先明確一點，基本農田是不允許種樹的，這一點毋庸置疑！
民以食為天，國以糧為安。耕地是糧食安全的保障，關係十幾億人的吃飯問題；基本農田又是最高產最優質的那部分耕地，是“口糧田”“養命田”。現在國家對於基本農田是嚴格保護的，不允許在此上發展林果業和挖塘養魚，就是為了保障每個人的“飯碗”。
多項法規均禁止在基本農田種樹
先明晰一下概念。基本農田是指中國按照一定時期人口和社會經濟發展對農產品的需求，依據土地利用總體規劃確定的不得佔用的耕地。永久基本農田即對基本農田實行永久性保護。
而耕地則範圍要大一些。2017年11月1日發佈實施的《土地利用現狀分類》中對耕地的定義如下：耕地指種植農作物的土地，包括熟地，新開發、復墾、整理地，休閒地（含輪歇地、休耕地）；以種植農作物（含蔬菜）為主，間有零星果樹、桑樹或其他樹木的土地；平均每年能保證收穫一季的已墾灘地和海塗。
耕地中包括南方寬度<1.0m，北方寬度<2.0m固定的溝、渠、路和地坎(埂)；臨時種植藥材、草皮、花卉、苗木等的耕地，臨時種植果樹、茶樹和林木且耕作層未破壞的耕地，以及其他臨時改變用途的耕地。
2017年發佈的《中共中央國務院關於加強耕地保護和改進佔補平衡的意見》提出，到2020年全國耕地保有量不少於18.65億畝，永久基本農田保護面積不少於15.46億畝，確保建成8億畝、力爭建成10億畝高標準農田。從中也不難看出，耕地是大於基本農田的。基本農田是耕地是精華，是耕地中質量好、品質優、產量高的那一部分，承載著糧食生產最為重要的任務。
我國實行最嚴格的耕地保護制度，國家對永久基本農田更是實行特殊保護。《土地管理法法》、《基本農田保護條例》都明確規定：不允許在基本農田上栽樹。而早在2004年，國務院還圍繞專門發出《關於堅決制止佔用基本農田進行植樹等行為的緊急通知》，提出了做好保護基本農田“五個不準”。特別指出：“不準佔用基本農田進行植樹造林、發展林果業和搞林糧間作以及超標準建設農田林網。”
根據《基本農田保護條例》第十七條規定，禁止任何單位和個人佔用基本農田發展林果業和挖塘養魚。
新修訂於2020年1月1日起施行的《土地管理法》第三十六條亦明確，禁止佔用基本農田發展林果業和挖塘養魚。
原國土資源部對基本農田果樹相關諮詢的回覆
從法律層面上不難看出，基本農田是不能種樹的！法律法規對違法佔用基本農田行為處罰十分嚴厲。
依據我國《刑法》和相關司法解釋，非法佔用基本農田五畝以上或者非法佔用基本農田以外的耕地十畝以上，造成耕地大量毀壞的，處五年以下有期徒刑或者拘役，並處或者單處罰金。
已種植的樹木怎麼辦？
這些年，由於種樹收益高，再加上現在農民要掙錢，主要靠外出務工，種上樹能確保務工期間不必考慮種什麼怎麼收怎麼賣的問題，也能確保田地不荒廢。所以一些地方出現農民在承包地裡種植樹木的現象。
為加強和改進永久基本農田保護工作，自然資源部、農業農村部2019年1月聯合發出相關通知，提出嚴格規範永久基本農田上農業生產活動。對違法違規佔用永久基本農田建窯、建房、建墳、挖沙、採石、採礦、取土、堆放固體廢棄物或者從事其他活動破壞永久基本農田，毀壞種植條件的，按《土地管理法》《基本農田保護條例》等法律法規進行查處，構成犯罪的，依法移送司法機關追究刑事責任。
同時，通知再次強調，永久基本農田不得種植楊樹、桉樹、構樹等林木，不得種植草坪、草皮等用於綠化裝飾的植物，不得種植其他破壞耕作層的植物。本通知印發前，已經種植的，由縣級自然資源主管部門和農業農村主管部門根據農業生產現狀和對耕作層的影響程度組織認定，能恢復糧食作物生產的，5年內恢復；確實不能恢復的，在核實整改工作中調出永久基本農田，並按要求補劃。
上述規定，又再次明確強調永久基本農田不得種植楊樹、桉樹、構樹等林木，甚至連草皮也不得種植。有的農民想當然，以為是自己承包的基本農田，就有權改變土地的用途、想種什麼就種什麼，其實這種認識是錯誤的。
不過，這個通知也給已在基本農田種植樹木的一個緩衝期，一是5年內恢復土地原樣；二是如確實不能恢復，將調出基本農田。如調出基本農田，這也就意味著一方面政府要找其他土地劃補這部分佔用土地面積；另一方面調出基本農田後，種植戶將不能再享受這塊種糧補貼。
需要注意的是，對於一般耕地種樹，那就會根據農業結構調整的情況來看待，在不破壞耕作層的情況下，是可以發展林果業的。如果在荒地、塘邊、路邊、庭院等非耕地，種植樹木、綠化環境則是大力提倡的。
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