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Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip(850K甲基化芯片)服務
助力科研,暢“研”一夏
3500RMB/樣本
一個樣本起!
<table><tbody>
中科普瑞850K芯片服務 3500 RMB豪華套餐
實驗服務(含)
芯片實驗(*不含樣本抽提)
基礎分析(含)
數據質控
1. 樣本的β值密度曲線
2. 各樣本的β值箱線圖
3. 樣本相關性圖
4. PCA圖
差異篩選
1. 標準化後的甲基化位點總表
2. 差異甲基化位點(DMP)列表
3. 差異甲基化區域(DMR)列表
4. 差異甲基化位點的染色體分佈圖
5. 差異甲基化位點熱圖/散點圖/火山圖
功能註釋
1. DMP對應基因的GO和KEGG富集
2. DMR對應基因的GO和KEGG富集
高級分析(含)
1. Functional Epigenetic Modules分析
2. 拷貝數變異分析
3. 甲基化與表達譜的關聯分析(有對應表達譜數據)
高級分析
(收費項目,不含)
1. 多組學關聯分析
2. WGCNA分析
3. EWAS分析
4. 機器學習
5. Meta分析
6. 其它可定製高級分析
部分高級分析展示
850k芯片技術特點
1. 全面的基因組覆蓋範圍:檢測>853,000個CpG位點,全面覆蓋CpG島、啟動子、編碼區、開放染色質和增強子。此外還包括CpG島外的CpG位點,已知DMR位點,脫氧核糖核酸酶超敏位點以及miRNA啟動子區域;
2. 高質量的數據:同時採用Infinium I及II探針設計,使檢測範圍最大化;
3. 分辨率高:單鹼基分辨率,可以直接檢測到發生甲基化的確切位點;
4. 重複性高: 自身技術重複相關性R2> 0.98 ;與450K交集探針間(850K vs 450K)相關性R2> 0.98;
5. 起始模板量低:僅需 250 ng,大大節約了樣品量;
6. 檢測樣本類型更廣: 不僅可以檢測全血、細胞、新鮮/新鮮冷凍的組織、而且也可檢測FFPE樣本。
850K芯片與WGBS參數對比
<table><tbody>技術參數
850K芯片
WGBS
檢測物種
人
不受限
檢測原理
重亞硫酸鹽轉化
重亞硫酸鹽轉化
起始量
250 ng
2 μg
分辨率
單鹼基
單鹼基
檢測CpG位點
>85,000
>3,800,000
是否適用於FFPE
適用
不適用
技術重複
R2>0.98
低
實驗週期
20個工作日
30個工作日
實驗費用
3.5K
10K
檢測範圍
已知位點
不受限
數據分析
簡單
困難
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