據說迄今為止最早記錄日本歷史和神話的書籍是日本人在公元6世紀前期著成的，當時有口語無文字的日本人已經學會使用中國的漢字將天皇家的系譜、大事等記為《帝紀》， 又將眾神神話傳說故事記為《舊辭》。不過這兩本書原版早就失傳，後世的傳抄本錯誤百出、真偽難辨。為了理清自己的祖宗，據稱是第40代天皇的天武天皇蒐集材料、在《帝紀》《舊辭》的基礎上，分別在公元712年和720年編撰出了《古事記》和《日本書紀》兩本書。按照嚴謹的歷史學觀念，這兩本書才是日本現存最古老的史書。
《古事記》是天武天皇的近臣稗田阿禮用日本語記述的傳說故事，只有三卷，從體例上來講應屬於民族敘事詩，為的是渲染天皇血統的神聖和統治權的正當性，真實度可信度較低，但是具有很高的歷史價值。
而《日本書紀》則有三十卷，是天皇官方用漢語仿效中國史書的體裁記錄的從神代開國到第41代持統天皇的日本國家歷史。和《古事記》相比，《日本書紀》由官方對歷史進行了很大的修飾，為了填滿歷史的空白，偽造了早期很多天皇的譜系、年齡、生活的時代，以至於很多天皇的年齡長的令人難以置信。不過就是這些連日本人自己私下裡都不相信的東西卻被當做真正的歷史在學校裡教授，直到1945年人佔領日本，天皇走下神壇變成了人。
既然從神話時代就肇造日本的天皇是人不是神，而日本史書又無法解釋天皇的世系淵源，那日本天皇到底是咋來的呢？其實無論是從地理學、考古學、還是人類學來說，日本人的天皇都應該與來自中國大陸北方的遊牧民族有關。
自從日本列島被上升的海水割斷了與亞洲大陸的陸路聯繫，雖然間或有大陸人登島帶來先進的文明，但是日本眾多的部落上還是處於原始的母系氏族社會，中國的史書稱之為“倭國”，其中最強的一支部落在九州，首領被稱為“天照大神”。直到公元四世紀左右有一支遊牧民族騎兵征服了朝鮮半島後又涉海登陸，征服了原始的日本列島，掀開了日本文明的新開端，也開始了日本神話時代。
這支神勇的遊牧騎兵在日本早期神話中留下了特殊、深刻的烙印，他們被日本土人稱為至天而降的“天神”，他們的後裔被稱為“天神族”或是“天孫族”，也就是天神的子孫。不過或許是為了虛偽的民族榮譽感、以及為了攀比中國大陸悠久的歷史，和《古事記》《日本書紀》中所記述不同的是，最早率族人征服列島、開創日本國的不是日本人所謂的天皇譜系中名列第一的神武天皇，而應該是名列第十的崇神天皇。換句話說日本人虛構了第一代到第九代的天皇。
崇神天皇統帥族人登陸九州來到“天照大神”的部落時，天照大神也正在被山區的熊襲部落壓迫，天照大神於是選擇嫁給了更強大的“天神族”的首領崇神天皇。崇神天皇與天照大神子孫們經過混血繁衍不斷擴張，到了天皇譜系中第十五代應神天皇的時代，經過東征統一了九州和本州、建立了統一強大的邪馬臺國，這就是日本天神皇國的開端。
為了對應天神族的東征和天神皇國的建立這一劃時代的事業，虛榮的天神族的後代-天皇譜系中第40代的天武天皇於是憑空編造的一位神勇完美的天皇來對應應神天皇的功勳，並根據中國傳統的讖緯學說臆造了登基年代為公元前660年，這就是目前天皇譜系中排名第一位的神武天皇，而公元前660年也就成了日本皇國紀元的元年（當然現在已經很少有人還相信神武天皇的存在了）。
綜上所述，其實日本史書中的歷史只有到了第十五代應神天皇時才由神話轉入歷史現實，而天皇的祖先只不過就是公元四世紀從中國大陸遷徙來的遊牧民族罷了，至於第一代的天皇只能是天皇譜系排名第十的崇神天皇。
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