楊光先那篇充滿火藥味的《請誅邪教疏》引起了熬拜等人的高度重視，立案工作效率自然很高。就在楊光先到禮部投訴的9天后，康熙三年八月初五日（1664年9月24日）以皇帝的名義下發的指示就到了禮部，要求他們會同吏部審訊湯若望。
康熙三年八月初七日（1664年9月26日），這場審案大戲在禮部拉開大幕。參演人員除楊、湯兩位主角外，禮、吏、兵、刑、三法司等衙門，以及議政王、貝勒、大臣、九卿、科、道等官員。
在審理過程中，湯若望、楊光先多次在法庭上交鋒，楊光先從天文、曆法、地理、宗教等方面對湯若望進行批駁，湯若望則竭盡全力進行辯解。
控辯雙方首先就曆書應該推算多少年，展開交鋒。
楊光先：新編的歷書只有200年，這就是不忠!大清朝萬壽無疆。你編曆書至少也要推算萬年才行，弄個只有200年的歷書，這不是詛咒大清短命嗎！
湯若望：按新法編曆書，可以無窮無盡地推算下去。之所以分為前二百年曆書，後二百年曆書，只是為了方便而已。
楊光先：湯若望敢於在頒行天下的《時憲曆》封面上特意寫上“依西洋新法”五字，就是出賣主權呀！這分明是讓天下萬國都知道大清朝是以西洋為正統呀！
湯若望：這是掌印官員的事，不是我的意思。
後來就進入了學術辯論階段。楊、湯二人就“一天應該劃分為100個還是96個時刻、順治十八年應該閏七月還是十月、春分秋分冬至夏至之間的間隔要不要一樣、太陽運行是否是勻速等學術問題，進行了激烈的爭辯。
他們滿嘴的“節氣”、“中氣”、“交宮”、“宮宿”，“中星”、“紫氣”、“起管”等一大堆術語，估計那些審案的官員肯定都聽暈菜了。這咱就不說了，因為我也暈了。
他們的學術爭論還涉及了一個非常敏感的問題：榮親王葬期的選擇是否有問題。
楊光先指責湯若望用洪範五行的方法不對，因而年犯三殺，月犯生殺，日犯黨殺，時犯伏吟，四柱無一吉者。強調洪範五行又名滅蠻經。湯若望用這方法，也是居心不良。
以上這些玄之又玄的東西，審案人員聽得糊裡八塗，但他們關於地球的爭論，可能大家卻聽明白了。這要歸功於楊光先的引導。
楊光先：天主教能夠在中國傳播，主要是靠推行西洋新法，而新法的病根就在地圖。湯若望刻印的地圖把大地畫成一個大圓球，簡直是太可笑了吧！
如果世界各國都在一個大圓球上，那豈不是 “球上土人之腳心，與球下國土人之腳心相對”嗎？“夫人頂天立地，未聞有橫立倒立之人”，天下只有蠅蟲之類的東西才能橫立倒立。
又說，我們都只能站立在樓板之上，你湯若望如果能倒立在樓板之下，我才能相信有和我們腳足心相對的國家。他又說，水是天下最平的，不平則流，“果大地如圓球，則四旁與在下國土窪處之海水，不知何故得以不傾？”難道有“圓水、壁立之水、浮於上而不下滴之水？”
他又比喻滿盂之水說，“若望能側其盂而水不瀉，覆其盂而水不傾，予則信大地有在旁在下之國土”。不然，“則大地以水為平，而無似球之事”。
他說，天和地“如二碗之合，上虛空而下盛水，水之中置塊土焉。平者為大地，高者為山嶽，低者為百川，載土之水，即東西南北四大海。”
楊光先這一通高論說得審案官員點頭稱是，卻弄得湯若望滿頭大汗。他沒有快速洗腦的本事，真恨不得把哥白尼、麥哲倫等老鄉拉來幫忙，替他把事說明白。此時他一定很後悔，當初咋就沒有找機會建議順治帝舉辦幾期高級官員學習班，給大老爺們搞搞科學普及呢。
看來，豈止是秀才遇到兵有理有說不清，洋秀才遇到土秀才也照樣說不明白。
同湯若望有理說不清一樣苦惱的是，還有那群審案官員。不知他們沒本事沒魄力，要是平時處理下級官員之間的糾份，早就跟玩似的分出輸贏來了。可眼前這樁案件涉及皇家、關係朝廷，到底咋斷，他們根本說了不算。最後還得看熬拜的眼色。
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