一八五六年秋，洪秀全密诏韦昌辉、石达开、秦日纲带兵入天京诛杀杨秀清。
韦昌辉非常积极，立刻带兵三千，从江西回京，秦日纲从丹阳前线返回，会合韦昌辉。
七月二十六日夜，内应陈承瑢打开城门，迎接二人进城。城内的守卫大多是杨秀清控制的，但他们毫无警觉，韦昌辉立刻布置诛杨行动。不到两个时辰，他们就控制了各要害据点和通达东王府的街道。
二十七日凌晨，韦昌辉指挥诛杨大军突然发难，袭击东王府。东王府毫无防备，迅速被踏平，杨秀清也被韦昌辉斩杀。洪秀全闻讯，马上发谕，说杨秀清窃据神器，犯谋反罪，以此响应韦昌辉的诛杨行动。
韦昌辉屠完东王府后发现，有一部分东王府的人逃了，而且分布在城中其他地方的杨秀清余党还有很多，为了让自己没有后患，他想斩草除根。这时候，洪秀全也传令说韦昌辉杀人超出了指标，违背了只办首恶的方针。韦昌辉趁机想出一条苦肉计。
他和秦日纲放出风，说在天王的教育下，他俩认识到了错误，不该牵连东殿无辜人员，所以甘心受罚。两天后在广场受罚，给东殿无辜人员赔罪。同时，假借天王口谕，召杨秀清的部属前去观刑。
行刑那天，韦昌辉和秦日纲戏演得逼真，被打板子，连板子都打断了，围观的那杨秀清部属有五千余人，他们卸下了原有的防备，散场时被骗进指定的大房子，韦昌辉立刻指挥埋伏好的军队用枪炮轰射，顿时血流成河。接下来还满城搜捕，持续月余。
石达开本想躲开这事，让韦昌辉按照约定除掉首恶，但没想到韦昌辉完全被野心和私欲催化，局面失去了控制。情急之下，石达开只带了几个随从进京，劝说韦昌辉封刀，韦昌辉不满石达开当初耍滑头，一起奉召，他却躲在后面不来。另外，杨秀清死后，韦昌辉成了最大的实力派，而石达开对他有威胁，因此，干掉石达开，他就无人匹敌了。
石达开连夜缒城而逃，但他的翼王府复制了东王府的悲剧。韦昌辉指石达开为反贼，满城搜捕他，但他知道，这肯定得不到天王的应允，于是，他横下一条心，想把天王控制在手，这样想要什么样的圣旨就有什么样的圣旨，扣帽子、定罪、处决都会名正言顺。
石达开逃走的第二天，韦昌辉就带兵来到了天王府，说有人看到反贼石达开躲进了天王府，想进去搜捕，但被天王府的两千女卫士拦住了，洪秀全传出严令，问韦昌辉闯天王府有何居心，想作乱吗？石达开也不在天王府，已经出城了。韦昌辉听后，有些心虚起来，石达开出城了，也会学他带兵回京......
但他还是觉得，先把天王控制在手最关键。于是，他换了种方式，好言好语转呈天王，说既然石达开不在这里，为了防止他前来作乱，天王府需要增兵保护起来。随后开始包围天王府，洪秀全听后，大骂韦昌辉假心假意，保护天王府都是假的，不能任由他。
一阵僵持之后，天王府的卫士和韦昌辉的军队交火了，天王府的两千多卫士大都是由客家大脚妇女组成，她们很强悍，最后把韦昌辉的两三千军给打退了。
韦昌辉狼狈败回后，军心开始散乱，再加之石达开所率平乱大军逼近天京，韦昌辉更是惶惶不可终日。最后，天王说动秦日纲反正，让他率领所部和天王卫队一举击垮了韦昌辉的军队，活捉韦昌辉后，将之处以极刑。
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