阿合馬被刺身亡後，真金就想借這個機會大力推行儒家的施政理念。這讓忽必烈很不高興，於是他改組了中書省，什麼事也不與真金商量，真金的政治抱負又一次竹籃子打水一場空，而接下來發生的一件事，間接導致了他的死亡。 1285年，江南的一個封疆大吏上密奏說：“皇上年紀大了，應該禪位，把國家交給太子真金來打理，皇后也不得干預。”
真金得知後，非常的恐懼和害怕，心想：這幫人真是成事不足敗事有餘，現在上這個奏章，不是把我往火堆裡趕嗎？萬幸的是，傾向於太子的一個大臣，知道這件事的分量，把這個密奏給藏了起來。 後來阿合馬的餘黨得知了這個消息，他們覺得反攻倒算的機會來了，於是對忽必烈建議說：“陛下，國家的各項收入，從地方到中央的各級政府都存在隱瞞和欺騙的問題，請您下旨把所有的文案、奏章都搜出來，審查一遍。”阿合馬餘黨的意圖很明顯，就是要用這個方法把那份密奏給抖出來。忽必烈答應了這個請求。 得到這個消息後，太子黨的人準備先下手為強。其中兩位重量級的成員馬上進宮跟忽必烈說：“陛下，阿合馬雖然已經死了，但他的餘黨陰魂不散，繼續專橫跋扈、胡作非為，極力打擊那些正直的大臣。請陛下一定要將這夥人一網打盡，以免留下後患。”
忽必烈一聽，知道這都是在為太子說話，於是他大聲斥責說：“他們有罪，難道你們就那麼幹淨？” 忽必烈雖然發飆了，但兩位大臣一點兒也不畏懼。他們朗聲回答：“臣等是有罪，但那都是為了陛下的天下！他們這幫小人如果繼續作惡，請問陛下，大元的天下能安定嗎？”聽他們這麼一說，忽必烈馬上蔫了下來，心想：別說，這些二愣子，阿合馬那幫人還真沒法比。於是答應他們的請求。 阿合馬的餘黨見事情不妙，就聚集同黨中人集會鬧事，以作最後一搏。
這次忽必烈比較果斷，立即派兵滅了阿合馬的餘黨。 太子真金雖然有驚無險地躲過了這次災難，但這件事還是給他造成了沉重的心理負擔，由於憂慮過度，沒捱過年，就遺憾地離開了人世。
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