1、克孜尔水库
位于阿克苏地区拜城县境内，是塔里木河水系渭干河流域上的一座以灌溉、防洪为主，兼有水力发电等综合效益的大型控制性水利枢纽工程， 总库容6.4亿立方米。水库最大集水面积 44平方公里，是世界上濒临灭迹的珍稀鱼种-扁吻鱼(国家一级保护动物)和尖嘴鱼(国家二类保护动物)的栖息地，为扁吻鱼和尖嘴鱼提供了良好的繁衍生息条件。克孜尔水库作为目前新疆最大的水库之一，具有得天独厚的自然资源，水域广阔，工程建筑宏伟壮观，楼台亭参差有致，周围奇峰怪石嶙峋，又与闻名遐迩的中国四大佛教石窟之一的克孜尔千佛洞相毗邻，经水库多年的建设，优美的自然风光与独特的西域地理风貌有机地融合在一起。
2、小海子水库
新疆生产建设兵团图木舒克市小海子水库是西北地区最大平原水库，库容7亿立方米，可利用水面155平方公里，水库依山，水面开阔，库边有原始胡杨林，连绵起伏的沙漠，库中水产丰富。六十年代初，一支垦荒大军开进这片沉睡的处女地，借着三面环玛扎山的天然屏障，兵团人推土筑坝，挖渠引水，建成了一座简易水库，拦截叶尔羌河洪水，引水注入式平原水库。从此，在共和国的版图上就有了个既好听又贴切的名字—小海子水库。
3、乌鲁瓦提水利枢纽工程
位于新疆维吾尔自治区南部的和田县境内，是一座具有灌溉、防洪、发电、生态保护等综合效益的大（二）型水利建设项目，是和田河西支流――喀拉喀什河流域的控制性骨干工程，是国家“九五”期间重点建设项目。工程距和田市71km。坝址控制流域面积19983平方公里，是总库容3.47亿立方米，电站装机容量6万kW，多年平均年发电量1.97亿kW.h。工程具有灌溉、发电、防洪、供水、生态保护等综合利用效益。建于1995年。
4、石子河蘑菇湖水库
位于新疆塔城地区沙湾县。形如簸箕，是利用两河洪积扇扇间洼地修筑起来的人工湖泊；水库东西宽6．5km、南北长7．4km、最大库容1．8亿立方米，蓄水面积31．2km2，库底高程377．2m，蓄水最高高程390．8m，水位最高时最大水深13．6m，平均为4．3m，最大坝高15．6m，原设计水库最大蓄水面积为31．2km2、1982年实测蓄水面积只有27．84km2。
5、恰拉水库
位于新疆天山南麓塔里木盆地东北边缘，塔河下游“绿色走廊”上段恰拉区域， 巴音郭楞蒙古自治州尉犁县境内。距尉犁县城50km，距库尔勒市120公里。于1958年动工兴建，1967年基本建成，以后逐年配套。恰拉水库为平原灌注式水库，以后逐渐配套。水库由进水枢纽、坝体和放水涵洞三部分组成。水库设计水位875.0m，对应水面面积46平方公里，库容1.38亿立方米，库盘面积54.8平方公里，水库利用率54%。水库2003年8月扩建，扩建后库容1.61亿立方米，水库利用率76.22%。
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