1985年，乌干达政府派出了一队医生，调查靠近坦桑尼亚边境附近的一个渔村里面的神秘疾病，在过去的4年时间里，这里已经有上百人无故消瘦、死亡，因此被当地人称为消瘦病。关于这个所谓的消瘦疾病的来源有很多种说法，有些人说是巫术的结果，有的人说这是神的惩罚；还有人说是当年坦桑尼亚派兵攻打阿明的时候，大炮释放出来的病毒导致的等等。
通过对这个地区的人口进行检查，使得乌干达的医生们有了结论：这种消瘦病是几年前世界才发现的一种疾病，全称叫做获得性免疫缺陷综合症（简称为AIDS），中文名叫做艾滋病。随后，乌干达的医生们对这个地区的人口进行了普查，发现已经有很大比例的人口身上携带了会导致艾滋病的人体免疫缺陷病毒HIV，这个地方和邻近的坦桑尼亚一起，似乎已经成了传播艾滋病的中心地带。
这个时候，人们对艾滋病这个新疾病知之甚少。1982年，美国开始有研究认为艾滋病的传播的途径为性行为，当时在美国有人将这个疾病的名字叫做男同性恋相关的免疫缺陷(简称为GRID)。不过随后有关机构很快发现有一半患有艾滋病的人口和同性恋没什么关系，于是才决定 于1982年8月将其改名为性免疫缺陷综合症。
通过相关专家的调查，认为艾滋病很可能是从分布在非洲中西部的一种大猩猩传到人上面的。因为在像大猩猩这种和人类非常相似的动物身上，发现过与HIV-1型病毒非常相似的病毒，这个说法现在基本上得到的公认。至于艾滋病是通过什么方式传到人身上的，就有很多争议了，目前普遍认可的说法，是大约在20世纪初期，在刚果雨林一些猎人的血和受感染的大猩猩的血有了接触而感染上的，当然也有一部分认为是通过有兽交感染上的。
最早在欧洲和美国的研究发现，艾滋病基本上在同性恋人群和吸毒者中传播，而非洲的情况显然不同，至少在非洲，同性恋和吸毒、输血不是艾滋病传播的主要原因。在1984年的时候，艾滋病就已经随着坦桑尼亚军队抵达了乌干达首都坎帕拉，货车司机和妓女是其主要传播者。两年后，在卢旺达和布隆迪等国的妓女已经有超过三分之二的妓女都已经携带HIV病毒。1989年乌干达的一份官方调查显示，乌干达的HIV携带者已经达到80万人之多，艾滋病在乌干达已经非常严重。卢旺达于1986年开始调查艾滋病问题，发现城市人口的接近20%，农村人口的1%已经携带
HIV,这个总人口数字还包括了老人和儿童，因此成年人口里面的比例更加惊人。大约从乌干达、卢旺达、扎伊尔东部开始，艾滋病通过移民、战争等等途径四处传播，并迅速遍及黑非洲，这个地区传播的是HIV-1型病毒。1990年世界卫生组织的报告显示，乌干达感染HIV-1的人口超过20%，肯尼亚大约为16%，扎伊尔约为13%，马拉维约为13%，坦桑尼亚约为11%，布隆迪约为5%，赞比亚约为5%，卢旺达约为4%，刚果布约为3%，津巴布韦3%等等。
现在人们都知道了，艾滋病给已经多灾多难的非洲带来了非常严重的问题。艾滋病的患病人群基本上都是15岁到50岁的人口，这是社会上最能够创造价值的群体。一般地，大约有一半的人在25岁之前就患上艾滋病，在35岁之前去世，给社会带来巨大的劳动力损失，特别是熟练工的损失。家庭里面主要劳动力的去世，也给社会带来了太多的问题，孤儿数量大幅度增加，给社会带来了沉重的负担。更可怕的是，艾滋病还可以通过母婴传播，这就带来了大量的艾滋病孤儿，这些艾滋病患儿大多数活不到入学年龄。
可是在艾滋病传播的早期，非洲极少有领导人意识到这种疾病的严重性，还有些非洲领导人拒绝承认这个疾病，认为是西方人愚弄非洲人编造出来的故事。一些国家为了维护所谓的声誉，担心会影响旅游业，拒绝公布相关数字。在非洲大部分国家，几乎见不到任何有关艾滋病危害的相关宣传，而错误的宣传确却比比皆是，比如在坦桑尼亚，艾滋病被称为“杀了我也不放弃年轻女郎”；在扎伊尔，艾滋病则被说成了”阻碍爱人的想象综合症”。
在艾滋病被发现之初就认真对待的非洲国家只有两个：乌干达和塞内加尔。1986年，乌干达的穆萨文尼上台之后，开始公开宣讲艾滋病的危害，唤起人们重视，要求人们小心对待。穆萨文尼要求各级政府重视这个问题，建立了全国的艾滋病控制计划。穆萨文尼还在全国推动了预防艾滋的宣传，宣讲ABC or D：节欲（Abstain），忠诚（Be Faithful），避孕套（Condoms），否则就死亡（Death）。不过由于乌干达政府缺乏资金，人均医疗费用仅有每年60美分，于是穆萨文尼就像国际上的各种组织请求援助。在众多国际援助下，乌干达开始对人群定期进行血液检查。到了2000年，乌干达的HIV携带者已经从最高时期的21%降到了6%。
但是大多数非洲国家直到九十年代都对此无动于衷，由于艾滋病从感染病毒到发病的潜伏期很长，很多国家对此根本不予重视。等到艾滋病已经成了大多数非洲国家的主要问题，对社会的影响逐渐显现出来，这些国家才开始重视艾滋病的问题。尽管如此，在南非2008年下台的前总统姆贝基在九年执政期间，仍然认定，是贫穷，而不是
HIV，导致了艾滋病。閱讀更多 歷史與我們同在 的文章
