到了顺治十三年的时候，除了云历政治和郑成功依旧在抗清以外，清朝基本上已经完成了统一，过了一年以后，清朝就出兵派遣吴三桂进攻云贵地区，开始对于盘踞在云南的永历政权开始了讨伐，这场战争进行了两年以后，吴三桂攻克了云南，并且他一直对永历帝紧追不舍，当时永历帝带着文武百官朝着南下逃亡，第二年他进入了缅甸，开始了自己在缅甸逃亡的生活。
永历帝是南明朝的最后一位皇帝，他帝王之路也是非常的凄惨，在乱世中就注定了他一生中并不会太平，后来朝廷为了斩草除根，于是他就派吴三桂去镇守云南，并且还让他去剿灭永历帝，后来吴三桂在平定云南的局势以后，开始攻打缅甸，没过多久以后缅甸国王就擒拿了永历帝，随后缅甸皇帝对于永历政权进行了屠杀，当时的永历皇帝已经到了山穷水尽的地步，最后也被吴三桂擒拿。
永历帝在被吴三桂擒拿以后，虽然历史中并没有记载如何下令处决永历帝的记录，但是吴三桂一直坚持要处死永历帝是为什么，吴三桂其实也算明朝的大臣，但是为什么一直坚持要处死永历帝呢？
首先我们能确定的事情是康熙并没有下令处死永历帝，永历帝在死的时候，康熙还是个孩子，所以当时朝廷的事情都是由大臣协商决定的事情，其实就是代表了整个朝廷的意见，但是在史书中并没有明确记载吴三桂要处死永历皇帝的命令。
所以当时永历帝的死有两种原因，第一种可能就是因为朝廷为了斩草除根，所以下令将永历帝杀死，但是为了在历史中留下自己的名字，所以史书中故意没有记载这一条，第二种可能就是因为当时全国的政局已经定下来了，朝廷为了笼络人心，于是让过了永历帝，不过是什么情况，执行的人都是吴三桂。
在当时的情况来看，吴三桂在处置永历皇帝这件事情非常的坚决，就是一定要杀掉永历帝，所以他当时并没有在乎清朝廷是什么态度，最终吴三桂拒绝了将永历皇帝俘获到北京的建议，而是请朝廷在云南当地处死永历帝。
历史中在对待前朝的君主，为了博取名声，当朝的人都会将他软禁，但是吴三桂却出乎意料，选择了将永历帝斩首，其实也是为了向清朝表示自己已经完全脱离掉了明朝。
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