一、對吸入空氣的溫度和溼度的調節
吸入氣體的溫化、溼化是保證氣道粘膜纖毛粘液活動正常的重要條件，而上呼吸道尤其鼻腔是增加吸入氣體溫度和溼度的主要部位。鼻腔橫截面積大，有鼻甲構成多個褶皺，吸入氣流進入鼻腔後即可擴布而與鼻粘膜表面有最大的接觸，有利於有效地吸收其溫度和溼度。 口腔、咽腔對吸入氣也有一定的溫化和溼化作用，但其效能遠不及鼻腔。
二、阻擋空氣中的可吸入顆粒物及有害氣體
1、阻擋空氣中的可吸入顆粒物：空氣中懸浮有大量微粒(包括細菌、孢子、花粉、煙塵等)，其中直徑>10μm的微粒在吸入時幾乎完全被鼻毛阻擋，直徑≤10μm的微粒進入氣道主要隨其大小、輕重的差異，通過慣性衝撞、引力沉積或擴散作用而粘附在不同水平的氣道粘膜上。氣流速度、有無渦流、是否張口呼吸、呼吸頻率和深度，以及微粒的形態和親水性也都是影響微粒沉積的因素。其中我們平常說的PM2.5即直徑≤2.5μm微粒，可以直接進入到我們肺的最小的氣道里，這種顆粒難以排除，常年日積月累會導致我們肺部出現問題，這點值得我們廣大群眾關注。
2、攔截有害氣體的吸入：對於吸入空氣中的水溶性的低濃度氣體(如二氧化硫、氨、氯等)，幾乎能被上呼吸道全部吸收而防止其對下呼吸道的損傷作用。而低溶解度的臭氧、氮氧化合物等則可以長驅直入，被吸至呼吸性細支氣管和肺泡部位而引起閉塞性支氣管炎和(或)肺水腫。
三、氣道表面的淨化
傳導性氣道起自上呼吸道，止於下呼吸道仲末細支氣管，表面覆有粘液層和粘液纖毛運輸系統。微粒被吸入分佈到鼻腔後部2/3，以及沉積到從喉到終末細支氣管之間者，均由粘液纖毛運輸系統清除。位於下鼻道前端者，由粘液帶到前方鼻孔內，然後呼出和清除。而到達鼻咽部及部分氣管、支氣管的微粒常被運輸到口咽部被咳出或嚥下。呼吸道的粘液纖毛運輸系統是呼吸道自身防禦清潔體系的重要組成部分，具有十分重要的意義。
四、反射性保護功能
傳導性氣道的反射性保護作用，包括咳嗽、噴嚏、支氣管收縮、呼吸暫停等。具有避免過量分泌物或異物吸入鼻腔和氣道內的作用;還有咽反射的噁心、嘔吐，可以防止食物或胃酸反流吸入到肺組織內的作用，是呼吸系統防禦機制的一個重要方面。其優點是能使機體對有害刺激做出迅速或即刻的反應，從而防止或避免這些刺激因素對機體的損害甚至致命的影響。
五、肺泡的防禦功能
1、對異物的防禦性清除作用。肺表面活性物質在肺防禦機制中的作用，除能降低表面張力，增高肺的順應性外，還具有多種防禦保護功能。肺泡上皮的防禦作用，肺泡上皮細胞彼此緊密連接，形成一道物理屏障，可防止塵粒等有害物質穿透到組織內。肺淋巴系統和肺毛細血管床的過濾作用。2、抑菌和滅菌作用。3、選擇性滲透作用。
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