南京临时政府，是中华民国成立后不就，孙中山在南京成立的临时管治机构，也是中华民国成立之后第一个中央政府机构。但是南京临时政府只存在了约三个月。虽然南京临时政府在这三个月内取得了重大成就，但是因为领导革命的同盟会存在着巨大弱点，使得南京临时政府不得不归于失败。
在革命形势复杂化的局面下，更加要求革命政党要加强统一领导，但是同盟会在这紧要关头反而更加涣散起来。在武昌起义之后，同盟会跟光复会的矛盾日益加深。同盟会的陈其美跟光复会的李燮和同在上海发动起义。在上海光复之后，陈其美自称都督，李燮和最初打算带领部队攻打陈其美，后来占据了吴淞，自称吴淞都督。在南京临时政府刚成立之后，章炳麟就脱离同盟会，跟立宪派和旧官僚联合一起，在上海组织中华民国联合会。
浙江独立后，光复会的领袖陶成章从南洋回来担任浙江都督府总参议。然后再上海建立了光复义勇军练兵筹饷沪局，在上海招兵买马。沪军都督陈其美不允许自己的地方出现一只不是自己的军队，于是就指示蒋介石暗杀陶成章。进而使得同盟会跟光复的矛盾再次扩大，章炳麟对南京临时政府的许多改革措施更加的反对了。章炳麟反对南京建都，实际上他为了反对孙中山，已经站到袁世凯那方面去了。
孙中山对于同盟会跟光复会之间的矛盾，主张尽力调解。但是并没有解决什么问题，两边仍然纷争不断。湖北革命党孙武等人没能在南京临时政府取得部长的席位，也脱离了同盟会，联合湖北的立宪派组织“民社”，拥黎元洪为领袖。进一步削弱了同盟会的力量。
黄兴虽然在早期因为旗帜的问题（青天白日旗和井字旗）产生过分歧，但是在南京临时政府两人配合密切，许多事情上都支持孙中山。但是黄兴已经有了隐退的意思，他认为只要是汉人当权，革命就算达到目的了。在孙中山主持南京临时政府的时候，黄兴仍是主张跟袁世凯妥协的。
同盟会在辛亥革命后，已经处于混乱、分裂的状态了，这样的同盟会当然就不能领导南京临时政府走向胜利了。
同盟会在土地问题上也存在着重大的失误，武昌起义和各省响应之后，各地农民自发组织起来的反抗斗争极为广泛。到处发生农民抗租的斗争，这些斗争都反应出农民对土地的渴望，但是革命党人不但没有支持，反而派兵镇压。革命党人对农民自发斗争采取了敌视的态度，也就造成了在强大的反革命势力跟前让自己处于孤立无援的状态。
辛亥革命是革清政府的命，清政府又是跟帝国主义一体的。也就是说辛亥革命反对清政府也应该反对帝国主义。但是以孙中山为首的革命派并没有提出反帝目标和纲领。同盟会没有，南京临时政府成立也没有。在青岛的即墨县被同盟会光复后，根据1898《中德条约》，德国租借青岛，划分德国茧氏的不设防区域。即墨县就在这个区域内，德国以条约为借口让革命党退兵。清政府接到消息后派人突袭即墨，杀死革命党三十多人，烧毁附近村庄。当革命军请求南京临时政府和德国交涉的时候，南京临时政府却拘泥于《中德条约》，孙中山下令革命军从即墨撤退。
南京临时政府的这种对待帝国主义的态度，是幻想着能够像西方学习，取得西方对自己的帮助。但是这仅仅是幻想，南京临时政府成立后在1月11日、17日、19日连续三次要求列强承认，但是都没有得到答复。
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