这部动画电影的女主名叫百南花，一如既往采取日漫中“秒天秒地”的高中生设定。
动画最先铺垫却是百南花的家庭环境，父亲是外太空宇航员，由于外太空中食物非常难吃，某日一位靠坑蒙拐骗上位的“博士”研发出所谓的外太空食物，这正是动画悲剧最初的起源。
内容深虐引不适，父亲惨被陷害，女主却保护反派将其击杀！
由于父女分离两地，百南花寄居在叔叔家里，其父亲任务在身很少有机会归家探望女儿，于是将不菲的工资委托给能够自由返回地球的博士，让他交给女儿百南花。而博士研发的食物其实隐藏变异因子，百南花的父亲在某个夜晚因变异而成为怪物，博士等人却逃回地球。
情节铺垫中很明显博士是造成一切灾难的始作俑者，然而他却凭借幸存者身份受到外太空组织的优待，事件消息被严密封锁。与之形成痛苦对比的是，百南花仍旧满怀希冀的在夜晚眺望外太空，期待有一天父亲会回来探望。
初看百南花戴眼镜的圆形萌脸，很容易让人生气亲切感，她为了挣钱也时常跑去女仆咖啡厅打工经常工作到很晚，和叔叔家女儿相处得十分融洽，日子虽然艰辛，但小日子过得很充实。
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当然这只是面对普罗大众的形象，动画最有趣的地方在于人格设定的双面性，表面上温和亲切萌的百南花，暗地里是有着“死亡天使”之称的都市杀手，身手敏捷精通各式武器，但她做的大都是良善之事，解决一些连警察也难以对付的坏人，这是加分的双面性。
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很快剧情转折来临，原本变成怪物的百南花父亲，随着飞船坠落在大海进入陆地，变成怪物的父亲尚且保留一丝丝的理智，但破坏和杀戮已经不可遏制的蔓延，仿佛一架人性兵器在都市里四处肆虐，为寻找博士复仇而来的父亲一路追杀。
情节塑造的事件迅速升温到高潮，为保护都市的百南花不可避免的和父亲发生冲突，非但没有认出仇人博士，反而帮助对方逃走，拦截住变成怪物的父亲，起初双方都没有认出彼此，大打出手之下，百南花深受重伤，但怪物偶然间发现送给女儿的礼物认出了女儿，触动到内心情感神情凝视。结果反而被不清楚真相的百南花抓住机会，把眼含泪水的怪物父亲杀死。
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事后和道谢的博士乘坐车辆离开，亲者痛仇者快的展开差点让人想要弃番，好在此时接近尾声，傲慢的博士吹嘘自己在外太空的经历，才把事情的原本告诉了百南花，在无限的懊悔和自责中，百南花也露出身份，击杀了制造混乱的博士，从此彻底放下了武器。
故事到此终结，剧本角度来说，绝不是什么好事，名为《少女杀手2》的动画电影里将残酷的事实放大，夸大阴错阳差的无间命运，看完令人难以释怀。
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个人认为这是梅津泰臣纯粹为补足《少女杀手1》补足的作品，交代了前作中女主成为单亲妈妈的同时放大了关于少女杀手的世界。就算如此，少女杀手2还是很好的继承了一贯的萌形象设计和行云流水的打斗场面，砂羽和百南花各自的战斗风格劲爽，和渡边信一郎的风格类似。
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虽然结局上看这部动画内容比较虐，容易引起内心的抗拒不适，不可否认的是里头的人物和打戏非常耐看，且没有尺度问题，但作者偏好此类究极化的设定，可能也是他声名比不过渡边的原因，为了虐而出发，这动画还是可惜了！
