当年，崔永元还在央视，主持过《实话实说》、《小崔说事》等节目，而功成名就，名扬天下。
5月份，崔永元因《手机》影射而与冯大裤子、刘震云结仇，得知对方又要续拍《手机2》炮火大开：在微博上不停的骂冯小刚和刘震云， 随后曝出了演员范冰冰4天6000万阴阳合同，从而引发娱乐圈地震，各路明星、影视公司大逃亡。
在与范冰冰等娱乐圈炮火大战中取胜的崔永元如同一名不知疲倦的斗士，时刻准备着再次揭起波浪。万万没想到，不识趣的死对头方舟子站了出来。方舟子以一个化学生物博士的身份参加到了《手机2》的评价中，暗讽崔永元、力挺冯小刚和范冰冰的《手机2》。
对此，崔永元丝毫不怕，调转火炮公开向方舟子宣战。
崔永元是出了名敢说话的人。在2013年时，有媒体报道“方舟子发起品尝转基因玉米活动”，实际上该活动是基因农业网发起的，而当时还在央视工作的主持人崔永元在网络上发表了评论，他说道“转基因食品，你吃吗，你可以选择吃，我可以选择不吃。你可以说你懂“科学”，我有理由有权利质疑你懂的“科学”到底科学不科学。你可以说我白痴，我也可以说你白吃”。由此引发方舟子和崔永元的一场争论。
2013年9月，方舟子、崔永元由“转基因食品能不能吃”开始争论，后来上升到质疑对方的语言逻辑问题、有无资格科普问题等。不久，双方的辩论升级成“互骂”，且愈演愈烈。
2014年1月21日，方舟子称崔永元发表的微博内容侵犯了自己的名誉权，将其诉至北京市海淀区人民法院，要求停止侵权、赔礼道歉、赔偿精神抚慰金等30余万元。在案件审理过程中，崔永元以方舟子发表的微博言论亦侵犯其名誉权，在举证期限内向海淀法院提起反诉，请求法院判令方舟子删除侵权微博信息，赔礼道歉、消除影响、恢复名誉，赔偿精神损害抚慰金和经济损失共计67万元。
2015年底，方舟子与崔永元转基因事件的官司也有了结果，虽然双方被判互赔4.5万元，但从这次辩论战中，我们可以看到方舟子渐渐落入败局，是因为他根本没有底气，他自己不可能去吃转基因食品，只是倡议别人吃，焉能不败。
崔永元公开宣战方骗子，得到上百万网友炮火支持。众多网友纷纷跑到方舟子旗下高举大旗力顶崔永元向方舟子宣战。此次身遭炮火攻击的方舟子不知道如何应对，不知道其又将何去何从？
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