11號線自2016年6月28日開通2年多以來，客流增長迅猛，客流從開通日均約20萬上升到目前約40萬，增長1倍，最高客流已高達49.74萬。經過19次的運能提升，列車間隔由開通時的10分鐘，壓縮至目前高峰最小4分10秒，運輸能力提升幅度累計超過100%。
為優化乘客乘車體驗，深圳地鐵自2018年7月25日（週三）起實施11號線新運行圖。
新運行圖主要變化為：
進一步縮短市民候車時間，提高出行效率，具體時間段如下：
11號線工作日早高峰碧頭往福田方向行車間隔
11號線工作日早高峰福田往碧頭方向行車間隔
深圳地鐵11號線（機場線）是深圳地鐵運營中的七條線路之一，屬於城市軌道交通系統，身兼機場線和廣深城際軌道線路雙重任務，從福田中心樞紐到車公廟，然後轉向濱海大道的濱海醫院，從世界之窗後方經過在建的跨國集團總部基地，到南山前海灣，然後直通深圳機場，再到深莞邊界，由福田站至碧頭站，途經福田區、南山區、寶安區。
地鐵11號線列車採用超大的8節編組A型車，其中6節編組為普通車廂，2節為商務車廂，共設4個高架車站和5個高架區間。其中，碧海灣站到機場站運行區間位於寶安區濱海灘塗區及填海區，是全市軌道交通線網中唯一一段在海上運行的地鐵風景線，目光近處紅樹成林，碧波盪漾，不遠處沿江高速跨海段盡收眼底，仿如一條長龍橫躍海面，美不勝收，開啟了深圳乘坐地鐵看海的先河。
並且，11號線是目前國內一次性建成線路最長，速度最快的地鐵。
11號線加開夜班載客列車
為滿足機場夜間航班旅客的出行需求：自2016年12月25日起，深圳地鐵11號線在每天23:00正常運營結束後，將加開夜班載客列車，其中福田站末班車發車時間為23:30，碧頭站末班車發車時間為23:34，機場站末班車往福田方向發車時間為24:01，往碧頭方向發車時間為24:04。
由於其它線路運營時間不變，搭乘11號線夜班列車需要換乘的旅客請選擇其他（路面）交通工具，具體情況可諮詢車站工作人員。
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