所謂甲供工程，是指工程中全部或部分的設備、材料或動力，由工程發包方即甲方自行採購的建築工程。小編髮現，在甲供工程中，採用不同的招標計價方法和工程結算方法，對發包方和施工企業的稅務處理影響較大，需要引起雙方的重視。因此，不管發包方和施工企業採用哪種招標計價方式，建議雙方儘可能採用差額結算法進行工程結算，避免潛在的稅務風險。
1、招標計價常見方法
實踐中，發包方通常會採用兩種不同的計價方式，對甲供工程進行對外招標。
一種方式是發包方將自行採購材料（以下簡稱甲供材）的金額從工程造價中剝離出來，直接將不含甲供材金額的招投標價對外進行公開招標或協議招標。例如，一項工程造價1000萬元的項目，假設甲供材金額為200萬元，則發包方或業主直接以800萬元（1000-200）為招投標價，對外進行招標。這種方式具有特殊性，一般適用於國家重大建設工程領域。
第二種方式則比較普遍，發包方或甲方以含甲供材金額的招投標價，對外進行公開招標或協議招標。延續上例，發包方或甲方會直接以1000萬元作為招投標價對外招標。
2、總額結算法暗藏風
通常來說，不同的招標計價方式下，發包方與施工企業在工程結算環節，會選擇不同的結算方式和財務核算處理方式，對企業的稅務處理也會產生不同的影響。
第一種招標計價方式下，發包方和施工企業採用差額結算法結算，即結算價中不含甲供材金額。施工企業按照不含甲供材金額，向發包方開具發票，將收取的不含甲供材金額的工程款計入收入，發包方和施工企業都發生稅務風險的可能性較低。
第二種招標計價方式下，一些發包方和施工企業選擇採用總額結算法進行工程結算，即結算價中含甲供材金額。對發包方和施工企業來說，這種結算方法有一定稅務風險。
對發包方來說，發出甲供材時，通常會通過“預付賬款”科目進行會計核算。
在總額結算法中，有一些發包方會自己購買材料，並將甲供材金額計入銷售額和結算價中，施工企業需依據包含甲供材金額的總額，向發包方開具增值稅專用發票。當施工企業適用簡易計稅方法時，發包方可抵扣的增值稅進項稅額應按3%抵扣率進行計算；當施工企業適用一般計稅方法時，發包方可以按9%抵扣率計算抵扣增值稅進項稅額。但是，發包方在自行採購材料時，已從供應商處獲得了以增值稅一般稅率開具的增值稅專用發票，進行了一次增值稅進項稅額抵扣。
換句話說，這種結算方式下，發包方就甲供材成本，抵扣了兩次增值稅進項稅額，進行了兩次企業所得稅稅前扣除。
如果發包方是房地產企業，則其甲供材成本在計算繳納土地增值稅時還進行了兩次扣除。在稅務部門的稽查中，發包方很可能會被認為存在重複多計成本，騙取國家稅款的嫌疑，不但要轉出多抵扣的增值稅進項稅額，補繳相應的企業所得稅，還要接受罰款和滯納金等行政處罰。
從施工企業的角度來看，發票管理環節易產生稅務風險。如果施工企業選擇一般計稅方法，卻無法獲取甲供材成本的相應增值稅專用發票，只能獲得領用甲供材的領料清單，其進項稅額抵扣就可能出現問題。
此外，還有個問題值得關注。根據《企業所得稅法》規定，企業實際發生的與取得收入有關的、合理的支出，是准予在計算應納稅所得額時扣除的。但實務中，不少施工企業因只有領料清單，而無法合規管理甲供材成本發票，未能將該部分成本在企業所得稅稅前扣除。
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