（1）注意苗床澆水
必須在苗床底部薄膜上灌溉，讓水從營養缽底部的排水孔進入營養缽，滋潤營養基質，預防土壤板結、缺氧及秧苗沾染水滴感染病害。
（2）秧苗徒長
尤其在兩片子葉平展到真葉破心期間，是最容易徒長的時期，此期一定要嚴格控溫控水。
（3）苗期病害
溫度不能過高，土壤溼度和空氣溼度不能過大，否則，猝倒病、立枯病極易發生。防治措施：青枯立克200-300倍+地力旺300倍噴霧，殺菌防病，培養有益菌，減少有害菌，營養壯苗。在病害高發期可用青枯立克+大蒜油噴霧。
（4）蟲害
苗床內蠐螬、螻蛄等地下害蟲大量發生時，造成危害，引起死苗。可根據當地農藥經銷商建議用藥。
（5）風乾死苗
未經通風鍛鍊的秧苗，長期處在溼度較大的空間，苗床通風時，冷空氣直接對流，以及覆蓋物被大風吹開，空氣溼度驟然下降造成柔嫩的葉片失水過多，而引起萎蔫，如果萎蔫過久，葉片不能復原，則最後變成綠色乾枯。防治措施：苗床通風時，要在避風的一側開通風口，通風量應由小到大，使秧苗有一個適應過程，大風天氣，注意把覆蓋物壓嚴，防止被風吹開。
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