雨水扑灭了澳大利亚各地肆虐的大火，但这并不意味着它们构成的威胁已经结束。
随着野火肆虐澳大利亚的土地和森林，到目前为止估计有10亿只陆生动物死亡，研究人员担心海洋和淡水物种将成为看不见的受害者。
根据澳大利亚环境与能源部(DEE)的数据，全国有超过1710万公顷的土地被烧毁，目前最严重的火灾发生在新南威尔士州和维多利亚州，这两个州位于澳大利亚的东南部。澳大利亚海洋保护协会(AMCS)的海洋活动家Adrian Meder说，这些火灾留下了大量烧焦的植物和大量的灰烬。
尽管澳大利亚正处于严重的干旱之中，但当降雨不可避免地回来时——在一些地区已经如此——这些有机物将涌入河流，流入沿海湖泊、河口、海草和海藻床。
一方面冲进海洋中的灰烬和淤泥会进入鱼鳃，另一方面阻挡海草和海藻床进行光合作用所需的阳光，有效地扼杀它们。“这本质上就像在整个系统上盖了一块遮光布，”资产管理公司的鲨鱼保护活动人士莱昂纳多·圭达(Leonardo Guida)说。
钾、磷和氮的泥浆也会使水中的藻类大量繁殖造成水体富营养化。藻类会消耗水中的氧气，使依赖氧气的物种窒息。
大火还烧毁了海岸附近的许多森林，破坏了过滤淤泥和过量营养物质的植物 。Meder解释说，生态系统已经适应了来自土地的低养分流。但是“这些火灾以前所未有的规模有效地清除了大片区域。”
许多商业水生物种，如平头鱼、笛鲷、对虾和各种贝类，开始在沿海湖泊、海草和海藻床中生活。研究人员说，这些沿海栖息地也是包括海马在内的物种的产卵区，它们的退化可能会波及整个更大的生态系统。
其中一些影响已经开始显现。迪伊说，在新南威尔士州南部和维多利亚州以及袋鼠岛，大火给渔业和水产养殖造成了问题。
当降雨在新南威尔士州中部海岸地区开始时，当地土地委员会达金荣的成员们设置了屏障，以阻止洪水从该地区的河流、湖泊和河口涌来的淤泥和灰水。据Darkinjung的高级土地管理官员Kelvin Johnson称，他们已经在附近的河流中发现了一些死鱼。约翰逊说，野火及其余波已经造成并可能继续造成文化破坏。
约翰逊说，虽然现在还不清楚火灾造成的损失程度，如果火灾损害了牡蛎、甲壳类动物、平头鱼或鲻鱼，这将标志着这些渔业文化传统的丧失。
为此，澳大利亚联邦政府宣布了一个5000万澳元(3500万美元)的恢复基金(它的20亿澳元丛林火灾基金的一部分)来恢复和保护被破坏的生态系统和野生动物。但圭达说，没有资金专门用于海洋和水域。迪伊指出，其中一些资金可能用于紧急干预措施，如控制水土流失，以阻止沉积物流入水生生态系统。
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