，那么股权转让款肯定更低，甚至只是象征性的收点，因为你可能是带着让受让方实缴出资充实公司注册资本的目的去转让股权的。
如有其他疑问可以私信我，可提供合同代写及股权转让咨询。
法逗
转让股权以双方协议价，计税时转让者成本以实际投入的原始成本，收入以评估价、净资产和协议价中高者为计税收入。
税务管家
各地政策不一样，我在南京，不同的区政策都不一样，亲身经历，百思不得其解
迟之以衡
应该按照净资产计算。如果实缴资本为零，这是违法的，应该令其补齐。
萨摩大奔jacksonzhang
这就有点明白，认真了解才有出路
