急性中毒
據世界衛生組織和聯合國環境署報告，全世界每年有100多萬人除草劑中毒，其中10萬人死亡。在發展中國家情況更為嚴重。我國每年除草劑中毒事故達近百萬人次，死亡約2萬多人。1995年9月24日中央電視臺報導，廣西賓陽縣一所學校的學生因食用噴灑過劇毒除草劑的白菜，造成540人集體農藥中毒。本世紀更嚴重,這樣的事件年年發生。
慢性危害
化學除草劑在人體內不斷積累，短時間內雖不會引起人體出現明顯急性中毒症狀，但可產生慢性危害，如：破壞神經系統的正常功能，干擾人體內激素的平衡，影響男性生育力，免疫缺陷症。農藥慢性危害降低人體免疫力，從而影響人體健康，致使其它疾病的患病率及死亡率上升。
除草劑蔓生的雜草使農作物失去大部分的陽光和養分，對農業收成的危害不亞於病蟲害。 [
致癌、致畸、致突變
國際癌症研究機構根據動物實驗確證，廣泛使用的除草劑具有明顯的致癌性。據估計，美國與化學除草劑有關的癌症患者數約佔全國癌症患者總數的20%
- 除草劑對其他生物的危害
直接殺傷
除草劑在使用過程中，必然殺傷大量非靶標生物，致使害蟲天敵及其它有益動物死亡。環境中大量的農藥還可使生物產生急性中毒，造成生物群體迅速死亡。
慢性危害
化學除草劑的生物富集是農藥對生物間接危害的最嚴重形式，植物中的除草劑可經過食物鏈逐級傳遞並不斷蓄積，對人和動物構成潛在威脅，並影響生態系統。除草劑生物富集在水生生物中尤為明顯，如綠藻能把環境中1ppm的DDT富集到220倍，水蚤則能把0.5ppm DDT富集到10萬倍。美國明湖用DDT防治蚊蟲，湖水中含DDT0.02ppm，湖內綠藻含DDT5.3ppm，為水中的265倍，最後在食肉性魚體中含量高達1700ppm，富集到85000倍。
破壞生態平衡
農田環境中有多種害蟲和天敵，在自然環境條件下，它們相互制約，處於相對平衡狀態。除草劑的大量使用，良莠不分地殺死大量害蟲天敵，嚴重破壞了農田生態平衡，並導致害蟲抗藥性增強。我國產生抗藥性的害蟲已遍及糧、棉、果、茶等作物。嚴重汙染了生態環境，使自然生態平衡遭到破壞。
