為保持牛場的衛生，消毒是牛場防疫工作的重要環節，定期消毒主要是為了消滅散播於牛舍內空氣中以及附著於牆壁地面上的病原體微生物，並且切斷傳播途徑，以達到保護人畜健康的目。因此定期對環境、牛舍、地面土壤、糞便、汙水等進行消毒是非常有必要的。
消毒的方法主要分為以下幾類：①機械性消毒法主要是通過清掃、洗刷、通風、過濾等機 械方法消除病原體。這是一種普通而又常用的方法，但不能達到徹 底消毒的目的，作為一種輔助方法，須與其他消毒方法配合進行。②物理消毒法亦即採用陽光、紫外線、乾燥、高溫等方 法，殺滅細菌和病毒。③化學消毒法即採用化學藥物殺滅病原體的方法，在防疫 工作中最為常用。選用消毒藥應考慮殺菌譜廣、有效濃度低、作用 快、效果好；對人、畜無害，性質穩定，易溶於水，不易受有機物 和其他理化因素影響；使用方便，價格低廉；無味、無臭、不損壞 被消毒物品；使用後殘留量少或副作用小等。④生物消毒法在獸醫防疫實踐中，常用該法將被汙染的糞 便堆積發酵，利用嗜熱細菌繁殖時產生高達70度以上的熱，經過 1〜2個月可將病毒、細菌（芽孢除外）、寄生蟲卵等病原體殺死， 既達到消毒的目的，又保持了肥效。下面給大傢俱體來說明一下。
①牛舍周圍環境消毒
牛舍周圍環境定期用2%火鹼或撒些生石灰消毒，周圍及場內汙染池、排糞坑、下水道出口，每月用漂白粉消毒1次。
②牛舍消毒
牛場內和牛場的門口均應設消毒池，放置火鹼水或生石灰等消毒藥物，出入的車輛、器具、人員等消毒後才能出入。對牛經常活動的地面一般情況下，消毒每週1次，每年再進行2次大消毒。消毒可用1:1800～3000的百毒殺。對病牛舍和隔離舍，在其出口處應放置有消毒液的麻袋片或草墊；消毒液可用2%～4%氫氧化鈉、1%菌毒敵（對病毒性疾病），或用10%克遼林溶液（對其他疾病）。有疫情時增加消毒次數，場內禁止存放垃圾，對死牛必須經獸醫檢查後再做無害化處理。
③地面消毒
土壤表面可用10%漂白粉溶液、4%福爾馬林或10%氫氧化鈉溶液。停放過芽孢桿菌所致傳染病（如炭疽）病牛屍體的場所，應嚴格加以消毒，首先用上述漂白粉噴灑地面，然後將表層土壤掘起30釐米左右，撒上幹漂白粉，並與土混合，將此表土妥善運出掩埋。
④糞便消毒
牛場的糞便多采用生物熱消毒法，即在牛場100～200米外的地方設一堆糞場，將牛糞堆積起來，上面覆蓋10釐米厚的沙土，堆放發酵1～3個月左右，即可用作肥料。
⑤汙水消毒
將汙水引入處理池，加入化學藥品（如漂白粉或其他氯製劑）進行消毒，用量視汙水量而定，一般一升汙水用2～5克漂白粉。
⑥飼管用具及防疫器械的消毒
牛舍內的器具、飲水槽、食槽要每日清掃沖刷1次。經常性地用0.5%的過氧乙酸噴灑消毒飼槽、水槽等。對於防疫器械應放在開水中煮沸消毒。
⑦飼料和飲水的衛生檢測
嚴禁腐敗、發黴變質及噴過農藥的飼料飼草喂牛，也不能讓牛飲用被汙染的水。
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