南京臨時政府，是中華民國成立後不就，孫中山在南京成立的臨時管治機構，也是中華民國成立之後第一個中央政府機構。但是南京臨時政府只存在了約三個月。雖然南京臨時政府在這三個月內取得了重大成就，但是因為領導革命的同盟會存在著巨大弱點，使得南京臨時政府不得不歸於失敗。
在革命形勢複雜化的局面下，更加要求革命政黨要加強統一領導，但是同盟會在這緊要關頭反而更加渙散起來。在武昌起義之後，同盟會跟光復會的矛盾日益加深。同盟會的陳其美跟光復會的李燮和同在上海發動起義。在上海光復之後，陳其美自稱都督，李燮和最初打算帶領部隊攻打陳其美，後來佔據了吳淞，自稱吳淞都督。在南京臨時政府剛成立之後，章炳麟就脫離同盟會，跟立憲派和舊官僚聯合一起，在上海組織中華民國聯合會。
浙江獨立後，光復會的領袖陶成章從南洋回來擔任浙江都督府總參議。然後再上海建立了光復義勇軍練兵籌餉滬局，在上海招兵買馬。滬軍都督陳其美不允許自己的地方出現一隻不是自己的軍隊，於是就指示蔣介石暗殺陶成章。進而使得同盟會跟光復的矛盾再次擴大，章炳麟對南京臨時政府的許多改革措施更加的反對了。章炳麟反對南京建都，實際上他為了反對孫中山，已經站到袁世凱那方面去了。
孫中山對於同盟會跟光復會之間的矛盾，主張盡力調解。但是並沒有解決什麼問題，兩邊仍然紛爭不斷。湖北革命黨孫武等人沒能在南京臨時政府取得部長的席位，也脫離了同盟會，聯合湖北的立憲派組織“民社”，擁黎元洪為領袖。進一步削弱了同盟會的力量。
黃興雖然在早期因為旗幟的問題（青天白日旗和井字旗）產生過分歧，但是在南京臨時政府兩人配合密切，許多事情上都支持孫中山。但是黃興已經有了隱退的意思，他認為只要是漢人當權，革命就算達到目的了。在孫中山主持南京臨時政府的時候，黃興仍是主張跟袁世凱妥協的。
同盟會在辛亥革命後，已經處於混亂、分裂的狀態了，這樣的同盟會當然就不能領導南京臨時政府走向勝利了。
同盟會在土地問題上也存在著重大的失誤，武昌起義和各省響應之後，各地農民自發組織起來的反抗鬥爭極為廣泛。到處發生農民抗租的鬥爭，這些鬥爭都反應出農民對土地的渴望，但是革命黨人不但沒有支持，反而派兵鎮壓。革命黨人對農民自發鬥爭採取了敵視的態度，也就造成了在強大的反革命勢力跟前讓自己處於孤立無援的狀態。
辛亥革命是革清政府的命，清政府又是跟帝國主義一體的。也就是說辛亥革命反對清政府也應該反對帝國主義。但是以孫中山為首的革命派並沒有提出反帝目標和綱領。同盟會沒有，南京臨時政府成立也沒有。在青島的即墨縣被同盟會光復後，根據1898《中德條約》，德國租借青島，劃分德國繭氏的不設防區域。即墨縣就在這個區域內，德國以條約為藉口讓革命黨退兵。清政府接到消息後派人突襲即墨，殺死革命黨三十多人，燒燬附近村莊。當革命軍請求南京臨時政府和德國交涉的時候，南京臨時政府卻拘泥於《中德條約》，孫中山下令革命軍從即墨撤退。
南京臨時政府的這種對待帝國主義的態度，是幻想著能夠像西方學習，取得西方對自己的幫助。但是這僅僅是幻想，南京臨時政府成立後在1月11日、17日、19日連續三次要求列強承認，但是都沒有得到答覆。
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