新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

COVID-19是由SARS-CoV-2引起的新型冠状病毒疾病,临床表现包括肺炎、腹泻、呼吸困难和多器官功能衰竭。淋巴细胞减少症在COVID-19患者中也很常见,也作为一项诊断指标。有研究发现,COVID-19患者的外周血单核细胞中凋亡、自噬和p53通路上调。还有研究报告,淋巴细胞减少可能与死亡率有关,尤其是CD3+、CD4+和CD8+ T淋巴细胞水平低的患者。

在中东呼吸综合征(MERS)病例中,也发现了淋巴细胞减少症。MERS-CoV可以直接感染人原代T淋巴细胞并通过外在和内在的凋亡途径诱导T细胞凋亡,但不能在T淋巴细胞中复制。但是,目前还不清楚SARS-CoV-2是否也可以感染T细胞,从而导致了淋巴细胞减少症。

为了解决这个问题,复旦大学分子病毒学教育部/卫健委重点实验室的姜世勃教授和陆路教授评估了T淋巴细胞对SARS-CoV-2感染的敏感性,相关研究结果于4月7日发表在《Nature》子刊《Cellular & Molecular Immunology》上。

新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

Cellular & Molecular Immunology (2020)

他们利用SARS-CoV和SARS-CoV-2假病毒(非病毒DNA被与病毒外型相同的蛋白质外壳包裹的生物颗粒)来进行实验。假病毒可以感染表达ACE2受体的细胞(293T/ACE2和Huh7细胞),但不能感染不表达ACE2的细胞(HeLa细胞)(图1a)。使用对293T/ACE2细胞有相同感染力的假病毒(图1c)来感染两种T淋巴细胞系MT-2和A3.01,而这两种T细胞的ACE2 mRNA表达水平非常低或接近于阴性(图1b)。

出乎意料的是,在多次重复试验中,他们发现与SARS-CoV相比,T细胞对SARS-CoV-2感染的敏感性显着更高(图1c)。换句话说,这些结果意味着,T淋巴细胞可能对SARS-CoV-2感染更敏感,对SARS-CoV感染不敏感。

新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

SARS-CoV-2对T细胞的感染

因此,SARS-CoV-2的S蛋白可能与其强传染性有关,即使是hACE2低表达的细胞,这反过来也可以解释为什么SARS-CoV-2的传播率如此之高。其他受体也可能介导SARS-CoV-2进入T细胞,比如最近报道T淋巴细胞表面上存在的CD147,是SARS-CoV-2的一种新的侵入途径。

那么,SARS-CoV-2是否可以通过非受体介导的内吞作用进入T淋巴细胞?

他们利用EK1肽继续进行实验(EK1肽可以抑制SARS-CoV-2刺突蛋白(S)介导的细胞融合和假病毒感染)。他们发现EK1肽对MT-2细胞的SARS-CoV-2假病毒感染有显着的抑制活性(图1d),表明病毒的进入取决于受体介导的融合。但是,只有高浓度(40μM)的EK1对MT-2细胞具有抑制活性。同时,在293T/ACE2细胞上,EK1的IC50值为2.38μM。这些结果表明SARS-CoV-2也可以通过受体介导的内吞途径进入T淋巴细胞。

为了阐明这一点,他们根据先前的研究进行了SARS-CoV-2 S蛋白介导的细胞间融合测定。共培养48小时后,表达SARS-CoV-2 S蛋白的293T细胞与MT-2细胞发生融合。与未融合的细胞相比,融合的细胞聚集在一起显示为大的淡绿色荧光团。相反,在SARS-CoV共培养中未发现融合细胞(图1e)。因此,可以得出结论,SARS-CoV-2可能通过S蛋白介导的膜融合感染T细胞。

新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

SARS-CoV-2通过S蛋白介导的膜融合感染T细胞

为了进一步确定MT-2细胞对活病毒的敏感性,他们使用SARS-CoV-2感染MT-2细胞,并在MT-2细胞中检测到SARS-CoV-2核蛋白(图1f)。从数量上讲,SARS-CoV-2 核蛋白阳性的MT-2细胞在感染后24h时的百分比比未感染的细胞高23.11%,是1h时的4.6倍(图1f)。这一结果表明SARS-CoV-2病毒在24h时穿透了MT-2细胞并感染了它们。

考虑到MERS-CoV可以在T淋巴细胞中有效感染但不能复制,他们进一步检测了T细胞感染SARS-CoV-2后不同时间点病毒基因组的拷贝数,来表征SARS-CoV-2在MT-2细胞中的复制特征。与MERS-CoV类似,SARS-CoV-2无法在MT-2细胞中复制(图1g)。6h的病毒基因组拷贝数显着高于其他时间点的细胞裂解液,但所有时间点上清液中始终保持稳定。

这些结果表明,SARS-CoV-2可能在感染后6h进入MT-2细胞,但不会复制,然后病毒RNA降解。上清液中,检测到的病毒拷贝可能是残留病毒粒子的背景,与之前MERS-CoV的研究结果类似(图1g)。

新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

SARS-CoV-2通过S蛋白介导的膜融合感染T细胞

根据假病毒和活病毒感染的结果,他们证明了三点:(1)SARS-CoV-2可以感染T细胞;(2)SARS-CoV-2可以通过受体依赖性S蛋白介导的膜融合来感染T细胞;

(3)EK1肽可以抑制感染。

但是,T细胞中ACE2的表达水平非常低。因此,可能存在一种新型受体介导SARS-CoV-2进入T细胞。与MERS-CoV相似,SARS-CoV-2感染T细胞是“顿挫性感染”(因细胞条件不合适,病毒虽然可以进入细胞内但不能复制的感染过程)。

最近一项研究报道,通过RNA转录组测序,在COVID-19患者的外周血单核细胞样品中几乎没有病毒读数。因此,推断SARS-CoV-2不能感染外周血单核细胞。然而,在另外3例患者中检测并分析了外周血单核细胞的转录组特征。其中1名患者的外周血单核细胞中检测到两个SARS-CoV-2读数,另1名患者的外周血单核细胞中检测为零。这个结果可能是因为SARS-CoV-2在T淋巴细胞中进行“非生产性复制”,导致外周血单核细胞中病毒基因组很少,可能在样本采集和RNA提取过程中发生了降解。

2月份,第三军医大学免疫研究所陈永文教授团队在medRxiv预印版平台发表题为“Reduction and Functional Exhaustion of T Cells in Patients with Coronavirus Disease 2019 (COVID-19)”(COVID-19患者T细胞减少和功能衰竭)的论文。

新研究,SARS-CoV-2可以“顿挫性感染”T细胞——感染但不复制

10.1101/2020.02.18.20024364

该研究对武汉522例COVID-19患者和40名健康人对照的回顾性研究发现,年龄依赖性和临床严重性依赖性的T细胞数量减少与血清TNF、IL-6和IL-10水平成反比。在14例COVID-19患者和3例健康人的外周血细胞中,检测了T细胞衰竭标志物(PD1和TIM3)的表达。重症ICU患者的CD8+ T细胞与非ICU和健康对照者相比,PD1表达增加。这表明随着COVID-19患者疾病严重程度的提高,炎性细胞因子水平的升高可能会导致T细胞的耗竭和衰竭。

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COVID-19患者T细胞统计

陈的文章提示细胞因子风暴耗竭了T细胞,而姜的研究检测了SARS-CoV-2对T细胞的感染能力,提示SARS-CoV-2可能会直接破坏T细胞,但对于SARS-CoV-2在原代T细胞中的感染和复制,以及该感染是否诱导T细胞凋亡的问题仍需进一步研究,可能SARS-CoV-2致病机理和治疗干预提供新思路。

参考文献:Doi: 10.1038/s41423-020-0424-9

Doi: 10.1101/2020.02.18.20024364


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