糖原代謝調控與糖原顆粒結構密切相關

糖原代謝的調控主要通過糖原合酶（GS）與糖原磷酸化酶（GP）的活性調控進行。二者均受典型的PKA和PKC控制的可逆磷酸化調控，磷酸化後GS活性降低，GP活性升高。

對GP的磷酸化主要由糖原磷酸化酶激酶（PHK）進行，而可以磷酸化GS的激酶卻有很多，包括PKA、PKC、GSK、鈣/鈣調蛋白依賴性蛋白激酶2（CaMPK2）、酪蛋白激酶1（CK1）、酪蛋白激酶2（CK2）、AMPK、含PAS域的絲氨酸/蘇氨酸激酶（PASK）和p38MAPK等。但不同組織中會有所不同，骨骼肌中主要是PKA，PKC，CaMPK2，PHK和CK2。

GS和GP的去磷酸化都由磷蛋白磷酸酶1（phosphoprotein phosphatase1，PP1）催化。PP1是由催化亞基和調節亞基組成的異二聚酶。人類的催化亞基（PPP1c）有三種編碼基因（PPP1CA、PPP1CB和PPP1CC），而調節亞基基因則有20多個。其中一些調節亞基還負責PP1與糖原的結合，所以也稱為糖原靶向蛋白（protein targeting to glycogen，PTG）。骨骼肌的PTG（G_M）由PPP1R3A基因編碼，肝臟PTG（G_L）由PPP1R3B編碼。R3C和R3D則相對普遍表達，也分別稱為R5和R6。另外，PTG也特指R5。

PTG是腳手架蛋白，可將PPP1c與特定糖原代謝酶共定位，從而使GS和GP脫磷酸化，增加糖原合成通量。據報道，在大腦的星形膠質細胞中過表達PTG，可以使糖原積累增加百倍以上，而將其敲低則會導致糖原積累降低50%（IBRO Rep. 2016 Dec; 1: 46–53.）。

糖原對人體非常重要。例如大腦中的糖原不僅作為應急能源儲備，而且也參與大腦的高級活動，如學習、記憶等。所以糖原代謝障礙會導致多種疾病，如糖原累積症（Glycogen

storage diseases (GSD）、拉福拉病（Lafora desease，LD）等。LD的重要特徵是糖原沉積，形成拉福拉小體（LB）；糖原累積症分為十多種亞型，其中大部分也都會發生糖原沉積。

糖原分子巨大，含有5000多個殘基，要溶於水中其實是很困難的，與其結構十分類似的支鏈澱粉就是不溶的。糖原之所以能夠溶於水，與糖原顆粒的獨特結構有關。

一方面，糖原的分支是均勻的，所以最終形成球狀的可溶性分子。而支鏈澱粉的分支是成簇的，分支較少的區域會形成平行排列的螺旋，成為類似晶體的結構而難溶於水。糖原如果分支不足，或GS合成的直鏈過長，就容易產生類似澱粉的結構而沉澱。另一方面，糖原並非獨立存在，而是與多種相關蛋白結合，構成糖原顆粒。

圖中的LF和malin的缺陷都會導致LD。LF是一種磷酸酶（laforin），可以結合到糖原表面。Malin是一種E3泛素連接酶。關於它們與糖原代謝和LD的關係有不同推測，現在看來比較合理的解釋應該是LF與糖原結合後募集malin，泛素化降解PTG和GS，避免產生過長直鏈而沉澱。

糖原合成過程中有時會被GS過度延伸。這樣的長鏈將被磷酸化以防止其纏繞在相鄰鏈上（澱粉降解過程中有類似反應）。磷酸基團會吸引laforin，再募集malin，泛素化並抑制GS。然後，Laforin會除去磷酸基團。

該假設的一個實驗證據是，過表達無磷酸酶活性laforin的laforin缺陷型小鼠體內糖原被過度磷酸化，但既不是長鏈的也不是不溶的，這些小鼠不再形成LB。另一方面，過表達無磷酸酶活性laforin的malin缺乏小鼠中的糖原被過度磷酸化並長鏈化，這些小鼠繼續形成LB（Neuropediatrics. 2018 Dec;49(6):357-362.）。

人體中肝糖原約佔糖原總量的三分之一，肌糖原佔三分之二。兩種組織中的糖原顆粒是不同的。骨骼肌中的稱為β-顆粒，直徑約為20-30 nm，分子量在百萬到千萬級別。肝臟中糖原含量更高，糖原顆粒（α-顆粒）也更大，直徑約100-300 nm，分子量可上億。

肝臟的α-顆粒是由一些β顆粒以西蘭花狀排列形成。β-顆粒代謝迅速，而肝α-顆粒代謝相對較慢。β-顆粒的中央是糖原蛋白（GN），外周是由糖鏈構成的同心層，最多可達12層。根據透射電鏡分析，β-顆粒中還含有更小的γ-顆粒，其直徑約3 nm，富含蛋白質。

一些研究表明，糖原顆粒的初始形成與肌動蛋白構成的細胞骨架有關。首先由GN的C-末端保守結構域DNIKKKL與肌動蛋白纖維結合，然後才會引發合成，再通過GS和GBE不斷延長和分支。

糖原的降解途徑其實有兩種，除經典的胞漿途徑外，還有一個溶酶體途徑，由溶酶體GAA（酸性α-葡萄糖苷酶）催化。這個途徑目前瞭解較少，可能與自噬有關。GAA的遺傳缺陷會導致GSD2（Pompe disease，龐貝病）。