A-6E1972年服役，1992年總計生產230架，並將A型大量改為E型，是A-6主要的型號。1970年11月10日首次試飛，1972年12月正式服役，1991年停產，共生產205架。A-6E仍裝J52-P-8A渦噴發動機，主要改進在於機載電子設備。機上裝有AN/APQ-148多功能雷達，能同時進行地形測繪和對固定或活動目標進行跟蹤和測距，具有地形跟蹤能力。AN/ASQ-133晶體管數字計算機及接口裝置(數字/模擬和模擬/數字轉換裝置)，能與雷達導航、慣性導航和多普勒導航設備、通信裝置和自動飛行控制系統配合工作。裝有新型武器投放控制裝置(ACU)。A-6E電子設備中的攻擊導航裝置的主要改進是：擴大了AN/AVA-1顯示器功能；採用AN/APQ-148多功能雷達、AN/ASQ-133彈道計算機和CP-1005/A大氣數據計算機。並裝備有AN/AWG-21導彈控制系統。70年代中期，為了提高A-6E攻擊機的作戰能力，在其綜合攻擊導航系統(IANS)中增加了AN/AAS-33光電傳感器組合，改用AN/ASQ-155彈道計算機和AN/APQ-156多功能雷達，並重新設計了武器控制系統。這種飛機編號為A-6E/TRAM，第1架飛機(155673)於1974年3月22日首次試飛。裝備AN/ASQ-155計算機和AN/APQ-156雷達的A-6E TRAM／DRS型飛機於1979年10月14日開始裝備部隊。
1974年在A-6E機首下方加裝AN/ASS-33TRAM(目標識別攻擊複合感應器)，並改造為A-6E/TRAM型。該裝置和多功能雷達結合在一起，能使飛機在惡劣氣象條件下和寬廣的目標區內的探測、識別和攻擊目標的能力得到改善，從而提高攻擊精度。TRAM是由FLIR(紅外線前視裝置)、雷達系統及照射裝置組成，外觀呈球形。1990年換裝波音公司製造的複合材料主翼，增強了外掛力，改裝了J52-P408發動機，機上主要武器包括AGM-65空對地導彈、AGM-84E對地導彈、AGM-88“哈姆”(HARM)反輻射導彈、ALM-9L/M空對空導彈。1974年10月首飛，裝備全套改進設備的飛機於1978年12月開始交付。到1988年，所有的老式A-6E全部改裝成了A-6E/TRAM型.
A-6攻擊機共有5個外部武器掛架：機身下1個，左右機翼下各2個。最初機翼下的掛架使用Aero-27A彈射炸彈架，每個掛架的掛載能力是1588kg(3500lb)；機身下掛架使用Aero-27B彈射炸彈架，最大掛載能力是1633kg(3600lb)。後來機翼下的掛架也改裝使用Aero-27B，5個掛架的最大掛載能力是8165kg(18000lb)。機身下中央掛架主要用於掛載1135L副油箱，也可以使用Aero-27B彈射炸彈架掛載武器。
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