总兵府是明清时代的称呼，是南澳总兵的衙署，位于南澳岛深澳镇大衙口。
最初建于明朝万历四年（1576年），是当时的南澳副总兵晏继芳建造的。
万历九年，副总兵侯继高增建总兵府的后楼，成为一个完整的总兵衙署。
明清两朝，到南澳上任的总兵副总兵共有157任147人。
由于南澳岛地处东南沿海要冲，介于粤东与闽南之间，是军事要地，封建统治者怕这里拥兵自重，所以一个小小海岛竟划分由广东和福建共管。
中间由雄镇关做为分界线。
明清时海禁很严，朝廷限制愈厉害，民间走私活动愈猖獗。
加上外有倭寇的侵扰，内有海盗盘踞，朝廷派驻的士兵越来越多，南澳的规格也逐步升级，最后成为管制闽粤台的重要军事基地。
总兵府前现遗存有八千斤，六千斤土炮各一尊。
据炮上铭文，是清代道光二十年（1840年）铸造，两尊炮原分别架设于深澳草寮尾和深澳东门外。
总兵府前的两棵大榕树，据说已有410年的树龄，其中一棵树围达14米，枝叶繁茂，生机旺盛。
据说明朝末年郑成功曾在树下讲演，招兵去收复台湾。所以这树后人又称“招兵树”。
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