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黑番茄是颜色发暗发黑的番茄。在国外，还有“蓝番茄”“紫番茄”，在中文里一般也都叫做“黑番茄”。
黑番茄的品种很多，可以分为三种情况：
第一种，是普通番茄发生了基因突变，导致青番茄成熟时叶绿素不能正常降解，会造成脱镁叶绿色累积。脱镁叶绿素和类胡萝卜素混合在一起，就呈现有暗黑的颜色。下面是一个这类“黑番茄”品种，其实并不算很黑。
第二种是经过人为选育杂交，使得番茄中具有表达花青素的基因。跟前一种“黑”不同，这种黑番茄的“黑”来自于花青素。下面是美国俄勒冈大学培育的一个品种。
这个品种的番茄在阳光照射的地方会完全变黑，如果被遮住了光，也会保持红色。而且，它只是表皮和接近表皮的果肉是黑色的，就像下面这张照片。
第三种是经过转基因操作，转入了高效表达花青素的基因。其花青素含量很高，能达到第二种黑番茄的10倍以上。而且，它不仅表皮变黑，整个果肉也都是黑的。
（转基因黑番茄和普通番茄的对比）
中国市场上出现的黑番茄一般是第二种类型。
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