《狼少年》這部電影主要講述的是狼人與人類之間的愛情故事。
電影的開頭是一位白髮蒼蒼的老奶奶接到一個電話問她是否要賣掉她鄉下的老房子，老奶奶接到這個電話後悵然若失，決定回到鄉下原來住的老房子看看，一段塵封47年的往事緩緩展開。
老奶奶名叫小金，47年前由於肺病和一些家庭原因，一家人搬到了鄉下的這間房子裡生活，吃過晚飯後，小金正準備睡覺，此時屋外卻傳來了異響，於是小金一個人順著聲音來到倉庫查看情況，結果在倉庫裡發現一個衣衫襤褸的怪物，小金害怕的尖叫，怪物也被嚇跑了。
第二天小金和媽媽在院子裡曬衣服，結果在角落裡發現了昨晚的怪物，小金喚來媽媽，媽媽很害怕本想趕走他，可是這個時候角落裡的怪物出來了，原來是一個長相清秀的男孩，男孩看上去很狼狽很餓，媽媽把剛煮好的土豆扔給他，男孩狼吞虎嚥起來，看起來就像一頭真正的人形野獸。媽媽報警想讓警察帶走他，帶警察也無法查明他的身份，無可奈何只能留下了這個男孩。媽媽給男孩洗了澡，換了新衣服，終於看起來像個正常人了，可是一到吃飯男孩又會變成野獸一般的狀態，狼吞虎嚥，而且男孩還有一些奇怪的習慣，比如每到晚上男孩看到月亮就會發出狼嚎。
日子就這樣一天天過去，剛開始小金還很不習慣這個陌生人的到來，甚至是很牴觸，但接觸久了後才發現雖然男孩行為有的時候很怪異，但本性善良單純，有的時候還會幫小金幹活，慢慢的小金也喜歡上了這個單純的大男孩。
這天一個渣男來到家中企圖欺負小金，男孩像個守護主人的忠犬一般，把渣男趕跑了，小金突發奇想，決定從今天開始訓練男孩，讓他迴歸正常人生活，併為他取名哲秀。
小金照著寵物訓練書籍開始訓練哲秀……一段時間後小金的訓練終於有了成效，哲秀吃飯的時候再也不狼吞虎嚥，一切全部聽從小金的指令，小金讓他吃才能吃，讓他坐就坐……慢慢的小金還教會了男孩刷牙，洗臉，繫鞋帶等生活基本技能，兩個人的關係也越來越好。
這天媽媽帶著一家人去集市採購，路過一個正在裝修的房子的時候，裝修的鐵板突然掉了下來，而小金就在鐵板下方，正當小金還在原地發愣的時候，哲秀衝了過去，一把將小金攔在懷裡，鐵塊重重的砸在了哲秀的身上，正當眾人都覺得出大事的時候，哲秀卻一點事也沒有……慢慢的哲秀融入了這個家庭，大家在夕陽下一起踢球玩耍，一起吃飯，一切都是那麼的美好。
一天晚上喝醉了酒的渣男，又來到了小金的家裡，企圖對強暴小金，這一幕被哲秀看到了，哲秀無比憤怒，就在這是令人意想不到的一幕出現了，哲秀暴起化身狼人，閃電般的衝過去一把按住渣男，正準備將渣男撕碎的時候，小金及時喊住了哲秀，沒有讓哲秀犯下打錯，此時的渣男也被嚇慘了，脫身後灰溜溜的離去了。哲秀也慢慢恢復了正常的樣子。
第二天渣男報警帶著警察來到小金家，準備逮捕哲秀，可是沒人相信渣男的鬼話，小金也向警察隱瞞了哲秀的情況。
又一天，小金帶著哲秀去到山上看日落，突然小金肺病發作，昏厥了過去，哲秀十分擔心，抱起小金四處找人幫忙，但是沒找到任何能幫忙的人……第二天家人四處尋找小金和哲秀，終於在樹林深處找到了他們，大家誤解了哲秀，開始認為哲秀很危險，最後在家中把哲秀給關了起來。而此時渣男找到一份資料，資料上表明之前有一個博士在研究如何把人變成狼人，利用在戰爭中，讓他們成為恐怖的戰爭機器，而哲秀就是試驗品。
後來渣男通知了軍方，軍方於是派人來查看情況，但由於哲秀目前表現還算穩定，所以也不好採取什麼措施。
這天小金要去城裡查看病情，一家人陪著去了，只留下哲秀一個人在家。渣男開車路過的時候不小心撞壞了附近大叔家的羊圈，並且撞死了一頭羊，然後自以為沒人發現就溜走了，隨後渣男找到警察誣陷哲秀又變成狼人並且生吃活羊。晚上大叔找到渣男，告訴渣男自己看到了一切情況，希望他不要在誣陷哲秀了，渣男惱羞成怒殺了大叔，並把一切栽贓給哲秀，哲秀也被軍方給誤會成了危險份子，並且準備開槍射殺哲秀，就在這時，小金不顧一切的攔在了哲秀身前 企圖阻止他們，大家看到這一情況也暫時停止了行動，可是渣男怎麼會放過這個機會，一把奪過槍想要射殺哲秀，於是小金和渣男扭打在了一起，此時的哲秀看到小金在受傷害，再也無法控制自己，暴怒的變為了狼人，迎著子彈衝了過去，直接當場把渣男咬死了。此時所有人都看到了哲秀變為狼人的過程，確定了哲秀極其危險，準備殺死哲秀。但此時哲秀心裡只有小金，一把抱起小金就消失在了山裡。
第二天，小金醒來，小金知道哲秀再也不能跟著自己了，因為哲秀被發現後只有死路一條，她讓哲秀快跑，但哲秀始終不願離開，此時搜救人員越來越靠近，小金沒有辦法，只好假裝自己非常討厭哲秀，哭著罵哲秀，打哲秀，從沒說過話的哲秀此時終於說出了第一句話“不要走”，小金此時心裡無比難過，十分的不捨……但還是沒有辦法，哭著轉身離去了。
大家找到小金後，詢問哲秀的去向，但小金什麼也不肯說，回到家後一家人經歷了這一切後也準備搬離這裡，臨走前，小金在倉庫裡留下了一張紙條，讓哲秀在這裡等她回來，可是沒想到這一走便是47年……
此時的小金已經是一個風燭殘年的老人了，這些年小金已經結婚生子，家庭美滿，晚上小金來到倉庫，這是當初與哲秀第一次見面的地方，小金推開倉庫的門，眼前的一幕讓她淚如雨下，哲秀就這樣安靜的坐在那裡，原來哲秀看到紙條後就一直留在這裡等著她，這一等就是47年……
