水產養殖中，微生態環境對養殖生物排洩物、殘餌的分解、轉化、水質因子的調節有重要作用。它的正常與否決定水質的優劣，進而影響水產動物的健康。芽孢桿菌由於其穩定性好、抗逆性強、存活率高等優點，對於它的研究和應用備受人們的關灃，本文針對芽孢桿菌在水產養殖作為飼料添加劑和在水質調節劑的應用機理進行綜述。
一、芽孢桿菌的結構
在生長後期能形成芽孢(內生孢子)的桿菌或球菌。芽孢是休眠體，不是繁殖體。絕人多數足一個菌體僅肜成一個芽孢。芽孢位於菌體內，山核心、皮層、芽孢殼和外壁組成。核心是芽孢的原生質休，內含DNA、RNA、可能與DNA相聯繫的特異芽孢蛋白質以及合成蛋白質和產生能量的系統。此外，還有大量的吡啶二羧酸鈣佈滿整個芽孢。皮層處於核心和芽孢殼之間，舍有豐富的肽聚糖。芽孢殼主要由蛋白質組成，此外，還有少量的碳水化合物和類脂類，可能還有大量的磷。最外層是外壁，其主要成分是蛋白質、一定量的葡萄糖和類脂。
二、芽孢桿菌的特性
(2)產生多種營養物質：芽孢桿菌能合成多種維生素，如尼克酸、葉酸、煙酸，維生素B1、B2、B6、B12等，促進機體對蛋白質的消化、吸收。凝結芽孢桿菌、芽孢乳桿菌等菌株能產生乳酸，可提高動物對鈣、磷、鐵的利用，促進維生素D的吸收。此外，芽孢桿菌在生長過程中能產生乙酸、丙酸、丁酸等揮發悱脂肪酸，這些酸類能夠降低動物腸道的pH值，有效抑制病原菌的生長，為乳酸菌的生長刨造條件，其巾，丙酸還能參與三羧酸循環，為動物新陳代謝提供能量。
（3)增強水產動物免疫機能：芽孢桿菌通過產生抗體和提高嗜菌作用等刺激免疫，激發體液免疫和細胞免疫，使動物免疫活性增強。
三、芽孢桿菌的作用機制
(4)清除有害物質：芽孢桿菌產生的氯基氧化酶及分解硫化氫的酶類，可降低血液及水體中氮氦、亞硝酸鹽、硫化氫的濃度，從而淨化水環境。
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