自3月23日開始，所有目的地為北京的國際始發客運航班均需從天津、石家莊、太原、上海等12個指定的第一入境點入境，海關總署統一部署各地海關全力做好口岸檢疫工作，依法防控境外疫情輸入。
這12個第一入境點分別為：天津、石家莊、太原、呼和浩特、上海浦東、濟南、青島、南京、瀋陽、大連、鄭州、西安。海關總署在全國範圍內緊急調配專業人員支援12個相關海關，同時要求海關與地方聯防聯控機制密切溝通，全力做好應對準備。
此外，海關總署派出專家組赴相關海關進行現場指導，協助制定應急預案，規範工作流程，並通過視頻連線進行遠程技術指導，聯合專家共同做好現場處置。
在上海浦東機場，海關人員由原來的500人增加到了1339人，24小時不間斷運作，對所有來自或途經重點國家和地區的入境來滬人員實行100%隔離，對所有來自非重點國家和地區的入境來滬人員實施100%新冠病毒核酸檢測。
上海浦東機場海關口岸疫情防控工作現場指揮部副總指揮長 王慧峰：對登臨檢疫、體溫監測等環節查發的有發熱等症狀的入境人員，同步開展醫學排查，並立即安排 120車輛轉運至指定醫療機構診療。
據瞭解，截至3月25日零時，天津、呼和浩特、石家莊、太原、瀋陽、上海、大連、青島、鄭州、西安等10個海關共對38架次航班嚴格開展“三查三排一轉運”，加強流行病學調查，對發現的確診病例、疑似病例、有症狀人員和密切接觸者等“四類人員”全部按照地方聯防聯控機制的要求妥善處置。檢疫符合登機條件的旅客可搭乘原航班入京，腹艙所帶貨物在北京清關。