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養種鴨是為了得到更多的符合要求的種蛋，飼養方法與蛋鴨基本相同。蛋鴨的留種一般以秋鴨即8月下旬至9月份的雛鴨為多,因為秋鴨留種,剛好滿足第二年春孵旺季對種蛋的需要。但飼養蛋鴨只是為了得到商品蛋以滿足食用的需要，而飼養種鴨重點是獲取儘量多的受精率高、孵化率高的鴨蛋，以保證雛鴨健壯，所以在種鴨管理中，不僅要管理好母鴨，還要管理好公鴨。
一、環境管理
鴨舍內的墊草要保持乾燥清潔，尤其是產蛋的地方，墊草一定要乾燥，才能得到光滑潔淨的種蛋；運動場要排水暢通，不能有積水，保持鴨體乾燥清潔；舍內要通風良好，室內汙濁空氣少，種鴨睡得安穩；外界溫度高時，要加強通風換氣，但不能在舍內地面上灑水；早放鴨，遲關鴨，增加戶外活動時間；及時收集種蛋，不要讓種蛋受潮、日曬，被糞便沾汙。
二、養好公鴨
公鴨對提高蛋的受精率的作用很大。公鴨必須體質健壯，性器官發育健全，性慾旺盛，精子活力好，一般公鴨到150天左右才能達到性成熟。因此，選留公鴨的月齡要比母鴨早1～2月齡，到母鴨開產時公鴨正好達到性成熟。
在採食過程中公鴨爭食兇，十分好鬥，導致公、母鴨採食不均勻，體重不齊，所以公、母鴨在育成階段要分開飼養；要注意防止公鴨相互嬉戲，形成惡癖；一般到配種前20天公、母鴨才混合飼養；如果育成後期公鴨有明顯的性行為，可提早混養。
三、合理配種
蛋鴨品種好，種公鴨的配種性能好，公、母比例可達1∶20以上，全年受精率達90%以上；夏、秋季氣溫高，公、母鴨配種比例可達1∶（25～33）；育成期的公鴨要多養一些，以供配種選擇；前期公、母鴨開始混養時，比例要低一點，每100只母鴨多配1～2只公鴨；及時淘汰性行為不明顯，有惡癖的公鴨；到母鴨產蛋時保持1∶25左右的公、母比例為宜。
養鴨：高效養鴨必須遵守五大規律
四、保證營養充足
除了給予母鴨必需的營養物質外，還要多喂維生素、青綠飼料，特別要適當增加維生素E；維生素E能提高種蛋的受精率和孵化率，日糧中維生素E含量為每公斤20～25毫克；蛋白質飼料的比例，也要比平常略高些；幾種必需氨基酸，如賴氨酸、蛋氨酸和色氨酸應滿足要求，並保持平衡；色氨酸對提高受精率、孵化率有幫助，尤其不能缺乏，日糧中的含量應占0.25%～0.30%；餅粕類飼料中色氨酸含量較高，配制飼料時，餅粕和魚粉都不可缺少。
五、飼養管理
種鴨多運動和在水中洗浴、浮游是增強鴨體質和提高受精率的一個重要措施。通過洗浴和運動，可以促使種鴨新陳代謝旺盛；鴨的交配是在水中進行的，所以無論是放牧還是舍飼，都要讓鴨群在水中洗浴；種鴨要延長下水活動時間，公、母鴨交配大多在早晨或黃昏進行；因此，在早晨和黃昏時把種鴨趕到水裡浮游是十分重要的。
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