在一個破舊骯髒的漁場裡，伴隨著一個賣魚婦女的陣痛，故事的主角格雷諾耶誕生了。出生在魚攤旁的他極有可能和魚腸類一起，統統被鏟進河裡。可他的命運，註定不那麼簡單。
他的一陣啼哭驚動了路人，他的母親因謀殺嬰兒的罪名被送上斷頭臺。
他被送進孤兒院，在一群孩子怕自己以後吃不飽而想要悶死他時，警覺的他嗅到了一絲危險的氣息。緊接著，一陣啼哭。又救了他一命。
他五歲時還不會說話，但是卻發現了自己對氣味奇異的天賦。他閉上眼睛可以聞到幾公里以外的草，石頭，水，青蛙，以及水裡的青蛙卵。他聞死老鼠，可以聞到它體內的蛔蟲。
再長大一點，他被賣去做苦工。某次偶然的機會，他和工頭去巴黎市區送貨。他好像來到了一個嶄新的世界，各種各樣的氣味讓他應接不暇。他閉上眼睛，對這些氣味他並不挑剔。
突然，他聞到了一種很特殊的氣味。這氣味對他有種特別的吸引力。他一路跟隨氣味找到了一個賣黃杏的少女。沒錯，正是她的體香。
他一點一點的靠近她，在她背後深嗅她的氣味。她回過頭，伸出手拿著黃杏問他要不要買。他卻捧著她的手聞了起來。少女被嚇的趕緊逃走。
憑著他特有的天賦，他還是找到了她。少女尖叫，他便失手誤殺了她。他撕開她的衣服，貪婪的聞著她的氣味。像小孩對待自己珍視的寶貝一樣，小心翼翼的，想把少女身上所有的氣味吸進鼻腔裡。可過了一會屍體冷卻，味道不再。他有些失落。他好像突然明白了自己活著的意義，他悲慘的生活終於有了目標也有了新的使命。他要學會保存氣味，這樣才不會遺失這種超凡的美。
他找到了一個江郎才盡，店鋪已經無人問津的香水師兼老闆。他想盡辦法說服老闆，並製作出上乘的香水央求老闆收他為徒。老闆最終被他的天賦所折服，同意教他製作香水。老闆教他怎麼把玫瑰花製作成香精來保存玫瑰花的香味。他卻用同樣的方法蒸餾了鐵，玻璃，銅以及貓。他失敗了，這根本不可行。他因此大病了一場。
老闆告訴他，格拉斯有一種神秘的技藝叫油脂離析法。或許是他想要的，在給老闆說完將近一百種香水製作配方後，他義無反顧的踏上了前往格拉斯的征程。
在路上一個山洞裡他幾乎快要忘記自己的計劃時，卻夢見了那個賣黃杏的少女。他站在少女面前，少女卻看不見他。他醒來拼命的嗅自己，衝進大雨裡將自己洗淨，發現自己沒有任何氣味。他好像不存在這個世上。
第二天，晨曦出現，格雷諾耶有了新的計劃。他要向世人證明他的存在，他要自己非常重要並且出類拔萃。
前往格拉斯的路上電影整體的色調從灰暗到明亮。這好像預示著，他有很大的把握能夠成功。
他成功了。在格拉斯，他學會了保存氣味的方法，並且成功謀殺了26個少女，從每個少女身上提取香精最終混合在一起融成了一瓶香水。
他的罪行被世人發現，他們痛恨他，恨不得將他千刀萬剮，就像影片一開始他們在下面罵他那樣。他們發誓要將他送上斷頭臺，要看著他受盡折磨然後痛苦的死掉。
可他們並沒有得逞，他的那瓶香水，融合了世間所有的美好，彷彿能夠操控人的內心。能夠激發人們內心最純粹的愛。
他架著馬車，穿了身禮服，在身上擦了些香水，來到刑場。人們一聞到他身上的香水味就好像被操控了般，忘記了他的罪行。甚至不相信他是殺人犯。人們叫他天使，稱他為上帝。看著他的眼神裡滿是愛慕。他手一揮就引起下面一陣轟動。他把滴有香水的手帕扔了下去，引起眾人群交。
這大概是整部影片最讓人震撼的地方。用非常直白露骨方式展現出了香水的威力。
他站在臺上，看著下面的眾人，他又看到了那個賣黃杏的少女，幻想他們互相擁抱親吻。他流下了眼淚。
眾人天亮後醒來，彷彿昨天是一場宿醉，窘迫的拾起自己的衣服一個接著一個離開。再也沒人提起這件事。
他則回到出生的地方，將香水全部倒在自己的身上，一群人撲上去，分食了他。
最後幾個孩子發現了他在地上的夾克，他們不知道是誰的，便把它帶回了家。
不惜殺掉26個少女來達成自己的目標，卻又選擇用這種方式結束自己的生命。為什麼呢？
他能夠憑藉這一瓶香水征服世界，可以輕易的操控任何人。他明白這沒有用。他在知道自己並不存在於這個世上，並沒有獲得被世人認知的那種存在感。這香水也無法使他如常人一般愛與被愛。就連最後被人分食，也沒能被人記住，留下的，只有掉落在地上的夾克。
看完這部電影對氣味也開始敏感起來。隔著屏幕都好像都能聞到香水的氣味。對這個變態殺人狂也無法厭惡起來，看到最後覺得他就是一個悲劇。至始至終都在被人遺忘。
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