南海诸岛是我国最南端的热带岛屿，自古以来就是我国的领土，是我们祖先最早发现、最早开发经营、最早管辖的海上疆土之一。
南海诸岛植物区系几乎都是热带成分，其中泛热带分布的属所占的比例最大。一些典型的热带科，如玉蕊科、莲叶桐科等在本区均有代表，反映出本区系的热带性质。南海诸岛的维管束植物没有特有种，岛上的植物都是从邻近的大陆和岛屿通过海流、鸟类、风及人类等传播进来的，因此其与邻近国家和地区植物区系的联系十分广泛。
在南海诸岛植物区系中，只有白避霜花、海柠檬、银背落尾木、大叶蝶豆、莲实藤、毛短颖马唐、海人树等少数种类没有分布到我国台湾及海南，其余均与台湾或海南共有。过去一直认为在我国仅见于南海诸岛的假海齿、西沙黄细心等最近也在海南岛被发现。
南海诸岛的几组群岛因地理位置、面积、海拔、岛屿的年龄以及人类活动影响的程度不同而所含的种数也有较大的差异。南沙群岛目前仅知有维管束植物60 科165 属216 种；西沙群岛有维管束植物88 科268 属375 种；东沙群岛仅有维管束植物105 种。
南海诸岛的植被十分特殊，由于地处热带和赤道海洋季风区，适于热带海岸植物的生长和发育，因此海岸林长得十分茂盛，乔木层高达20m，主要的优势种有榄仁树、白避霜花、海岸桐、橙花破布木等，南沙群岛的优势种还有莲叶桐和海柠檬；灌丛主要由草海桐、银毛树、海巴戟、海人树等组成；海滨沙生植被则以厚藤、海滨大戟、海刀豆、铺地刺蒴麻、滨红豆、蔓茎栓果菊、孪花蟛蜞菊等为主。
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