06.19 中科普瑞-限時推出(3500/樣本)850k芯片服務

點擊上方“轉化醫學網”訂閱我們!

乾貨 | 靠譜 | 實用

Illumina Infinium MethylationEPIC BeadChip(850K甲基化芯片服務

助力科研,暢“研”一夏

3500RMB/樣本

一個樣本起!

中科普瑞-限時推出(3500/樣本)850k芯片服務

<table><tbody>

中科普瑞850K芯片服務 3500 RMB豪華套餐

實驗服務(含)

芯片實驗(*不含樣本抽提

基礎分析(含)

數據質控

1. 樣本的β值密度曲線

2. 各樣本的β值箱線圖

3. 樣本相關性圖

4. PCA圖

差異篩選

1. 標準化後的甲基化位點總表

2. 差異甲基化位點(DMP)列表

3. 差異甲基化區域(DMR)列表

4. 差異甲基化位點的染色體分佈圖

5. 差異甲基化位點熱圖/散點圖/火山圖

功能註釋

1. DMP對應基因的GO和KEGG富集

2. DMR對應基因的GO和KEGG富集

高級分析(含)

1. Functional Epigenetic Modules分析

2. 拷貝數變異分析

3. 甲基化與表達譜的關聯分析(有對應表達譜數據)

高級分析

(收費項目,不含)

1. 多組學關聯分析

2. WGCNA分析

3. EWAS分析

4. 機器學習

5. Meta分析

6. 其它可定製高級分析

/<tbody>/<table>中科普瑞-限时推出(3500/样本)850k芯片服务

部分高級分析展示

850k芯片技術特點

1. 全面的基因組覆蓋範圍:檢測>853,000個CpG位點,全面覆蓋CpG島、啟動子、編碼區、開放染色質和增強子。此外還包括CpG島外的CpG位點,已知DMR位點,脫氧核糖核酸酶超敏位點以及miRNA啟動子區域;

2. 高質量的數據:同時採用Infinium I及II探針設計,使檢測範圍最大化;

3. 分辨率高:單鹼基分辨率,可以直接檢測到發生甲基化的確切位點;

4. 重複性高: 自身技術重複相關性R2> 0.98 ;與450K交集探針間(850K vs 450K)相關性R2> 0.98;

5. 起始模板量低:僅需 250 ng,大大節約了樣品量;

6. 檢測樣本類型更廣:

不僅可以檢測全血、細胞、新鮮/新鮮冷凍的組織、而且也可檢測FFPE樣本。

850K芯片與WGBS參數對比

<table><tbody>

技術參數

850K芯片

WGBS

檢測物種

不受限

檢測原理

重亞硫酸鹽轉化

重亞硫酸鹽轉化

起始量

250 ng

2 μg

分辨率

單鹼基

單鹼基

檢測CpG位點

>85,000

>3,800,000

是否適用於FFPE

適用

不適用

技術重複

R2>0.98

實驗週期

20個工作日

30個工作日

實驗費用

3.5K

10K

檢測範圍

已知位點

不受限

數據分析

簡單

困難

/<tbody>/<table>

聯繫我們:

中科普瑞-限时推出(3500/样本)850k芯片服务

上海鯨舟基因科技有限公司(中科普瑞科研服務控股子公司)

址:上海康新公路3399弄19號樓A區200120

話:021-58086128

Email:market@sinomics.com


分享到:


相關文章: