翔太、敦也、辛平是三個誤入歧途的年輕人，在一個晚上偷盜的車子在逃跑的路上壞掉了，不得已只好在一間廢棄的雜貨店藏身。卻收到了過去的人們煩惱的諮詢，故事由此開始。(按照書上的順序寫，不按照時間順序)
一、愛情與夢想
月兔靜子是一個運動員，因成績不錯入圍了明年奧運會比賽的候選名單，月兔有一個深愛的男友不幸得了癌症，只剩下半年左右的時間，月兔想放棄比賽陪伴男友，可是男友最大的夢想是她參加奧運會，月兔不知道如何是好，每天在迷茫中度過，雖然還在訓練，注意力無法集中，成績也得不到提高。從來自未來小偷三人組的回信中(當然，她不知道信來自未來)知道了自己真正想要什麼，做出了選擇，全心投入訓練，男友也因此而感到高興，雖然男友最後還是去世了，但是沒有留下遺憾。
二、夢想與父母
松岡克朗從中學時就對音樂感興趣，為了實現做職業歌手的目標，不惜從大學退學，父母對比雖然非常無奈，非常痛心，表示不理解，可是內心還是很支持兒子，不想因為自己而耽擱兒子實現夢想。但松岡克朗現在的狀態是無人賞識，前途渺茫，所以很是迷茫，不知道是應該回家繼承魚店，照顧年邁的父母，還是繼續堅持看不到未來的夢想。於是化名魚店藝術家寫信給雜貨店請教。(在雜貨店周圍遇到月兔，使第一章和第二章串聯起來) 最終得到了，“你對音樂的執著追求，絕不是白白付出。我相信，將會有人因為你的歌而得到救贖。你創作的音樂也必將流傳下去。若要問我為何能如此斷言，我也很難回答，但這的確是事實。請你始終堅信這一點，堅信到生命最後一刻。 ” 這樣的回答。松岡克朗聽取了建議繼續追求音樂夢想。後來在丸光園做慰問演出的時候遇到一個對音樂很有天賦的小芹姑娘，特別喜歡他的原創歌曲。丸光園發生了火災，松岡克朗為了救小芹的弟弟不幸去世，小芹成了天才女歌手，松岡克朗的原創做成了她的成名作，在每場演唱會必唱。松岡克朗的音樂得到了留傳。
三、在思域車裡等到天亮
貴之的母親因心臟病離開人世後，父親浪矢整個人都跨了，後幹起了煩惱諮詢的工作，而精神煥發。綠川向雜貨店諮詢，她懷了一個有夫之婦的孩子，想把孩子生下來。浪矢給出來建議，後來在報道上看到綠川開車墜河的消息，因此懷疑自己的諮詢是否正確，因此關店。想要知道自己的諮詢對那些人有什麼影響。拜託自己的兒子在自己三十三週年的忌日快到到來時，通過某種方式。將某月某日(浪矢去世的日期)，凌晨零時零分到黎明這段時間，浪矢雜貨店的諮詢窗口將會復活，為此，想請教過去曾向雜貨店諮詢並得到回答的各位，當時的那封回信，對您的人生有何影響，可曾幫你的忙。收到來自未來的信，
1、百分小毛頭是那個想不學習不作弊拿到100分的孩子，後來成為了教師，因為對諮詢回答的靈活運用加深了自己做好教師的信心。
2、綠川的女兒表達感謝，能來到這個世界真好
(和小芹同在丸光園長大，後成為小芹經紀人)
3、收到小偷三人組的空白信並回信。
4、…………
貴之一年回來雜貨店遇到月兔靜子，貴之的孫子在浪矢三十三週年忌日發佈消息。
四、聽著披頭士默禱
浩介看到了雜貨店復活的消息，回到小鎮，來到了一個披頭士酒吧寫信。“思緒回到了四十年前。浩介生活在一個富裕的家庭，表哥去世後給表哥母親要了披頭士的全部唱片，經常叫班上的披頭士粉絲來家裡聽，後家道中落，披頭士也在這是解散。父親公司經營困難，要連夜逃跑逃債。化名保羅.列儂先生寫信給雜貨店諮詢，爸媽要連夜帶我逃跑，但我不想過四處逃命的生活。得到回信和父母一起面對困難。回答問題的是浪矢爺爺，後在與父母逃跑時在服務區跑掉，化名藤川博生活下去，被送到孤兒院丸光園。在丸光園喜歡上木雕。後被過繼到一個尋找繼承者的老闆家裡做學徒。丸光園失火去看望午飯藤晴美，去雜貨店轉遇到貴之。”
在披頭士酒吧寫回信，從店主口中得知了父母在逃亡中自殺的故事。父母為了讓逃跑的兒子安然生活，不背追債，設計了一場自殺。他撕掉了已經寫好的信，為了讓浪矢爺爺安心，寫自己和父母生活的很好的回信。
五、來自上天的祈禱
小偷三人組也是從小在丸光園長大，在走投無路的時候聽說藤晴美要把孤兒院改造為情人酒店，於是是她家偷盜，逃跑的時候車子壞掉來到雜貨藏身，這一天正好是浪矢爺爺去世三十三週忌日，諮詢口重新開啟的時間。這間屋子將過去和未來聯繫到一起，浪矢爺爺收到來自未來的信，小偷三人組收到了來自過去的信。小偷三人組收到的最後一封信是迷途的小狗問想靠陪酒生活回報養育自己的人，該如何說服周圍的人。小偷三人組一定程度告訴她未來的事，指導她如何投機。最終迷途的小狗獲得事業的成功。小偷三人組在搶來的包裡發現了藤晴美寫給雜貨店的感謝信，發現他們搶劫的藤晴美就是自己指導的迷途的小狗，然後對自己的所做所為感到後悔。又在牛奶箱發現了浪矢爺爺給自己空白信的回信。
“如果把來找我諮詢的人比喻成迷途的羔羊，通常他們手上都有地圖，卻沒有去看，或是不知道自己目前的位置。但我相信你不屬於這兩種情況。你的地圖是一張白紙，所以即使想決定目的地，也不知道路在哪裡。地圖是一張白紙，這當然很傷腦筋。任何人都會不知所措。可是換個角度來看，正因為是一張白紙，才可以隨心所欲地描繪地圖。一切全在你自己。對你來說，一切都是自由的，在你面前是無限的可能。這可是很棒的事啊。我衷心祈禱你可以相信自己，無悔地燃燒自己的人生。”
不同的章節又有不同的故事，東野圭吾又把不同的故事串聯起來，層層相扣，每一個人物之間又都有關係，看了三遍書，才勉強把時候和人物捋順，這樣東西自己看書的時候發掘才有意思，我就不寫出來了，雞湯故事寫的人太多了，看起來就沒意思了，東野圭吾通過這種手法寫出來，讓人沉迷於此不能自拔。
從幾歲的孩子到老人，每個人都會有煩惱。看到松岡克朗那一段的時候我就特別有感觸，現在我正在讀大學，那麼大學畢業後我該何去何從呢，是按照父母的意思回到小縣城找一個有編制的工作(連這個能力也沒有)，然後就這樣一輩子，還是在大城市打拼。留下年紀越來越大的父母在家。每當想到這些我都特別的煩，後來，我也就索性不想了，只有做到眼前的事，一步一步為未來打基礎，未來才會有讓你選擇的餘地。
浪矢爺爺說每一個諮詢的人他們都是內心破了個洞，重要的東西正從那個洞裡流失。我希望當我們內心出現那個洞的時候能及時補上，誰的人生都有煩惱，我願你的人生春風得意。
