在內丹築基階段，主要是補足人體生理機能的虧損，在治病強體的同時，初步打通“任督二脈”和“三關”的徑路，初步達到意通、氣通、熱感通、全身經絡通的效果，為煉丹運藥打好身體的基礎，作好身心準備。
實際上，在沒有達到精滿、氣足、神旺的條件之前，一切為祛病、健身而採用的修行療法，都屬於內丹築基的入手功夫。
需要指出，今日用於醫療的各家氣功，多由內丹築基階段的修煉方法演化而來，然而氣功師的“小周天氣功”、“大周天氣功”，與內丹中“小周天”、“大周天”的修煉方法根本不同。因為氣功師所謂“通任督”、“過三關”，僅為用意念引導後天之“氣”循環而言，玄關未開，尚無藥物、火候、鼎器可言，用意念引氣貫通任督循環，俗稱“轉軲轆”。
張伯瑞《悟真篇》中說：“咽津納氣是人行，有藥方能造化生。鼎內若無真種子，猶將水火煮空鐺”。說明築基時用氣通任督和內丹養生“轉河車”做了區分。至於氣功師的“大周天”，是進一步將氣運通下肢，使氣感遍行全身，和內丹的“大周天”煉精化炁，煉炁化神不是一回事，仍屬於築基階段的後天氣功。
內丹修行煉精化炁階段，先要入室靜坐，調身、調心、調息、，止念守竅，做到松、靜、自然，心息相依,這和練氣功的要求大致相同。
內丹養生修煉以煉精為初關，從人的性功能煉起，因此在築基階段要先補精，健全人的性功能。精是丹功的基礎，保精固腎，為築基第一要務，其方法就是以舌頂住上顎的天池穴，促成口內產生津液，用咽津補精固精的方法來築基。
如老年人精枯陽痿不舉，則又須用敲竹喚龜（女用鼓琴引鳳）之法將真陽喚起，這就叫用“添油接命”之法促成真陽產生，真陽萌動了，才能用“玄關法”採藥修補漏體，在性功能達到正常人的情況下，才可以進行內丹功法的修煉。
補精生精，陰蹺一脈，甚為重要，其竅就是會陰穴向內，亦有三岔口、上天梯、河車路、海底、危虛穴、生死穴等異名。陰蹺上通天谷，下達湧泉，真陽出生之時，必然從此穴竅經過，乃生藥、採藥之處，有調節腎功能和內分泌的作用。
內丹家認為“精”是人生命之本，是一個人有沒有青春活力，其生理指標就在於是否性功能健全，而恢復人的青春，使老者還少，白髮還黑，齒落更生，這恰恰就是內丹養生學追求的目標，無論何派內丹功法，都不例外。
精、氣、神是維持人生命的三寶，築基功夫就是要補足三寶，使人精滿、氣足、神旺，達到三全。精滿現於牙齒，氣足現於聲音，神旺現於雙眼，築基完成後，牙齒健全，聲音洪亮，二目有光，說明人的生命力旺盛，直至寒暑不侵才算陰精牢固，便可修煉內丹。
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