- 引言 -
2020年3月16日，吉因加科技聯合華大智造、百奧智匯、艾吉泰康、微基因、未來組、擎科生物、博雲華康等業內8家公司宣佈，正式成立國產測序平臺應用生態聯盟。未來，聯盟企業將依託國產測序平臺，通力合作，為行業應用各個細分領域的客戶提供最具競爭力的產品服務，打造中國基因產業新生態，助力國產平臺賦能行業繁榮發展。
目前，國產測序平臺應用生態聯盟的首批8家企業，分別覆蓋了基因測序產業鏈上下游的各個環節，貫穿測序儀的研發和生產、測序試劑、耗材等一系列的核心技術，可基於國產測序平臺提供從文庫製備到生物信息分析等一系列標準化/個性化的解決方案。對於聯盟的成立理念和未來發展，業內普遍認為，該聯盟的成立可充分發揮行業上下游的聯動力量，形成一個開放穩健的產業生態圈，促進中國生物企業通過協同創新的方式，更快進入全球市場，加速實現由參與、接軌、同步到引領的跨越發展，推動中國力量從工具平臺到生態平臺的躍遷。
做大生態格局，從工具到生態的躍遷
基因測序儀是基因測序產業的上游平臺，也是基因檢測、基因編輯、基因合成產業中的決定性設備。2015年華大正式發佈其自主研發的第一款國產測序平臺填補了國產測序儀的市場空白，實現了我國基因科技佈局產業上游的突破。在接下來的幾年，擁有完全自主知識產權、具有先進水平的多款不同通量的測序平臺逐漸上市，包括全球日生產通量最高的DNBSEQ-T7，以及多個實驗室都已配備的MGISEQ-2000、MGISEQ-200等機型。華大智造測序平臺以其獨有的DNBSEQ核心技術，數據產出準確性高、錯誤率低，且性能穩定，給行業帶了新鮮血液。目前，聯盟內已有近半數企業配備了華大智造DNBSEQ平臺。國產平臺的崛起，為行業生態的打造奠定了基礎。
圖：華大智造DNBSEQ平臺（2019年9月版）
隨著測序技術的突飛猛進和國產測序平臺的崛起，以及基於國產平臺的測序服務商越來越多，測序應用的深度和廣度將逐步打開。“以多組學大數據為基礎的生物信息時代正在快速到來。其發展速度取決於兩個關鍵要素，即我們獲取數據的成本和數據的挖掘深度。國產高通量測序技術的迅猛發展為各方研究團隊提供了平臺支撐。”聯盟成員單位吉因加董事長易鑫介紹道。據悉，吉因加已於2019年年底引進華大智造DNBSEQ-T7超高通量測序儀，並藉助DNBSEQ-T7高速、靈活、超高通量等顯著優勢，更好地釋放自身強大的數據分析和數據交付能力，開啟公司在科技服務板塊的新篇章。
圖：DNBSEQ-T7在吉因加（2019年12月攝）
聯盟成員單位武漢未來組創始人汪德鵬認為：“組學領域的科技服務市場，已經從早期的跑馬圈階段過渡到了精耕細作階段。用聯盟的方式，既能夠滿足客戶的需求，也有利於各個公司建立區別化競爭，避免無謂的紅海、血海競爭。”
成立生態聯盟可加速扭轉我國生命科學基礎建設一度依賴進口設備的被動局面，做大生態格局，實現從工具到生態的躍遷之路。聯盟企業分佈在測序行業的上中下游，上游技術的自主可控催生了多元化的應用，而隨著下游應用的深化，進一步對技術創新提出了更多要求。正如聯盟成員單位華大智造CEO牟峰所說：“技術落地催生多元化應用，應用落地反促技術革新。集行業之智，聚行業之力，創行業之先，打造強大的應用生態，是行業發展的需要，也是價值創新的需要。”
做好生態文明，數據產出交付標準化
基因測序技術經過跨越式的發展，測序成本大幅下降，系統的易用性也在不斷提升。但測序過程涉及各環節的標準化建設仍不完善，例如樣本處理、文庫構建、數據分析與挖掘等。隨著基因數據量規模的擴大，行業內對數據產出和交付的及時性和標準化要求也日益迫切。
以華大智造超高通量基因測序儀DNBSEQ-T7為例，該平臺的日產出數據高達6Tb，比目前市面上速度最快的同類測序儀速度提升了50%以上。DNBSEQ-T7配備了領先的芯片、流體、生化及光學系統，可實現4張芯片同時獨立運行，在保證了極大的靈活度的同時，擁有強大的日生產能力，能夠滿足行業內對數據產出追求極致交付的願望和想法。
聯盟成員單位百奧智匯副總裁胡學達認為：“聯盟的成立將幫助我們獲得極其重要的基礎性的數據產出能力，能夠結合各自技術手段，打通產業各個環節，發揮各自最大優勢。”對於進一步打開測序應用的生態文明，聯盟成員單位艾吉泰康CEO杭興宜表示：“艾吉泰康將利用TargetSeq液相探針基因捕獲和MultipSeq多重PCR基因捕獲兩大自主知識產權的基因捕獲技術，
積極研發適配國產測序儀的試劑盒與推出測序服務，加速國產試劑對國產測序儀的適配；發揮國產試劑優勢，深化一條龍國產測序服務在基因科技中的應用。”目前，聯盟內部已達成共識，就國產測序平臺的應用拓展展開積極響應和推動，在確保安全與隱私的基礎上共享標準，在統一標準的指導下進行基因數據的產出和交付，以及深度的數據挖掘。
做強生態經濟，助力全球基因測序市場
近年來，基因測序技術和平臺不斷升級迭代，基因測序儀也向著便攜、快速、智能等方向發展。華大智造一直致力於測序技術的突破和創新，以滿足研究人員和臨床醫生對基因測序的多元化需求。目前，華大智造形成了完整的高中低通量產品佈局，同時自主研發了一套完善的基因測序產品，包括建庫試劑、測序試劑、分析軟件等配套產品，例如，自動化樣本製備系統MGISP-100/MGISP-960、基於短讀長片段測序方法的MGIEasy stLFR建庫試劑盒、生信分析加速器MegaBOLT等。
值得關注的是，
因具有數據質量良好和運行方式靈活等特點，DNBSEQ-T7全面支持全基因組測序、超高深度全外顯子組測序、表觀基因組測序、腫瘤大Panel基因檢測等多種應用場景的測序服務。在超高通量和高數據質量之外，DNBSEQ-T7的自動化程度進一步提高，支持自動清洗和測序載片自動回收，無縫銜接下一輪測序，支持24小時無休運轉，可大幅提高科研效率，有助於前沿基因科技成果快速普及。在當前抗擊新冠疫情的戰場上，DNBSEQ-T7也發揮了非常重要的作用。1月初，華大與中國科學院微生物研究所、山東第一醫科大學通力合作，依託華大智造超高通量測序儀DNBSEQ-T7，快速完成新冠病毒全基因組序列組裝；2月初，聯盟企業吉因加宣佈將基於DNBSEQ-T7等平臺為防控新型冠狀病毒肺炎的科研工作提供免費測序服務，以便為人群監測、病毒溯源、變異進化等研究提供助力。
此外，華大智造的多款測序平臺MGISEQ-2000和MGISEQ-200，自動化樣本製備系統MGISP-100和MGISP-960等也在多地被用於分析新型冠狀病毒序列，提升檢測中心樣本處理能力，在全國疫情一線發揮了重要作用。
3月15日，韓國基礎科學研究所（IBS, Institute of Basic Science）RNA研究中心聯合國立首爾大學（Seoul National University）和韓國疾病預防控制中心（Korea Centers for Disease Control & Prevention）
利用華大智造DNBSEQ技術聯合 Nanopore單分子測序技術，對新冠病毒感染的Vero細胞總RNA進行了分析，並結合以往研究給出了新冠病毒轉錄組和表觀轉錄組的高清圖譜。
圖：在韓國新冠疫情中發揮重要作用的MGISEQ-200
聯盟成員單位擎科生物CEO馬石金表示：“‘眾人拾柴火焰高’，擎科生物願意發揮技術整合及渠道優勢，
與聯盟的各兄弟公司一道，為中國和世界的測序行業、生物產業貢獻中國智能服務的力量。”據瞭解，目前全球已有20多個國家在使用華大智造測序儀。2019年12月，華大智造宣佈參與阿聯酋阿布扎比基因組計劃的高通量測序平臺建設。作為目前全球綜合基因組計劃，該計劃具有非常重要的科學價值，華大智造將以其穩定可靠的測序儀可為該計劃提供強有力的支持。
聯盟成員單位微基因聯合創始人李國慶認為：“國產測序設備的成熟，特別是國產測序平臺應用生態聯盟的成立，是我們期待已久的機會。希望藉此聯盟能夠與眾多的夥伴精誠合作，優勢互補，整合出更加全面、更加深入、更具性價比的產品，為客戶提供滿意的服務。”
圖：DNBSEQ-T7實驗室解決方案（2019年12月版）
結 語
隨著我國在基因測序上游設備方面自主研發、自主創新力度的不斷加大，國產高通量測序儀已具備和進口測序儀相當的競爭力，逐步打破了外企的市場壟斷。對於聯盟的成立，博雲華康創始人羅龍海談道：“高通量測序技術已成為生命科學研究普遍使用的技術手段。聯盟的成立，能為各企業從上游到下游提供更多協同和幫助，實現優勢互補，構建良好生態，促進共同發展。” “千川匯海闊，風好正揚帆。”在生命時代，基於國產平臺的多組學大數據，不僅為行業注入了核心力量，也注入了新鮮的活力。後續入局的基因測序廠家將如何打破生態圈壁壘？國內企業如何通過協作進一步獲取國際市場份額？相信這些問題在生態建設的過程中將得到解答。希望聯盟能夠將其在應用過程中積累的經驗，助推國產測序平臺的發展和全球測序應用生態的建設。
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