美国伊利诺伊大学曾针对美洲古家狗的基因组进行过一次大规模的数据比对，共统计了北美和南美12个地方、84只古家狗遗骸的基因特征，完成了20只古家狗基因组的完整排序。结论是古家狗大约在1万年前来到美洲，比人类到达美洲大陆晚了上干年。
根据考古发现，狗在很早以前就是人类狩猎的助手，古家狗和人之间的特殊关系可以追溯至16000年到11000年之前。家狗既可以得到人类喂饲，又能得到人类的保护。有时亦会担当负重迁徙的职责。
由于这种特殊的关系，研究古家狗的演化对研究古人类发展的历程据有非常重要帮助意义，包括其迁徙途径。通过研究狗的遗骸对人类行为进行推论的方法也越来越受到重视。
这些供分析研究的样本中有35个样本，来自于伊利诺伊州立考古勘探研究所，最初被发现于伊利诺伊州南部一座北美第一个被发现、规模最大的古城遗址。当地人类活动大约在1400年至650年前比较活跃。专家在该处发现了几十只被隆重下葬的家狗，表明当时的狗得到人类特殊对待。这里大部分狗是单独安葬，极少数是背靠背、成对下葬。
通过分析美洲古家狗的基因组，确定家狗的基因多样性以及特定区域的亲缘关系，发现了4种以前未有记录的古家狗基因类型。这表明美洲古家狗的多样性比学界以前认为的更丰富。在某些家狗种群中，研究人员甚至发现基因多样性的降低，说明狗在繁衍的过程中受到过人为干预，亦即人类的配种饲养。
此外，有些古家狗样本的基因和美洲狼的基因非常接近，说明它们之间存在着杂交，甚至有些家狗就是由美洲狼驯化而来。不过，美洲家狗的基因多样性暂时只能追溯到一万年前。
家狗在美洲首次出现的时间和美洲发现的最古老的狗葬时间相同，应该不只是巧合。至于狗这一物种传入的路线，学者一般估计是由欧亚大陆的猎人跨过白令海峡，将狗带到了北美，然后继续南下进入中南美。
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