“COVID-19”科研动态监测每日快报(2月12日)【中国科讯】

“COVID-19”科研动态监测每日快报(2月12日)【中国科讯】

“COVID-19”科研动态监测服务

中国科学院武汉文献情报中心和中国科学院文献情报中心共同组成生物安全情报团队,构建了“COVID-19”科研动态监测平台,持续对国内外“COVID-19”重要科研动态开展监测,旨在通过提供最新科研论文线索、摘译科研论文主要内容,按病毒溯源、流行预测、病毒检测和疾病诊断、药物研发、机理研究、政策法规等领域整理国内外重要机构的研究成果,为我国的科研攻关和相关科学研究提供参考。

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http://stm.las.ac.cn/STMonitor/qbwnew/openhome.htm?serverId=172

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“COVID-19”科研动态监测每日快报(2月12日)【中国科讯】

信息名称

Science评论文章称,世界多家实验室已在竞相开发抗体试剂盒以发现隐形冠状病毒感染者

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

Science期刊

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事件概要:

2月10日,Science杂志上发表了一篇题为“Labs scramble to spot hidden coronavirus infections”的评论文章。文章称,当前由中国武汉传播的新型冠状病毒引起的全球病例和死亡人数的精确统计似乎掩盖了一个令人震惊的事实:全世界都对该流行病的真实规模和速度一无所知,因为现有的检测能力有限,检测也过于零散。英国Wellcome Trust基金会负责人Jeremy Farrar发出警告说到,“我们低估了这种病毒感染的程度”。

当前检测试剂盒存在一定局限性

在1月11日中国公布了新冠病毒序列的几天后,科学家们即开发出了能够检测人体内冠状病毒基因序列的试剂盒。截至1月28日,中国国家药品监督管理局已批准了5家公司的诊断试剂盒。然而,如今似乎没有足够的试剂盒能跟上飞速增长的病例数量,世界一些地区可能缺乏足够的可使用试剂盒的训练有素的实验室人员。许多新闻也报道湖北诊断资源缺乏。最近刚从中国回来的哥伦比亚大学流行病学家Ian Lipkin说:“他们已经不知所措了。”湖北的检测主要集中在重症并需要就医的人群上,因此成千上万的较轻病例可能还没有被发现。在湖北以外的地方,测试甚至更不完善。

类似的问题在其他地方也存在。非洲疾病控制和预防中心负责人称,非洲最初只有两个实验室能够检测这种病毒,自上周以来,来自15个非洲国家的实验室工作人员已被培训如何使用一种基于PCR分析的新型病毒检测方法。即使在美国,试剂盒也供不应求。法规要求美国CDC提供所有检测,但该机构从2月5日才开始提供试剂盒,到目前为止也只提供了200个试剂盒,每个试剂盒最多能做800个检测。

世界多家实验室已在竞相开发抗体试剂盒

现有试剂盒检测方法是基于在鼻咽拭子或从肺部收集的液体中寻找病毒基因片段,所以只有在有人主动感染时才起作用。因此,科学家仍在努力检测血液中的抗病毒抗体,这可能有助于找到那些感染并康复的人群。

当前,包括著名的流行病学科学家W.Ian Lipkin教授的实验室在内的许多实验室都在竞相开发抗体检测方法。此方法使用病毒表面蛋白,或者Lipkin实验室使用一系列肽来捕获血液中针对新冠病毒的抗体。该抗体检测方法可以在人体血液样本或可能自然感染的动物中寻找感染的证据,可能有助于确定病毒爆发的地点和时间,以及病毒的原始来源。

但一项新的检测必须用感染者的血液来验证。据悉,美国CDC更倾向于在患者发病后等待3周,让血液中的抗体水平升高,目前美国有一个病例已经达到21天。荷兰鹿特丹伊拉斯谟大学医学中心一个研究小组预计下周将启动其第一个抗体检测研究。可能还要再过几个星期,才会有公司能开发并生产出更多的抗体试剂盒。

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附件:

原文链接:

https://www.sciencemag.org/news/2020/02/labs-scramble-spot-hidden-coronavirus-infections

信息名称

WHO将目前流行的新冠病毒疾病正式命名为COVID-19

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

Nature网站

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事件概要:

Nature于2020年2月11日在线发表题为“Coronavirus latest: WHO officially names disease COVID-19”的报道。

报道称,2019年12月在中国武汉市出现一种新病毒,该病毒感染了成千上万的人,并杀死了1000多人。它是一种冠状病毒,与引起严重急性呼吸道综合症(SARS)的病原体属于同一家族。世界卫生组织(WHO)将由该病毒引起的疾病正式命名为COVID-19。这将取代过去几周中针对该新兴疾病的各种绰号和标签。2月8日,中国国家卫生健康委员会决定暂时将该病称为新型冠状病毒性肺炎,简称NCP。但是,由于病毒继续从动物传播到人类,因此这种冠状病毒不会长期保持新颖。世界卫生组织首席科学家Soumya Swaminathan在新闻发布会上表示,COVID-19代表2019年发现的冠状病毒疾病,这种命名方式将为未来新的冠状病毒疾病提供一种命名格式。WHO宣布该疾病的正式名称后不久,引起该疾病的病毒被国际病毒分类学委员会命名为SARS-CoV-2。该委员会在bioRxiv发表的论文中指出,该术语强调了该新病毒与2003年发现的SARS病毒的相似性。

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附件:

原文链接:

https://www.nature.com/articles/d41586-020-00154-w

信息名称

新型冠状病毒2019-nCoV的刺突蛋白包含同一分支的冠状病毒中不存在的类弗林蛋白酶切割位点

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时间:

2020年2月10日

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机构或团队:

法国艾克斯-马赛大学、加拿大蒙特利尔临床研究所

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事件概要:

法国和加拿大的研究人员在Antiviral Research杂志上在线发表论文“The spike glycoprotein of the new coronavirus 2019-nCoV contains a furin-like cleavage site absent in CoV of the same clade”。

2019年,中国武汉出现了一种新的感染人类的冠状病毒(2019-nCoV)。该病毒的基因组已被测序,基因组信息迅速发布。尽管与SARS冠状病毒和类SARS冠状病毒的基因组序列高度相似,但研究人员在2019-nCoV的Spike蛋白中发现了一个独特的类弗林蛋白酶切割位点,而其他类SARS冠状病毒则没有。研究讨论了该酶切位点在病毒周期、致病性中可能的功能作用及其在抗病毒药物开发中的潜在意义。主要结论如下:

(1)2019-nCoV的基因组序列表明该病毒与b系β-冠状病毒聚集。

(2)该蛋白序列具有一个在b系冠状病毒(包括SARS-CoV序列)中不存在的特定类弗林蛋白酶切割位点。

(3)类弗林蛋白酶切割位点可能在病毒的生命周期和致病性中起作用。

(4)开发抗2019-nCoV治疗剂的研究活动应包括对弗林蛋白酶抑制剂的评估。

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附件:

原文链接:

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0166354220300528

信息名称

α-酮酰胺作为冠状病毒和肠病毒复制的广谱抑制剂

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

德国吕贝克大学、上海药物研究所、德国路德维希·马克西米利安斯大学、比利时鲁汶大学、荷兰莱顿大学医学中心等

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事件概要:

德国吕贝克大学于2020年2月10日在bioRxiv上发表题为“Alpha-ketoamides as broad-spectrum inhibitors of coronavirus and enterovirus replication”的文章。

冠状病毒的主要蛋白酶和肠病毒的3C蛋白酶具有相似的活性位点结构,对底物P1位置的谷氨酰胺具有独特要求。由于其特异性以及在病毒聚合蛋白加工中的重要作用,这些蛋白酶可以作为开发抗病毒药物的合适靶标。为了获得针对α冠状病毒,β冠状病毒和肠病毒的近等效的广谱抗病毒药,研究人员基于结构设计拟肽α-酮酰胺作为主要蛋白酶和3C蛋白酶的抑制剂;确定了蛋白酶-抑制剂复合体的六个晶体结构;利用合成的化合物对重组蛋白酶以及病毒复制子和病毒感染细胞培养物进行了测试,大多数没有细胞毒性。事实证明,α-酮酰胺的P2取代基的优化对于获得对这三个病毒属的近等效性至关重要。最佳的近等效抑制剂11u(P2 =环戊基甲基)和11r(P2 =环己基甲基)在细胞培养物对肠病毒、α-冠状病毒和β-冠状病毒显示出较低的微摩尔半数有效浓度EC50值。在Huh7细胞中,11r对MERS冠状病毒表现出三位数的皮摩尔活性。

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附件:

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.10.936898v1

信息名称

佛罗里达大学等分析2019-nCoV的流行病学和临床特征

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

佛罗里达大学、北京大学、北京微生物流行病研究所、山东大学、弗雷德·哈钦森癌症研究中心、中国人民解放军陆军工程大学、中国疾病预防控制中心

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事件概要:

佛罗里达大学等于2020年2月11日在medRxiv上发表题为“Epidemiological and clinical features of the 2019 novel coronavirus outbreak in China”的文章。

研究人员分析了截至2020年1月26日向中国疾病预防控制中心报告的所有2019-nCoV感染患者数据。研究人员比较人口统计学和基线状况之间的发病和死亡发生率,用传播模型估计病死率(CFR)和基本传染数R0。结果显示,截至2020年1月26日,30个省共报告8866例,其中经实验室确诊4021例(45.35%)。近一半的患者年龄在50岁或以上(47.7%)。每10万人中的发病人数存在明显的性别差异,男性为0.31,女性为0.27。平均潜伏期为4.75天(范围:3.0-7.2天)。分别约有25.5%、69.9%和4.5%的患者被诊断出患有严重肺炎、轻度肺炎和非肺炎。总体CFR估计为3.06%(95%CI 2.02-4.59%),但年龄≥60岁、严重肺炎的基线诊断和诊断延迟的男性患者与CFR显著升高有关。在不同的潜伏期和传染期的敏感性分析中,R0估计为3.77(95%CI 3.51-4.05),范围为2.23-4.82。研究指出,与SARS-CoV相比,2019-nCoV具有相当的传播性和更低的CFR。研究人员基于个人监测数据的发现,强调在症状发展为严重肺炎之前及早发现老年患者,尤其是男性患者的重要性。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.10.20021675v1

信息名称

湖北省封锁导致武汉和北京2019-nCoV出现不同的传播动态

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

中国科学院动物研究所、兰州大学

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事件概要:

中国科学院动物研究所等于2020年2月11日在medRxiv上发表题为“The lockdown of Hubei Province causing different transmission dynamics of the novel coronavirus (2019-nCoV) in Wuhan and Beijing”的文章。

文章指出,自2019年底出现新型冠状病毒(2019-nCoV)疫情之后,许多研究人员报告了预测的病毒传播动态。然而,在严格的控制政策下,新型冠状病毒并没有在湖北省以外自然地传播,而且没有一个预测与实际情况相符。研究人员使用传统的SEIR模型,充分估计了控制措施的效果,以预测武汉和北京的病毒传播情况。研究人员预测,2019-nCoV疫情将分别于3月10日在武汉和3月31日在北京达到高峰。在传播的高峰期,北京的传染性人数比武汉的传染性人数要少得多(仅为0.3%)。湖北省的封锁暂停了2019-nCoV在全国和全球的爆发。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.09.20021477v1

信息名称

香港理工大学基于中国大陆手机数据预测2019-nCoV流行趋势

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

香港理工大学、中国城市规划设计研究院、深圳大学、北京师范大学

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事件概要:

香港理工大学等于2020年2月11日在medRxiv上发表题为“Spatially Explicit Modeling of 2019-nCoV Epidemic Trend based on Mobile Phone Data in Mainland China”的文章。

文章指出,截至2020年2月7日,中国大陆确诊2019-nCoV感染病例总数达到34,546例,其中722例死亡,2,050例康复。尽管中国大多数城市已有确诊病例,但城市的流行动态尚不清楚。研究人员在城市层面模拟2019-nCoV的流行动态,并预测中国大陆在不同情景下的流行趋势。研究使用手机数据并修改了经典的流行病学易感-传染-恢复(SIR)模型,以考虑中国大陆2019-nCoV疫情的几个独特特征。研究人员使用从1月25日到2月1日的确诊病例对修改后的SIR模型进行训练,并通过2020年2月2日收集的数据进行验证。2月2日新感染病例的预测准确性(R2=0.94,RMSE=18.24)高于使用经典SIR模型(R2=0.69,RMSE=40.18)。研究人员使用经过训练的模型来预测不同情景下未来30天(直到2020年3月2日)的流行趋势,包括保持早期趋势,像2003年的SARS一样成功地控制疾病,因工作/学校恢复增加人与人之间的联系三种情景。结果表明,在上述三种情景下,到2020年3月2日,中国大陆的总感染人数将分别为1053万、15万和41万,控制病毒传播的城市分别为67%、100%、91%。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.09.20021360v1

信息名称

2019-nCoV疫情暴发的流行趋势分析及风险评估

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

东南大学

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事件概要:

2月11日,medRxiv预印本上发表了一篇来自中国东南大学研究团队的题为“EPIDEMIC TRENDS ANALYSIS AND RISK ESTIMATION OF 2019-NCOV OUTBREAK”的文章,对2019-NCOV疫情暴发的流行趋势及风险进行了评估。

文章中收集了截止2020年2月6日报告的确诊NCIP病例的人口学特征、暴露史和发病时间数据。针对我国春节期间人口大量迁移的问题,文章提出了一个流动SEIR模型(Flow-SEIR)来进行实证分析。文中使用百度移民的数据(网址:http://qianxi.baidu.com/)估算了2020年2月10日至28日假期后重返工作岗位的移民人数,并结合确诊病例数据,确定并估计了从家到工作场所的移民返回风险。

文章主要研究结果有:(1)预计2月7日至2月9日,每日新增病例数达到峰值水平,即全国疫情拐点时间。拐点过后,感染人数增长将变缓慢,疫情将逐步得到控制。湖北省确诊病例预测峰值可达62800例(56900-70300,0.95 CI)。湖北的高峰时间是2月29日(2月25日-3月08日,0.95 CI)。除湖北外,其余地区高峰到达时间为2020年3月8日至3月15日。从高峰到疫情结束大约需要1.5-2个月。大多数省份的预测峰值都小于1000。2020年3月至2020年6月疫情将基本稳定。(2)湖北省感染患者的估计数呈现出一个锋芒陡峻的特点,呈现出疫情趋于一致的总体趋势。(3)必要的自我保护和隔离意识对防疫工作十分有效,可以减少近90%的病人数量。自我保护和隔离的效果强于交通管制政策。省级交通管制只能缓解21.06%-22.38%。(4)疫情预警非常重要。在文章实验和分析环境下,结果表明如果提前1天及时实施城市封锁,全国最终将减少约3600人;如果延误1天,大约增加1800人感染。(5)假设假阴性患者率为50%,潜在传播率为确诊患者的1-4倍,则感染人数的实际峰值可能在214400-472500之间。假设假阴性患者的传播率是确诊患者的两倍,如果假阴性率在一周内下降5%,患者峰值将下降11.62%,而如果一周内减少10%,高峰病人数将减少21.91%。说明及时发现假阴性人群对疫情控制更为有效。(6)在不加控制条件下,春运返城将加剧疫情,特别是广东、浙江、江苏、湖南、河南、上海、福建和北京。文章由于没有可用的初始数据,没有进行2019-nCoV的全球传播分析和评估。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.09.20021444v1

信息名称

加州大学评估美国2019-nCoV亚临界传播的合理性

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

加州大学旧金山分校

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事件概要:

2月11日,medRxiv预印本上发表了一篇来自加州大学旧金山分校的题为“Assessing the plausibility of subcritical transmission of 2019-nCoV in the United States”的文章,提出了一个简单的方法来确定2019-nCoV病毒繁殖数的置信区间上限是否超过在美国地方性传播的置信区间上限。

截至2020年2月7日,美国的病例数据支持2019-nCoV的亚临界传播,而非持续传播。然而,如果在尚未确定由人传人引起的症状前病例情况下,这一结论可能会改变。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.08.20021311v1

信息名称

加州大学评估美国2019-nCoV亚临界传播的合理性

1

时间:

2020年2月11日

2

机构或团队:

加州大学旧金山分校

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事件概要:

2月11日,medRxiv预印本上发表了一篇来自加州大学旧金山分校的题为“Assessing the plausibility of subcritical transmission of 2019-nCoV in the United States”的文章,提出了一个简单的方法来确定2019-nCoV病毒繁殖数的置信区间上限是否超过在美国地方性传播的置信区间上限。

截至2020年2月7日,美国的病例数据支持2019-nCoV的亚临界传播,而非持续传播。然而,如果在尚未确定由人传人引起的症状前病例情况下,这一结论可能会改变。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.08.20021311v1

信息名称

国内和国际旅行限制对2019-nCoV疫情传播的影响

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

美国波士顿东北大学、意大利布鲁诺凯斯勒基金会和ISI基金会、美国NIH福格蒂国际中心、中国复旦大学、美国华盛顿大学、佛罗里达大学

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事件概要:

2月10日,medRxiv预印本上发表了一篇美国、意大利和中国联合团队的题为“The effect of travel restrictions on the spread of the 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) outbreak”的文章。

文中使用全球集合种群(metapopulation)疾病传播模型来预测国内和国际旅行限制对2019-nCoV在国内和国际传播的影响。该模型是在武汉市实施旅游检疫前,根据国际进口数据进行校准的。假设繁殖间隔时间为7.5天,文中估计的生殖数量为2.4[90%CI:2.2-2.6]。2020年1月23日,旅行禁令实施前,武汉市和中国大陆其他地区的病例估计中值分别为58956例(90%可信区间40759-87471例)和3491例(90%可信区间1924-7360例)。

该模型显示,截至1月23日,我国大部分城市已经出现了相当数量的感染病例,而旅游检疫仅推迟了3-5天的整体疫情进展。在国际范围内,旅行检疫的影响更为显著,据文中估计,到2月底,入境病例数量将减少80%。模拟结果还表明,继续保持90%的往返中国大陆的旅行限制,只会轻微影响流行病的传播轨迹,除非减少50%或更高的社区传播率。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.09.20021261v1

信息名称

评估2019-nCoV病毒在中国的传播速度

1

时间:

2020年2月8日

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机构或团队:

北京大学国际数学研究中心

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事件概要:

北京大学国际数学研究中心科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Estimation of the Time-Varying Reproduction Number of 2019-nCoV Outbreak in China”,文章利用三种数学模型评估了2019-nCoV新冠病毒在中国的传播速度。

结果显示,相比基本传染数R0,采取控制措施后传染数Rc显著降低,但仍大于1,因此需采取更多措施阻断该病毒的进一步传播。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.08.20021253v1

信息名称

基于大数据追踪2019-nCoV病毒的传播速率

1

时间:

2020年2月7日

2

机构或团队:

兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室/创新生态研究所

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事件概要:

兰州大学草地农业生态系统国家重点实验室/创新生态研究所研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Tracking the spread of novel coronavirus (2019-nCoV) based on big data”,文章利用大数据评估了2019-nCoV新冠病毒在中国的传播速率。

该文章基于百度地图的交通流量数据,以及从 1 月 1 日到 1 月 26 日离开武汉的航空乘客数量,计算潜在的感染人群。研究开发了以当地人口和航空旅客为预测变量的多个线性模型来解释中国每个城市确诊病例的差异。结果显示,来自武汉的航空旅客的输入逐渐减少,但当地人口的影响却在增加,表明了新冠病毒在本地传播的趋势。目前阶段,由于政府和社区采取了极为严格的防控措施,当地的新型冠状病毒感染肺炎病例增长缓慢。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.20021196v1

信息名称

马来西亚2019-nCoV的传播动态

1

时间:

2020年2月7日

2

机构或团队:

马来西亚沙捞越大学计算机科学与技术学院

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事件概要:

马来西亚沙捞越大学计算机科学与技术学院在medRxiv预印版平台发表论文“Transmission dynamics of 2019-nCoV in Malaysia”。

文章基于SEIR隔间模型开发了一种数学预测模型,旨在通过模拟2019-nCoV在马来西亚感染当地人后的传播动态,研究2019-nCoV的流行病学特征。在完全易感人群中引入单个病例的情况下,该模型能够预测下一个确诊病例。文章通过对获得的方程组进行了数值求解,并对仿真结果进行了分析,分析结果包含不采取防控措施导致的疾病影响。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.20021188v1

信息名称

通过隔离病例和接触者防控2019-nCoV爆发的可行性

1

时间:

2020年2月8日

2

机构或团队:

伦敦卫生与热带医学学院传染病数学建模中心

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事件概要:

伦敦卫生与热带医学学院传染病数学建模中心在medRxiv预印版平台发表论文“Feasibility of controlling 2019-nCoV outbreaks by isolation of cases and contacts”。

文章研发了一种随机传播模型,量化隔离病例以及接触者在防控2019-nCoV疫情方面的潜在有效性。结果表明:(1)5个初始病例模拟爆发时,即使可追踪的接触者数量不足,也可以控制基本传染数R0为1.5,且在症状发作之前几乎没有传播;(2)随着初始病例数的增加,控制爆发的前景会显著下降,R0越高,在症状发作之前有更多的传播途径;(3)在不同的初始案例数量中,即使只追踪到小于50%的接触者,R0为1.5的情况下都是可控的;(4)对于R0为2.5和3.5的,必须分别追踪到至少70%和90%以上的接触者,才能控制大多数的爆发。研究指出,症状发作和隔离之间的延迟对于疫情爆发以及R0值的大小具有非常重要的作用。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.08.20021162v1

信息名称

2019-nCoV型新型冠状病毒具有比最初估计更高传染性和感染性

1

时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

美国洛斯阿拉莫斯国家实验室

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事件概要:

美国洛斯阿拉莫斯国家实验室的研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“The Novel Coronavirus, 2019-nCoV, is Highly Contagious and More Infectious Than Initially Estimated”,介绍了2019-nCoV型新型冠状病毒具有比最初估计更高传染性和感染性。

新型冠状病毒(2019-nCoV)是一种新近出现的人类病原体,自2020年1月以来已广泛传播。最初,基本生殖数R0估计为2.2至2.7,该文章中科研人员提供了该数量的最新估算,其收集了广泛的个案报告,并估计了主要的流行病学参数,包括潜伏期,将这些估算值以及高分辨率的实时人类旅行和感染数据与数学模型相结合,科研人员估计早期流行期间的被感染人数每2.4天翻一番,R0值很可能介于4.7和6.6之间。此外,科研人员进一步表明,仅对有症状的人进行检疫和接触追踪可能无效,并且需要尽早采取强有力的控制措施来阻止病毒的传播。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.20021154v1.full.pdf

信息名称

从基因组序列的信息令牌复发网络可能揭示流行病暴发中的隐藏模式:以2019-nCoV冠状病毒为例

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时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

惠灵顿维多利亚大学

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事件概要:

新西兰惠灵顿维多利亚大学的科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Networks of information token recurrences derived from genomic sequences may reveal hidden patterns in epidemic outbreaks: A case study of the 2019-nCoV coronavirus.”,通过建模来分析流行病爆发的时间动态。

在应对流行病暴发时,分析病毒的遗传进化和动态传播至关重要。该文章旨在设计新颖的方法来建模,可视化和分析流行病暴发的时间动态,以帮助研究人员和参与危机应对的其他人做出明智和有针对性的决定,从而决定可能从哪些地理位置和时间段获取更多的遗传样本来充分了解爆发情况。该文章介绍的方法依赖于将先验信息级联应用于一组按时间顺序排列的核苷酸序列,并将其应用于在当前正在进行的新型2019-nCoV冠状病毒爆发期间收集的真实数据。科研人员评估了表征所得复杂网络的信息理论和网络理论方法,并提出了遗传学家和流行病学家感兴趣的、需要更深入研究的接触点和时间途径。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.07.20021139v1.full.pdf

信息名称

腹泻症状可能在2019年新型冠状病毒诊断中被低估

1

时间:

2020年2月11日

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机构或团队:

中山大学,广东省肝病研究重点实验室,香港中文大学,中山大学附属第三医院,河北医科大学第二医院等

3

事件概要:

科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Diarrhea may be underestimated: a missing link in 2019 novel coronavirus”,讨论了腹泻也可能是2019-nCoV感染的指标之一。

文章提到,中国武汉市报道了由2019年新型冠状病毒(2019-nCoV)引起的肺炎暴发,但是,不同的报道中临床症状有所不同。根据组间差异测试的结果,科研人员发现最近三份报告中的腹泻发生率有所不同,由于2019-nCoV利用与严重急性呼吸系统综合症冠状病毒(SARS-CoV)相同的细胞进入受体ACE2,而ACE2紧密控制肠道炎症,以追踪2019-nCoV介导的感染途径,因此科研人员使用了单细胞RNA测序数据进行分析,发现ACE2 mRNA在健康的人小肠而非肺中高表达。此外,单细胞RNA测序数据显示ACE2在小肠上皮暴露于外源病原体的近端和远端肠上皮细胞中明显升高。因此,科研人员怀疑当人们食用受感染的野生动物时,表达ACE2的小肠上皮细胞可能易受2019-nCoV感染,而腹泻可能是感染的指标,这表明临床医生应在肺炎爆发期间更加重视腹泻患者。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.03.20020289v1.full.pdf

信息名称

估算从武汉撤离的航班乘客中新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的无症状比率

1

时间:

2020年2月11日

2

机构或团队:

北海道大学,大阪公共卫生学院

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事件概要:

日本科研人员在medRxiv预印版平台发表论文“Estimation of the asymptomatic ratio of novel coronavirus (2019-nCoV) infections among passengers on evacuation flights”,其估算了从武汉撤离的航班乘客中新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的无症状比率。

文章指出,共有565名日本公民从中国武汉撤离到日本,科研人员对所有乘客进行了症状筛查,并进行了逆转录聚合酶链反应测试,确定了4名无症状和4名有症状的乘客,其2019-nCoV呈阳性,筛选结果表明无症状比率为50.0%。

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附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.02.03.20020248v1.full.pdf

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