3月18日，據南方都市報報道，
深圳灣口岸已設置分流站，對所有入境人員實行分流入境，如需被隔離，遊客根據不同目的地去向，由政府安排專車進行轉運。近日，有網友爆料深圳灣口岸入境人數激增，數萬人繞道香港轉深圳入境，因"深圳還沒有歸國隔離14天的強制要求"。對此，南方都市報記者向深圳海關新聞部門進行了諮詢，得到的回應是"此事並不屬實"。但就目前情況，深圳灣口岸確實沒有實行強制入境人員統一隔離政策。
3月17日下午，深圳入境大廳外，陸陸續續有旅客三三兩兩地從入境通道走出，現場人流稀疏，且井然有序。入境廳外面已經設置了分流站，分流站裡滯留的旅客也不多，大約有30名穿防護服的工作人員在忙碌著，他們負責對入境旅客進行分流。
剛剛入境的黃女士告訴南方都市報記者，口岸裡面有不少旅客在排隊通關，因為要等候防疫檢測，她通關大概花了3個小時左右，但通關過程比較順暢，旅客都很遵守秩序。
據深圳灣口岸海關工作人員鄭茜介紹，口岸內採用紅外線測溫和手持測溫儀的雙重測溫設施，目前已全面啟動健康申報制度，對所有出入境人員嚴格實施"三查、三排、一轉運"檢疫措施。"三查"，即查驗健康申報、開展體溫篩查、實施醫學巡查；"三排"，即開展流行病學排查、醫學排查和實驗室檢測排查。"一轉運"，即海關關員對"三排"當中判定的確診病例、疑似病例、有症狀人員、密切接觸者四類人員一律按照有關規定落實轉運、隔離、留觀等防控措施。
據深圳市衛健委3月17日消息，深圳灣口岸將所有入境人員的分流入境，分為三類進行：一是如出現發熱咳嗽等症狀或密切接觸者等人員將在工作人員協助下，做好防護措施後由120急救車送往醫院，實現入境後境內零接觸；二是持香港證件的人員在確認過往14天沒有國外旅居史且無症狀將直接通關；三是持護照的旅客則在入境廳通過專門人員指引，進行更細緻地快速分流。
在口岸處設置了深圳十一個區的分流處及大巴車，所有持護照的入境人員，工作人員按照他們的居住地，進行統一分流並將對他們進行集中隔離以及核酸檢測等防疫工作。
深圳市南山區應急管理局局長李昭志介紹，針對省內的兄弟城市入境人員，先將他們接到中轉的酒店採樣，採完樣後與目的地指揮部聯繫，派專車把人員接回目的地。核酸檢測結果隨後也會通過衛健系統發到他的所在地。針對入境省外人員，將其安置後進行核酸檢測，無異常情況再送至所需公共交通站點。
3月17日，深圳確診2例境外輸入新冠肺炎病例，自2月22日以來，深圳共新增8例新冠肺炎病例，均為境外輸入。截至3月18日18時，深圳累計報告"新冠肺炎"病例425例。
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