新的篩選方法揭示了microRNA在乳頭瘤病毒生命周期中的重要性

新的篩選方法揭示了microRNA在乳頭瘤病毒生命週期中的重要性

根據7月26日發表於開放獲取期刊PLOS Pathogens的一項研究,乳頭瘤病毒編碼的microRNA的發現支持了這些小分子在持續感染中的重要作用。研究作者德克薩斯大學奧斯汀分校的Rachel Chirayil及其同事利用一種新方法對這一發現進行了研究,該方法能夠對具有基因組數據但無法在實驗室環境中培養的大量病原體進行microRNA鑑定。

乳頭瘤病毒可以在人類中引起幾種類型的癌症,但仍然不清楚為什麼只有一些感染導致惡性腫瘤的發展。為了回答這個問題,有必要更好地表徵乳頭瘤病毒基因產物及其在這些病原體生命週期中的作用。微小RNA是調節多種生物過程的小RNA,包括宿主 - 病原體相互作用。因此,microRNA通常由經歷長期持續感染的病毒編碼。但到目前為止,還沒有發現廣泛接受的乳頭瘤病毒編碼的microRNA,部分原因是由於缺乏合適的實驗室模型。

為克服這一障礙,研究人員開發了一種新的溼法技術,稱為microRNA Discovery,通過強制基因組表達(miDGE)。這種廣泛適用的方法可以並行篩選多種病原體基因組,從缺乏實驗室培養系統的生物體中鑑定microRNA。使用miDGE,他們篩選了超過73種不同的乳頭瘤病毒基因組,以編碼microRNA。

大多數乳頭狀瘤病毒似乎不代表microRNAs,但研究人員發現了五種新的極有可能的乳頭瘤病毒編碼的microRNAs。儘管乳頭瘤病毒microRNA不在與高風險感染相關的癌症中表達,但它們中的一些可控制病毒基因表達。這組作者說,這些發現表明microRNAs是乳頭瘤病毒生命週期的重要調節因子。

“這項工作最重要的方面是這項新技術在一次實驗中開闢了對眾多病原體的平行研究,”研究人員Christopher Sullivan補充道,“允許進行深入的進化交叉比較。在這裡,鳥類病毒的洞察力幫助我們理解為什麼有些人類乳頭狀瘤病毒會發生這種情況,同樣重要的是,為什麼大多數人不會編碼自己的microRNAs。“

期刊參考

  1. Rachel Chirayil,Rodney P. Kincaid,Christine Dahlke,Chad V. Kuny,NicoleDälken,Michael Spohn,Becki Lawson,Adam Grundhoff,Christopher S. Sullivan。在發散的乳頭狀瘤病毒中鑑定病毒編碼的微小RNA。PLOS病原體,2018年; 14(7):e1007156 DOI:10.1371 / journal.ppat.1007156

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