作者丨小柯
近日，西班牙巴塞羅那科技學院Holger Heyn等研究人員對用於細胞圖譜計劃的單細胞RNA測序實驗方案進行基準測試。
該研究於2020年4月6日在線發表於《自然—生物技術》。
研究人員表示，單細胞RNA測序（scRNA-seq）是表徵樣品中單個細胞的轉錄組的主要技術。
最新的實驗方案可擴展到數千個細胞，並被用於繪製組織、器官和生物體的細胞圖譜。
但是，這些實驗方案在RNA捕獲效率、偏倚、規模和成本方面有很大不同，並且它們在不同應用中的相對優勢尚不清楚。
研究人員生成了基準數據集，可根據其全面描述細胞類型和狀態的能力來系統性評估實驗方案。
研究人員進行了一項多中心研究，比較了13種常用scRNA-seq和單核RNA-seq實驗方案。
比較分析顯示實驗方案的性能存在明顯差異。
這些實驗方案在文庫的複雜性及其檢測細胞類型標記的能力方面有所不同，從而影響了它們的預測價值和與參考細胞圖譜整合的適用性。
這些結果為獨立研究人員和團隊研究項目（如人類細胞圖譜計劃）提供了指導。
https://www.nature.com/articles/s41587-020-0469-4
小柯報道：
http://news.sciencenet.cn/htmlpaper/2020/4/20204919195031855776.shtm
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