夏、商兩代，屬於揚州西境，幹越。
周代，屬吳、越、楚。
秦始皇二十六年（前221年），始置廬陵縣，屬九江郡（郡治在今安徽六安市壽春縣城關鎮）。
西漢高祖元年（前206年），秦亡，楚、漢爭霸時，英布為九江王，廬陵縣屬九江王國。漢高祖五年（前202年），潁陰侯灌嬰渡江平定楚地後，析九江郡地，設立豫章郡（郡治在今南昌），郡領18縣，廬陵縣屬豫章郡。
新始建國元年（9年），改豫章郡為九江郡（郡治仍在今南昌），改廬陵縣為桓亭縣。
東漢建武元年（25年），桓亭縣複名廬陵縣。
東漢初平二年（191年），析豫章郡地始設廬陵郡，廬陵縣改名西昌縣，縣屬廬陵郡（郡、縣同治）。
東漢興平元年（194年），孫策分豫章郡置廬陵郡，郡治在今泰和縣城西北15千米處，轄西昌、高昌、石陽、巴丘、南野、東昌、新興、吉陽、興平、舊城10縣。建安四年（199年），郡治遷西昌縣治（今泰和縣城西1.5千米）。
西晉元康元年（291年），廬陵郡治遷石陽城（今吉水縣城東北8千米處）。
東晉鹹康八年（342年），太守孔倫遷建郡城於今吉安市區孔家灣附近。
隋開皇十年（590年），廬陵郡改為吉州，遷建州城於今吉安市區趙公塘一帶。大業三年（607年），吉州復改為廬陵郡，統廬陵、泰和、安復、新淦4縣。
唐武德五年（622年），再改廬陵郡為吉州，領廬陵、太和、安福、新淦、永新5縣。永淳元年（682年），遷建州城於今吉安市區北門街道轄區內。天寶元年（742年），改吉州為廬陵郡；乾元元年（758年），復改廬陵為吉州。
宋開寶八年（975年），置吉州廬陵郡軍事。南宋紹興年間（1131年—1162年），吉州廬陵郡領廬陵、吉水、安福、太和、龍泉、永新、永豐、萬安8縣。
元至元十四年（1277年），廢吉州軍事，置吉州路總管府，領廬陵等8縣；元貞元年（1295年），改吉州路為吉安市路，轄吉水、安福、太和、永新四州、五縣，取吉水、安福兩州各一字命名為吉安市路，寓“吉泰民安”之意，“吉安市”之名自此始。至順年間（1330年—1333年），析永新地設永寧縣。
明太祖壬寅年（1362年），廢吉安市路，置吉安市府，領廬陵、太和、吉水、永豐、安福、龍泉、萬安、永新、永寧9縣；二年（1369年），太和改為泰和，吉安市府領廬陵、泰和、吉水、永豐、安福、龍泉、萬安、永新、永寧9縣。清初沿明制，乾隆八年（1743年），析永新、安福地置蓮花廳，吉安市府轄9縣1廳，直到清末。
民國元年（1912年），廢吉安市府，蓮花改廳為縣，各縣直屬江西省；民國三年（1914年），置廬陵道於宜春，龍泉、永寧、廬陵三縣分別改名為遂川、寧岡、吉安市縣，廬陵道共轄贛西萍鄉、宜春、分宜、新喻、清江、萬載、宜豐、上高、高安、蓮花、安福、永豐、寧岡、永新、泰和、萬安、吉安市、吉水、遂川、峽江、新淦21縣；民國五年（1916年），廬陵道遷至吉安市；民國十五年（1926年），廢廬陵道，各縣直屬江西省；民國二十一年（1932年），置第九行政區公署于吉安市，轄永豐、萬安、吉水、泰和、峽江、吉安市6縣；民國二十八年（1939年），改第九行政區為第三行政區，設行政督察專員公署于吉安市，轄永豐、安福、萬安、吉水、泰和、峽江、吉安市、寧岡、遂川、蓮花、永新11縣。
民國三十八年（1949年）6月30日，成立吉安市分區行政督察專員公署；7月28日，析吉安市縣石陽鎮及近郊建吉安市；9月，吉安市分區改為吉安市專區，轄1市11縣。
1952年，南昌專區的新淦縣劃入吉安市專區。1953年元月，吉安市改為吉安市鎮；12月16日，複名吉安市。1954年，吉安市改為省直轄。1957年，新淦改為新幹。1958年，吉安市劃為吉安市專署領導。1959年1月1日，撤寧岡縣併入永新縣；7月1日，寧岡縣從永新縣析出，以寧岡縣原行政區域（劃出潮江公社對換永新的拿山公社）為主，加上遂川縣的井岡山鄉，成立井岡山管理局，歸省直轄；11月17日，省人民委員會決定，並於1960年1月7日經國務院批准，恢復寧岡縣建置，與井岡山管理局合署辦公；
1961年12月6日，寧岡縣與井岡山管理局分治，寧岡縣屬吉安市專區；1968年5月，改吉安市專區為井岡山地區，井岡山管理局改稱“井岡山革命委員會”並劃歸井岡山地區管轄；1978年，恢復省轄管理局；1979年，井岡山地區改名為吉安市地區；
1981年10月，設立井岡山縣，隸屬吉安市行署；1982年12月，建立井岡山市。
1992年，蓮花縣劃入萍鄉市。2000年5月11日，經國務院批准，撤銷吉安市地區，成立地級吉安市，同時撤銷寧岡縣併入井岡山市；8月18日，正式掛牌成立吉安市人民政府。同時，撤縣級吉安市，成立吉州區和青原區。並將寧岡縣與井岡山市合併，組建新的縣級井岡山市，直隸江西省，吉安市代管。
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