問題一：種植不科學
現象：有些地方多是在每年8月前後種植，到第二年的6月份結束，棚室只有一個多月的時間是閒著的，歇茬期很短。還有不少菜農利用這段時間再種植一茬越夏葉菜，如茼蒿、菠菜等，將這一個月時間利用起來。
分析：棚室常年種植，沒有歇茬期，害處是很多的。一是導致棚室中病蟲害加重，病原一直有寄主存在，環境條件適宜，土壤中的病原菌存活量會大幅增加。二是沒有歇茬期，使得底肥施入時間短，土壤條件惡化快，當前菜農使用最多的幹雞糞、稻殼糞等，大都是未經腐熟或腐熟不完全的，加重了傷根燒苗的幾率，有利於根部病害侵染髮生。
正確做法：每年夏季是處理土壤的最佳時期，菜農應把握這個關鍵時期，對棚室進行徹底消毒、施好底肥，為下茬蔬菜生產打好基礎。
悶棚可以殺滅棚內大量的病原物，包括真菌、細菌、線蟲等，減少病害的發生，有利於蔬菜的生長，是一種低投入又效果好的滅菌方法。對往年有死棵現象的大棚，可使用死棵蔓枯靈。
問題二：悶棚不合理
現象：在高溫悶棚時，不少菜農把棚裡的植株清理完畢以後，將棚室關閉就沒事了，一直等到新苗子來了後再進行翻地種植。這種悶棚方法是存在問題的。
分析：菜農種植蔬菜忙了近一年，等到夏季歇茬期終於能歇歇了，加上夏季氣溫高，尤其是棚內，讓人難以忍受，因此菜農大都不願意到棚裡，農事操作那是越簡單越好，比如高溫悶棚時關閉通風口就不管了。這樣做確實可以殺死殘留在土壤表層的病原菌和蟲卵，但深層土壤中的問題呢，應該如何解決？
正確做法：菜農可以採用幹悶和溼悶相結合的方法進行處理。拔園後，大量的病菌、蟲卵集中在土壤、立柱及牆體的表層，此時關閉通風口並檢查修補好棚膜破損，進行高溫悶棚，中午棚溫可超過60℃，並維持數小時，一週內可以滅除棚內地表多數病原體，這是我們所說的幹悶。
該法簡便易行，是菜農朋友常採用的措施，但這並不是高溫悶棚的全部，此法僅能殺滅棚室表層的病蟲，故仍需結合溼悶，以達到殺菌滅蟲全面、徹底的目的。
幹悶之後，需將土壤深翻30釐米，若不深翻而單採用旋耕機翻地，會造成殺菌、蟲範圍小，土壤深層的病菌和線蟲難以殺滅。然後對棚室進行漫灌，利用水的導熱性高於土的特點，保證土壤耕作層達到更高的溫度。
灌水後覆蓋地膜再進行10-15天的悶棚。有條件的還可在翻地時挖溝，溝施麥糠或麥秸，尤其是土壤板結、鹽害嚴重的棚室，更宜採用該法。
問題三：清園不正確
現象：很多菜農為圖省事，只是將植株莖蔓清理出去，而大量根系仍然留存土壤中腐爛，這種做法潛在危害很大，尤其是重茬種植的情況下，可以說是大忌。
菜農清園的主要目的，是將上一茬蔬菜可能攜帶的大量病原及時清理出棚室，而根系是枯萎病、青枯病、根腐病以及根結線蟲等的主要載體，若不清理根系，則使得清園的效果大打折扣，可以說是留下了根部病害高發的“禍根”。
分析：近幾年，棚室病蟲害發生呈上升趨勢，這些病害的病原菌和蟲卵多是在土壤中完成越冬越夏。
當前，棚室中發生最為嚴重的三大蟲害是薊馬、粉蝨、蟎蟲。拔棚後，蟎蟲等蟲害多在土壤中藏匿或者產卵休眠，成蟲、卵等落到地面上或進入土壤中，土壤中殘留的植株殘體為其生存提供了極大的便利。
蔬菜上經常發生、危害比較嚴重的病害有50餘種，而絕大多數病害都可以通過土壤傳播，病原菌依靠土壤中的病殘體生存，下一茬蔬菜種植時，這就是病害的初侵染源，尤其是各種根腐病、莖基腐病、青枯病、枯萎病和根結線蟲等根部病害已有發生的棚室，更要徹底清理根系。
以根結線蟲為例，拔園時正是消滅根結線蟲的大好時機，可利用此機會將附著在根系上的根結線蟲帶出棚外，剩下的少部分再利用高溫悶棚或者藥劑處理，輕鬆殺滅根結線蟲，增強防治效果。
土壤中的植物殘體少了，其上附著的病原自然也就少了，可大大減少下茬作物感染病蟲害的幾率。拔園後及時清除土壤中的根系，還可減少土壤中自毒物質的數量，減輕重茬危害。
正確做法：拔園時留下10-20釐米的莖稈，先將棵子、地膜、雜草等全部清理乾淨，然後立即用鐵鍬等挖出根系，收集後帶出棚外深埋。根系清理不可拖延時間過長，以免部分根系腐爛後留在土壤中。
之後再利用高溫悶棚或藥劑燻蒸，最大限度地殺滅病原，尤其是已有死棵、根結線蟲等發生的地方，要重點處理，將病蟲基數降到最小，減輕對下一茬蔬菜的威脅。
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