南海諸島是我國最南端的熱帶島嶼，自古以來就是我國的領土，是我們祖先最早發現、最早開發經營、最早管轄的海上疆土之一。
南海諸島植物區系幾乎都是熱帶成分，其中泛熱帶分佈的屬所佔的比例最大。一些典型的熱帶科，如玉蕊科、蓮葉桐科等在本區均有代表，反映出本區系的熱帶性質。南海諸島的維管束植物沒有特有種，島上的植物都是從鄰近的大陸和島嶼通過海流、鳥類、風及人類等傳播進來的，因此其與鄰近國家和地區植物區系的聯繫十分廣泛。
在南海諸島植物區系中，只有白避霜花、海檸檬、銀背落尾木、大葉蝶豆、蓮實藤、毛短穎馬唐、海人樹等少數種類沒有分佈到我國臺灣及海南，其餘均與臺灣或海南共有。過去一直認為在我國僅見於南海諸島的假海齒、西沙黃細心等最近也在海南島被發現。
南海諸島的幾組群島因地理位置、面積、海拔、島嶼的年齡以及人類活動影響的程度不同而所含的種數也有較大的差異。南沙群島目前僅知有維管束植物60 科165 屬216 種；西沙群島有維管束植物88 科268 屬375 種；東沙群島僅有維管束植物105 種。
南海諸島的植被十分特殊，由於地處熱帶和赤道海洋季風區，適於熱帶海岸植物的生長和發育，因此海岸林長得十分茂盛，喬木層高達20m，主要的優勢種有欖仁樹、白避霜花、海岸桐、橙花破布木等，南沙群島的優勢種還有蓮葉桐和海檸檬；灌叢主要由草海桐、銀毛樹、海巴戟、海人樹等組成；海濱沙生植被則以厚藤、海濱大戟、海刀豆、鋪地刺蒴麻、濱紅豆、蔓莖栓果菊、孿花蟛蜞菊等為主。
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