根據牛頓在1704年的一封書信上的記載，他解釋在公元800年神聖羅馬帝國的查理曼大帝之後的1260年，就是世界的末日。
報道稱，伊薩克·牛頓是近代科學家中最傑出的代表人物，被譽為“現代科學之父”。然而，就是這樣一位被一隻蘋果砸中腦袋就悟出地心引力的科學天才，竟將後半生的寶貴時間全部花費在神學上，研究起所謂的《聖經密碼》來。不過，由於大多數牛頓神學手稿都在上世紀30年代的一個拍賣會上被一位名叫亞伯拉罕· 雅胡達的神秘收藏家買走，這些手稿後來的下落一直不為世人所知，因此後世科學家也根本無從知道牛頓窮半生之力，到底在手稿上算出了些什麼。
直到日前，耶路 撒冷希伯萊民族博物館的研究人員竟然在館藏中發現了這些塵封的牛頓手稿，在數千頁寫得密密麻麻的紙上，研究人員看到牛頓嘗試用複雜的公式破譯所謂“聖經密碼”，並試圖計算宇宙的“末日”時期。
讓研究人員目瞪口呆的是，這位嚴謹的科學家在複雜枯燥的算式最後，竟在一張字跡潦草的紙上將世界末日定於2060年！
手稿上，牛頓預言世界末日的到來 將伴隨著瘟疫和戰爭的爆發，並預言聖人到時將再次降臨地球，他自己可能也將成為聖人之一。研究人員由此認為，晚年的牛頓對神學的痴迷程度顯然已“病入膏肓”了。
隨著牛頓手稿“驚人內容”的披露，一部有關加拿大學者研究牛頓生平的紀錄片《牛頓：黑色異教徒》也將在英國播出，英國再次掀起一股“牛頓熱”。
據他們稱，通過一定的跳躍序列選擇出聖經中的字母，然後再拼成新的單詞，他們竟然從中拚出了“希特勒”、“大屠殺”;“畢加索”、“藝術家”;“愛因斯坦”、“絕頂聰明的人”等詞語，並稱還從中發現了諸如“拉賓被暗殺”等預言。這篇論文發表 之後，引起了全世界學者的爭議，包括美國前國防部解碼專家哈羅德·蓋恩斯教授在內的多名研究者都對此提出了質疑。
反對論學者認為伊利雅胡·瑞普斯所研究的聖經原文已經跟古抄本有一定的差別，包括句點和字距等都不一樣，瑞普斯用計算機算出的所謂“聖經密碼”，只不過是一種斷章取義的“撞大運”罷了。整本聖經希伯萊文有30多萬個字母，起碼可以發生100億種字母組合，若按自己的意思隨便斷字，相信還會找到更多五花八門的東西，如果有朝一日“聖經密碼”研究者從聖經中找到諸如戴安娜去世、Windows2000問世的預言，他們也一點不會感到驚訝。
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