夏季，天氣逐漸炎熱，細菌滋生的速度加快。溫室又溼又暖，環境也長期處於封閉狀態，在這樣環境中的溫室龜容易感染細菌，導致患病。為避免龜患病，溫室需要定期進行清潔消毒。
1、當發現溫室龜批量性感染病菌發病時，要把病龜逐一挑出隔離治療。同時把溫室溫度逐漸降至25攝氏度左右（如果溫室溫度設置為30攝氏度，那麼每天就把溫室溫度降低一度，直至溫度降到25攝氏度）。降低溫度可以減少病菌滋生繁殖的速度，降低在治療病龜時，病龜反覆感染病菌而不能康復。
2、在溫室準備兩瓶白醋、煲中藥的鍋，把白醋放在鍋裡，加熱至沸騰（此過程在溫室中進行），然後把沸騰的醋放置在溫室四角，直至醋味全部消失。在龜發病後，要每日進行一次溫室燻醋，連續進行一星期。燻醋可以消毒溫室，消除溫室的異味。
3、沒有發病但與病龜同處在同一溫室的龜則每天用清瘟解毒液浸泡30分鐘，然後再轉用清水飼養，連續浸泡一星期。可以有效降低龜發病的幾率。
4、養殖者幫病龜治療完畢後，要用75%的酒精消毒雙手，在觸碰沒有發病的龜。這樣做可以有效地避免病菌交叉感染，而使健康的龜患病。同時亦可以避免養殖者因觸碰完病龜後再觸摸自己五官，病毒經由五官進入人體，引起人患病。
5、正所謂“病從口入”，餵食臺長期浸泡在溫暖的水中，又是龜友們換水時經常忽略的隱患地帶，這樣的環境是寄生蟲繁衍後代的好地方，所以確保食物無菌和定期清理餵食臺是溫室龜健康成長的關鍵。
6、通常溫室龜一天喂一餐，換水兩次。在換水的過程中，很難避免水會濺溼地面，而很多龜友並沒有及時清理地面，而是認為溫室裡那麼溫暖的環境，地面的水會自然蒸發掉，可是細菌剛好就鑽了這個空子，開始壯大自己的軍團。
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