人類體內的細胞存在數百萬個複雜的非線性基因相互作用網絡。近期的臨床研究發現，從癌症到神經衰弱等多個致命型疾病，都是由於多種基因和通路的功能障礙導致的。
針對這一難題， Engine Biosciences公司（簡稱：Engine）開發了一個利用人工智能技術的生物醫學平臺，使研究人員和藥物開發人員能夠比傳統方法更快、更有效地揭示疾病背後的基因相互作用機理和生物網絡，測試專門針對這些相互作用的療法，並對精準醫學應用進行分析和預測。該公司致力於改善藥物發現，率先開展生物網絡實驗，從而使更多患者從中受益。
據動脈網瞭解，Engine作為一家新興生物科技初創企業，成立於2015年，其核心團隊來自美國和新加坡。
2018年1月，該公司宣佈已經順利完成一輪1000萬美元的種子輪融資，成為東南亞地區有史以來規模最大的種子輪融資之一。本輪融資由通和毓承和丹華資本共同領投。參投方包括全球領先生物製藥行業藥明康德、EDBi、蘭亭投資、百度風投、美國中經合集團和Nest.Bio Ventures。
這項融資將為Engine的多項核心工作提供支持，包括搭建藥物發現平臺，拓展科研及執行團隊，開展公司內部研究以及與合作伙伴創立臨床實驗。目前公司的合作伙伴包括多家領先的臨床研究機構和一家美國財富500強的公司。
傳統的藥物發現在測試和判斷與複雜疾病相關的大量基因相互作用中不但進程緩慢，且代價昂貴，而Engine的平臺給這些研究的效率和規模帶來了數量級的提升。
通過理解和測試基因之間的相互作用，同時使用機器學習和深度學習算法來分析產生的數據，Engine的平臺有能力破譯迄今為止一直困擾藥物開發者和研究者的複雜生物網絡，從而使藥物研發過程具有邏輯化。
“生物製藥行業需要更好的研發方法，能夠更快地為有需要的患者開發出治療方案。在很多傳統的藥物研發場景中，我們對於疾病的致病原理及其相應的治療和預防了解甚少，”Engine的聯合創始人兼首席執行官Jeffery Lu提到：“Engine的平臺使研究人員不僅能夠發現疾病基因間的相互作用，並且能夠以一種前所未有的快速、經濟和精準的方式來測試針對這些相互作用的治療方法。”
商業與學術的結合推動公司發展
Engine的聯合創始兼CEO Jeffrey Lu在過去十年裡擁有豐富的商業和企業家經驗。他曾在技術驅動創業公司和價值數十億美元的公司中擔任過企業級管理職位，引領團隊開展數據分析，規劃戰略，以創造高效績業務為最終目標。
Lu曾在賓夕法尼亞大學獲最佳學士學位。畢業之後，Lu在Bain & Company開始了他的第一份工作。
據動脈網瞭解，Bain & Company作為世界頂尖的商業諮詢公司之一，致力於與高級管理人員合作，針對企業文化製作決策，並將想法付之於行動。工作期間，Lu逐漸培養了公司專屬的深層數據見解及策略，他堅信數據的開發，學習和運用是變革企業的關鍵。
在亞洲航空（AirAsia）和全球在線旅遊公司AAE Travel的工作期間，Lu的首要任務是建立和管理數據分析團隊。同時，他向各個組織介紹並解析了由數據驅動決策的不同案例，專注於利用大數據研究來達成企業數百萬美元的收入和利潤增長。
多年在航空公司和旅遊產業的工作經驗使Lu創立了Think Digital Sdn Bhd，並擔任其董事長。作為一家位於馬蘭西亞八打靈再也的私人公司，Think Digital Sdn Bhd主要負責經營低成本航空企業。
此外，Lu也曾在投資公司Goodman Capital擔任過聯合創始人兼總經理。該公司已投資過十多家位於亞洲和美國的生物科技公司。
Timothy Lu作為Engine的聯合創始人、董事長兼科學諮詢委員會聯合主席，曾在哈佛醫學院和麻省理工學院完成了博士和研究生的相關學習。
T.Lu開發了Engine技術平臺的關鍵元素，並在合成系統生物學，基因相互作用映射以及計算機科學/工程方面擁有豐富的專業知識。同時，他也是麻省理工學院副教授，麻省理工學院RLE合成生物學小組的負責人以及麻省理工學院和哈佛大學的重要會員。
T.Lu作為應用合成生物學提供醫療和工業解決方案的先驅，曾獲得過眾多獎項。其中包括NIH新興創新獎，美國總統早期科學家和工程師職業獎，NSF職業獎以及埃裡森醫學基金會老齡新學者獎。
除了在學術和研究方面做出的貢獻，T.Lu在商業領域中也小有作為。他曾在個人研究的基礎上創立過多家公司，其中包括Sample6 Inc.和Synlogic Inc.。
這兩家美國風險投資公司通過合成生物學分別開發了用於食品安全和人類微生物群系的下一代診斷療法。T.Lu已從多輪融資中為公司籌集了超過1.6億美元的資金。
Engine的關鍵方法有哪些？
目前，Engine尚未開發任何產品。其公司的主要目標是加速藥物發現，解決醫療保健問題，開發網絡生物醫學平臺以及建立世界級專業團隊。
為了解決傳統制藥所面臨的一系列問題，Engine重點圍繞以下三個問題進行了假設，思考解決方案，以實現公司目標為核心：
1. 傳統藥物的開發週期受到複雜生物學影響和 “一對一”實驗進行的侷限，導致研發時間長、失敗率高。如何將“一對一”實驗方式改變為“一次全部”實驗方式，以完成大規模平行實驗為目的？
2. 如果Engine能掌握基因在特定生物環境（比如：疾病）中相互作用的有關數據集，那麼精準製藥能否會實現？
3. 如果Engine可以使用這些數據集來構建細胞圖，那麼這一方法是否可作為藥物發現的預測引擎？
針對這三個問題，Engine開發的網絡生物醫學平臺從不同角度對其做出了跟進和解答：
1. 速度：公司專有的科技和專利技術為研發過程帶來了高速，可擴展和成本的優勢。
2. 技術：在破譯生物網絡期間，高通量生物實驗技術的應用將指數型縮放問題化為線型縮放問題
3. 工具：公司專有數據的生成模式結合AI方法使藥物發現和醫學構建完成更有效的預測和落實。
4. 科技：公司的前沿科技可應用於多種細胞類型和疾病相關跡象，這意味著Engine有能力擴大影響力，拯救全球數百萬患者的生命。
Engine受到包括百度風投、藥明康德在內的多家資本青睞，其技術已應用於四個領域：
一、藥物重新定位，即探究已知藥物的新適應症；
二、新靶點開發，即識別引起疾病的生物學因素；
三、根據病人特有基因組成來提供獨特治療方案的精準醫療；
四、生物學通路分析。
Engine與競爭對手的比較
1、Engine與Sangamo BioSciences的比較
作為Engine的最大競爭對手之一，Sangamo BioSciences總部位於美國加利福尼亞州里士滿，成立於1995年。Sangamo BioSciences在基因製藥，臨床科學和產品開發等領域中擁有豐富的經驗。
Sangamo BioSciences研發的體內基因編輯方法，以SB-FIX為產品所展示。SB-FIX是治療血友病B的單一療法，能夠通過基因重組使患者穩定並持續表現出凝血分子IX。
Sangamo公司研發的鋅指磷酸酶（ZFN）介導基因編輯技術能夠利用白蛋白基因（白蛋白是肝臟特點的“安全位點”）對目標基因進行改造。被鋅指磷酸酶（ZFN）編輯之後，目標基因被轉換成蛋白質，從而進行了有效治療。採用這一方法，患者的肝臟能夠持續表現出凝血因子IX，達到治療目的。
Engine與Sangamo BioSciences相比，成立時間短，工作團隊小，產品在臨床試驗方面也尚未成熟。Engine旨在解讀生物網絡的複雜性，跟據病人特有的基因組成來提供獨特的治療方案，致力於解讀數據，實現精準醫療。
然而，Sangamo公司主要是通過研究、學習和編輯基因的方式扼殺疾病因子，幫助患者恢復健康。Engine完成的鉅額融資將幫助公司進行更深層的基因研發和數據探索，以實現高效的科技製藥為目標。
2、Engine與Recombinetics的比較
Recombinetics位於美國明尼蘇達州，是一家將基因編輯技術應用於農業，臨床研究以及人造器官領域的頂尖基因編輯公司。通過運用該公司的專利技術TALENs，Recombinetics已實現了多物種的基因編輯。
比如，在愛荷華州的一個農場內，農民會割掉牛角以防止受傷。Recombinetics對農場內的兩頭犢牛進行了基因編輯，使它們不長出牛角。這也意味著牛也不用忍受割牛角的痛苦過程。
“這就像基因組中的查找、替換功能，”Recombinetics的首席執行官Scott Fahrenkrug表示。“這讓我們能夠找到物種中存在的天然變異，並迅速採取應用。”
Engine與Recombinetics相比，目標不同，受眾群體不一樣。Engine主要研發優質新藥，為重大疾病和生命科學做出貢獻其中包括癌症、神經退行性疾病、自身免疫疾病和皮膚病等。
文|晏語
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