一晃十幾年過去了，鳴人佐助成長為世界頂級的忍者，隨著二人的終極一戰，終是落下大結局的帷幕。又一晃半個十年過去了，火影完結了五六年了。
火影這個故事嚴格的說是一部歷代家族鬥爭史。而輝夜就是這個家族的老祖。
輝夜是外星人，被族人不知用什麼手段和神樹一起送到地球。輝夜的任務就是利用地球和地球人的能量供養神樹，使神樹長大。神樹的果子有著神奇的能量，吃掉它的人可以有神奇的力量。輝夜和地球的一個國王好上了，並且懷有了身孕，然而有超能力的她被視為妖怪遭人追殺，甚至連丈夫都背叛了她。無奈之下，輝夜吃下神樹的果實，毀滅並重置了世界。
輝夜
一些年後，輝夜的雙胞胎兒子長大成人，並且學會了自己的能力。輝夜知道族人不會放過自己，所以讓人類供養神樹，製造白絕作為武器，以備戰將來入侵的族人。可是這件事被兩個兒子知道，兩個兒子把自己封印起來，但是第三個兒子黑絕逃了出來。
故事從輝夜流轉到兩個兒子身上。大兒子能力較強，基本繼承了輝夜的九成能力，所以被留在地球照顧和繁衍人類。二兒子則居住在封印母親的星球——月球上。
大兒子名叫大筒木羽衣也有兩個兒子，大兒子因陀羅，二兒子阿修羅。兩個兒子因為繼承權以及黑絕的挑撥成為了宿敵。由於羽衣的偏心大兒因陀羅子敗了，但是因陀羅和阿修羅的戰爭沒有結束。
因陀羅大戰阿修羅
多年後，因陀羅轉生宇智波斑，阿修羅轉生千手柱間。斑和柱間為了和平創立了木葉忍者村。但是斑也受到了黑絕的挑撥，認為人類不能互相坦白信任，戰爭依舊會繼續，所以決定暴力統治世界。斑和柱間戰鬥了起來，斑輸了，可是斑並沒有死，反而得到了柱間的能力，準備開啟月之眼計劃。收集尾獸，等自己開輪迴眼，用無限月讀統治世界。但是斑開啟輪迴眼時，壽命不多，需要有人幫他實現計劃，便選擇了帶土。
斑大戰柱間
斑的假死告一段落，我們講一下木葉發展史。柱間在和斑戰鬥結束之後沒幾年便死了，將自己的火影之位傳給二代。
二代火影名叫千手扉間，實力強勁，可惜被金角銀角開掛拼死。二代火影有三個徒弟，分別是袁飛日斬，宇智波鏡，志村團藏，臨死前將火影之位傳給日斬。
日斬和團藏一明一暗統治了木葉。日斬有徒弟木葉三忍，分別是大蛇丸，自來也，綱手。由於三代火影能力不足，傳位於徒孫，自來也的徒弟波風水門。
自來也有徒弟波風水門，長門，彌彥，小南。長門，彌彥，小南創立曉組織，希望能夠引領世界和平。
曉
波風水門有徒弟，卡卡西，帶土，琳。波風水門繼位火影還沒兩年，被劇情殺。
四代火影徒弟琳的死刺激了徒弟帶土，帶土被臨死的斑古惑黑化，成為月之眼計劃的第二個實施者。
期間團藏勾結山椒魚半藏害死彌彥，長門黑化，聽從帶土的蠱惑，曉變成了恐怖組織。
帶土控制九尾襲擊木葉，波風水門夫婦雙雙慘死，但是為孩子鳴人保住了性命，並把九尾封印鳴人體內，作為將來的底牌。
四代慘死劇情殺後，三代重新執政，五年之間三代火影和團藏用陰謀論借刀殺人害死宇智波一族，而兇手是宇智波鼬。鼬有一個弟弟佐助，倖存了下來。
鼬滅族
又過了六年，佐助和鳴人還有櫻拜師卡卡西。四人在一段段經歷中建立了深厚的感情。
三代火影的徒弟大蛇丸有一眾徒弟，主要徒弟有兜，後收佐助為徒。大蛇丸入侵木葉，幹掉了三代火影。三代火影死後，徒弟綱手繼位五代火影。同時大蛇丸的強大力量深深吸引了渴望力量的佐助。
鼬來到村子把弟弟佐助按在地上摩擦，再一次的點爆了佐助復仇的火焰。佐助決心尋求力量，拜大蛇丸為師，成為叛忍。
佐助被哥哥打
之後四年中，曉組織成為帶土月之眼計劃的傀儡，隨著一步步的完成收集月之眼計劃需要的尾獸，曉組織人員相繼死亡，期間自來也死於徒弟長門之手。
帶土和兜合作為了捕捉八尾九尾發動了第四次忍界大戰。大戰期間，帶土成為十尾人柱力，但不幸中了鳴人嘴遁之術而浪子回頭。斑被輪迴天生之術復活取代了被洗白的帶土，成為新的十尾人柱力。斑無敵，但是被六道羽衣賦予了鳴佐外掛而拖住。
就在斑得意忘形之際被黑絕偷襲，輝夜突破封印而出。斑趴下後，輝夜所向披靡，無人是對手。但是在第七班和帶土的努力下輝夜不幸中了鳴人逆後宮之術，再次被封印。
但是因陀羅，阿修羅的戰爭沒有結束，鳴佐在終結之谷進行了決戰。這場戰鬥的意義是因陀羅和阿修羅的，也是鳴人佐助的。這次六道平分了力量，二人打了平手。但是佐助決定不再復仇，認同鳴人用愛感化世界的方式。就此完結撒花。
終極之戰
整個火影是從鳴人十二歲開始講起的。而鳴人前期就是個菜鳥，天賦也不及自己的父親四代火影強大，但是他卻一步一步走上了人生巔峰，忍界巔峰。究竟是為什麼呢。我想除去主角光環外，就是反派的功勞了。
終極反派輝夜開啟了世界，也開啟了整個故事的走向。
斑，帶土，曉，三代，團藏，半藏構成了整個故事的網絡，同時也為輝夜做了嫁衣。正是這些人的存在，才使得忍界不得安寧，鳴人才不得不拼命修煉，和佐助一統忍界。
所以生活中的壞傢伙們才是我們成長的墊腳石，他們使我們需要克服困難經歷痛苦去解決的問題。沒有這些人我們無法成長，作為主角的我們，作為強者的我們，應該學會感謝他們，是他們成就了我們，使我們變得更加完美。
