儿童癫痫可选择药物和外科手术、神经调控等方式来治疗。70-80%患者经过正规系统的药物治疗能够控制症状，20-30%的患者经过上述治疗后没有改善，成为顽固性癫痫，此类患者应用手术治疗。
癫痫的治疗方法包括药物、手术。无明确病因的癫痫首选药物治疗，对于有明确病因引起的癫痫，如局灶皮质发不良，脑颜面血管瘤病，建议早期手术治疗，此类继发性癫痫，自愈可能性极低，早期手术治疗后脑功能可进一步代偿发育。
药物治疗癫痫有利也有弊，主要是对脑功能的影响及药物对身体发育影响的衡量，对于发作频繁、程度严重的病人建议药物治疗，对于发作频率低，且多为夜间发作的良性癫痫可慎重考虑应用药物。
部分儿童癫痫为良性癫痫，如热性惊厥、良性儿童肌阵挛、BECT、大部分儿童失神癫痫等，随着年龄增长可自愈;部分继发儿童癫痫：如局灶皮质发不良，脑颜面血管瘤病，部分结节硬化等可手术治愈。
有些人对大发作相对较重视，而对小发作或局限性发作不太重视，事实上，每一种发作都是大脑神经细胞异常放电，都会对脑神经细胞造成损伤，因此，不论哪一种发作均应及时治疗。
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