在我國的廈門、青島以及地中海、馬來西亞、日本、北美洲等地的附近海面，生活著一種珍貴稀有的文昌魚。文昌魚是一種十分珍貴的動物。文昌魚雖然叫魚，但它並不屬於魚類，它是介於無脊椎動物和脊椎動物之間的動物，而更趨向於脊椎動物，是比魚類低等的動物。
它和一般的魚不同，沒有頭，也沒有脊椎骨、鱗片和眼睛。身體前端的腹面有口，口周圍生有幾十條觸鬚。體形似小魚，身軀柔軟側扁，而且是半透明的。文昌魚是很小的海洋動物，我國廈門出產的品種只有4——5cm長度。
最大的文昌魚是美國產的加州文昌魚，體長也不過10cm。文昌魚沒有胸鰭和腹鰭，只有背鰭、尾鰭和臀鰭。白天它躲在海底泥沙中，露出半個身子，搖搖擺擺，依靠水流帶來的浮游生物作食物。
文昌魚對生活環境要求很高，喜歡在較松的沙礫地生活，沙砂中最好混有少量的貝殼碎片、棘皮動物的碎骨片，以便於它的鑽動和呼吸。它的生存還需要其他的條件，如海水要有一定的鹹度，水溫也要冷暖適當，水流不宜太急，風浪不能太大等。
由於對環境條件的這種苛刻要求，文昌魚繁殖得很少，物種十分珍貴。但更重要的是，文昌魚是從低等動物進化到高等動物的一個重要過渡類型，是動物進化史中的活化石，文昌魚具有脊椎動物所有的磷酸肌酸物質，但卻不具備脊椎動物所有的血紅蛋白和鐵的化合物，文昌魚含有一種特殊的釩的元素。在科學研究中有重要意義，因而受到人們的重視。
文昌魚得名於廈門劉五店海嶼上的文昌閣。這裡是我國最先發現文昌魚群的地方。
在我國廈門的劉五店鱷魚島附近曾流傳著一個傳說：古代，文昌皇帝騎著鱷魚過海時，在鱷魚口裡掉下許多小蛆，當這批小蛆落海之後，竟變成了許多像魚一樣的動物。為紀,念文昌帝君，取名為文昌魚。此傳說固不可信，但也顯示人民對祖國特產的崇愛和純樸的想象力。
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